裂解酵母菌的方法是將玻璃微珠和菌細(xì)胞一起渦旋振蕩進(jìn)行機(jī)械破碎,。此法充分利用玻璃微珠的快速轉(zhuǎn)動(dòng)撞擊酵母菌從而機(jī)械破碎裂解酵母細(xì)胞,。由此可見(jiàn),這是一種強(qiáng)有力的裂解方法,,但在裂解過(guò)程中又傳輸大量的能量,,導(dǎo)致樣本的變性。因此,,和哺乳動(dòng)物細(xì)胞的研究比較,,酵母菌的免疫沉淀試驗(yàn)并不是一個(gè)好的方法,特別是研究蛋白質(zhì)的性質(zhì)和結(jié)構(gòu)時(shí),,該方法是不可取的,。
1.準(zhǔn)備工作
由于免疫沉淀有多個(gè)步驟,且包括數(shù)小時(shí)孵育,,因此在實(shí)驗(yàn)開(kāi)始前必須安排好時(shí)間,,注意適當(dāng)利用過(guò)夜孵育的間隙。這將有助于決定何時(shí)開(kāi)始裂解細(xì)胞,。同時(shí)應(yīng)注意,,
酵母菌免疫沉淀的本底水平非常高,因此推薦進(jìn)行預(yù)處理和使用蛋白酶,。
2.所需溶液
PBS,,裂解緩沖液(含有蛋白酶抑制劑,置冰上預(yù)冷),,玻璃微珠(500umol/L,,冷藏)。
3.操作步驟
(1)4000g離心5min收集酵母菌,,去上清液,。重懸浮于PBS,離心,,棄去PBS,。
(2)將酵母團(tuán)再次懸浮于少量預(yù)冷的裂解液。通常用大約3倍體積的RIPA緩沖液(150mmol/L NaCl,、1%NP-40,、0.5%脫氧膽酸鈉、0.1%SDS和50mmol/L Tris,,pH8.0),。同時(shí)應(yīng)加入蛋白酶抑制劑,。置冰上。
(3)玻璃微珠(直徑500~mol/L),,用1mol/I鹽酸和裂解緩沖液分別洗滌2次。然后置于少量裂解緩沖液內(nèi),,413保存,。
(4)在重懸浮的酵母細(xì)胞內(nèi)加入等體積預(yù)冷的玻璃微珠。
(5)劇烈渦流振蕩30s,,重復(fù)操作直至大部分酵母細(xì)胞裂解,。
(6)將細(xì)胞裂解物連同玻璃微珠以10 000g離心5min。仔細(xì)吸取上清液盛于另一試管,,置冰上,。
此時(shí),上清液可以用于下一步預(yù)處理,。
4.常見(jiàn)問(wèn)題
該方法常見(jiàn)問(wèn)題是
蛋白質(zhì)抗原的變性,。解決方法是用某些能破壞細(xì)胞壁的酶處理酵母菌使其形成原生質(zhì)體,然后再用去污劑將其裂解,。這是一個(gè)有效的方法,,但酶的價(jià)格昂貴,限制了該方法常規(guī)應(yīng)用于大容量標(biāo)本的制備,。然而對(duì)于所研究的關(guān)鍵蛋白的精細(xì)分析,,仍不失為一個(gè)有效的方法。