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上海起發(fā)實(shí)驗(yàn)試劑有限公司

Phusion高保真聚合酶中的戰(zhàn)斗機(jī)

時間:2012-11-27閱讀:2761
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 如果PCR產(chǎn)物需要進(jìn)行后繼的克隆表達(dá)研究,需要進(jìn)行高保真度PCR以減少PCR過程中出錯而造成的點(diǎn)突變,,我們通常會選擇高保真DNA聚合酶,。一般的高保真DNA聚合酶因?yàn)楸旧淼男r?yàn)功能注定了效率低,產(chǎn)量低,,條帶弱,,時間慢。的高保真酶Pfu的效率大概只有Taq酶的1//5,。常有人感嘆“又貴又不好用(指產(chǎn)量低)”,!為了提率,有些公司又推出了混合酶,將Taq與帶校驗(yàn)功能的DNA聚合酶混合,,中庸的結(jié)果就是效率不如Taq酶,,保真度不如Pfu,一般就比Taq高3倍,,價格還不便宜,。

Finnzymes公司獨(dú)辟蹊徑,將雙鏈DNA結(jié)合蛋白(紫色)與一種新型的具有校對功能的類熱球菌酶(綠色)融合,,形成了一種*的高性能聚合酶——Phusion® DNA聚合酶,。這下,兩個問題都解決了,。

 


 
圖1. Phusion DNA聚合酶的*結(jié)構(gòu)

快人一步

由于這項*的融合技術(shù),,Phusion DNA聚合酶合成DNA的速度和準(zhǔn)確度是以往任何單一酶都難以企及,即使是zui復(fù)雜的模板,,也能準(zhǔn)確,、快速地完成反應(yīng)。與其他酶相比,,Phusion DNA聚合酶在每次與DNA的結(jié)合反應(yīng)中都能夠摻入更多的核苷酸,,其高處理能力大大縮短了延伸步驟的時間,進(jìn)而加快了整個反應(yīng)的進(jìn)行,。它的延伸速度是Pfu酶的10倍,,比Taq酶還要快一倍,達(dá)到15-30秒/kb,。如果你還想更快,,可以選擇Phusion® Flash快速高保真聚合酶,每kb 堿基的延伸時間僅為15 秒或更少,,反應(yīng)時間zui短,,酶的用量顯著低于其他常見的聚合酶。Phusion DNA聚合酶的高速度和率使得它能在zui短時間內(nèi)獲得大量產(chǎn)物,。

Finnzymes曾做過實(shí)驗(yàn),從Thermus sp.基因組文庫中隨機(jī)挑選16個克隆,,并用3種不同的耐熱DNA聚合酶進(jìn)行擴(kuò)增,。結(jié)果顯示,Phusion® DNA聚合酶具有強(qiáng)勁的性能和速度,,它能夠成功擴(kuò)增出隨機(jī)挑選的16個片段中的15個(94%),,并且產(chǎn)量很高。而Pfu DNA聚合酶的成功率僅為56%,,Taq DNA聚合酶成功率也才62%,,二者的產(chǎn)量明顯低于Phusion® DNA聚合酶。而且從圖中可以看出,Phusion® DNA聚合酶的延伸時間和酶用量均顯著低于Pfu酶,,與Taq相當(dāng),,但產(chǎn)量更高。如此強(qiáng)勁的性能,,無出其右,。


 
圖2. Phusion DNA 聚合酶集超高保真度、快速和強(qiáng)勁的性能于一體

 

節(jié)約時間,,節(jié)約用量

由于其結(jié)構(gòu)*,,Phusion DNA聚合酶的效率非常高。在PCR反應(yīng)中,,該酶的用量顯著低于其他常見的聚合酶,。研究人員曾使用3種不同的DNA聚合酶擴(kuò)增一個長為3.8kb的人β球蛋白基因。使用Phusion DNA聚合酶不但可成功擴(kuò)增出此3.8kb的基因組片段,,且退火和延長步驟僅需1分鐘,,明顯快于其他兩種聚合酶。一個單位的Phusion DNA聚合酶所獲得的產(chǎn)物高于5個單位的Pfu DNA聚合酶的產(chǎn)量,,比2.5個單位改良的Pfu的產(chǎn)量也高得多,。

圖3. 用更少的酶 —— 獲得更多的產(chǎn)物

適用性強(qiáng)

此外,Phusion DNA聚合酶能夠zui大限度地容忍各種PCR抑制劑,,因此只需要很少的優(yōu)化步驟就可以進(jìn)行非常的擴(kuò)增,。這個特點(diǎn)也催生了的直接PCR。對于血液,、組織等多種樣品,,甚至是FFPE樣品,無需提取DNA,,即可直接開展高保真PCR擴(kuò)增,。

Phusion DNA聚合酶有多個版本可供選擇。 除了上面提到的Phusion Flash,,還有Phusion熱啟動II高保真DNA聚合酶,,其高度特異性和*聚合能力決定了它是熱啟動PCR的理想選擇。幾種酶的特點(diǎn)和產(chǎn)品形式如下:

 

 

Phusion 高保真DNA聚合酶

Phusion 熱啟動II高保真DNA聚合酶

Phusion Flash
高保真DNA聚合酶

Phire 熱啟動IIDNA聚合酶

酶的 
特點(diǎn)

平端或3’ A端

平端

平端

平端

平端

目標(biāo)片段長度

≤ 20 kb

≤ 20 kb

≤ 20 kb

≤ 7.5 kb

熱啟動

推薦延伸時間

15-30 s/kb

15-30 s/kb

15 s/kb

10-15 s/kb

校正功能

一般

保真度 vs. Taq

52x

52x

25x

2x

產(chǎn)品 
形式

單酶1

-

Master Mix2

-

-

試劑盒3

-

-

-

價格便宜 選擇多樣

Phusion DNA聚合酶性能如此強(qiáng)勁,,而價格卻相當(dāng)親民,。以Phusion高保真PCR 試劑盒(含除模板引物外其他所需試劑)為例,目錄價只需555元即可進(jìn)行125次反應(yīng)(每次20μl ),,單次反應(yīng)成本才4.44元,,1878 元即可有500次反應(yīng),簡直太給力了,!
Phusion DNA聚合酶(含酶,,緩沖液,Mg離子,DMSO)只要879元/100U,,足夠做100次50ul反應(yīng),。要知道PfuUltra目錄價100U的單酶(40次反應(yīng))也不止1900啊,!

Phusion DNA聚合酶還提供其他多種選擇,,熱啟動的高保真單酶(1067元/100U),還有針對GC含量豐富模板,,或者特別含HF緩沖液的預(yù)混合酶MasterMix系列產(chǎn)品,。

 

更少出錯

更重要的是,Phusion DNA聚合酶是目前市場上保真度zui高的熱穩(wěn)定性聚合酶,。使用改良的lacI方法檢測,,Phusion DNA聚合酶的錯配率比Taq DNA聚合酶低約50倍, 比Pfu DNA聚合酶低6倍,是高保真PCR的理想選擇,。對于研究基因功能,,需要從事定點(diǎn)突變,基因克隆和表達(dá)分析等工作來說,,Phusion DNA聚合酶無疑是更好的選擇,。

Taq酶出錯幾率較高,且平均擴(kuò)增長度不超過3.5kb,。而Phusion DNA聚合酶則可擴(kuò)增10kb以上(<20kb)的超長片段,,保真度高不容易出錯,再加上擴(kuò)增速度比普通高保真酶快得多,,故使用Phusion DNA聚合酶可以有效節(jié)約很多時間,。

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