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nanoporetech 使用納米孔測序技術(shù)的微生物學(xué)
完整的細(xì)菌,真菌和病毒(DNA或RNA)基因組,,可進(jìn)行長時間的納米孔測序,。通過快速的病原體檢測方法(無論是在實驗室還是在野外),從環(huán)境或單一生物樣品中鑒定并鑒定微生物,。如果需要,,還應(yīng)附有抗菌素耐藥性分析。使用直接RNA或cDNA方法對全長轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行測序,,以進(jìn)行準(zhǔn)確的基因表達(dá)和轉(zhuǎn)錄本亞型分析,。
全面分析微生物基因組(DNA或RNA)。準(zhǔn)確定位重復(fù)區(qū)域和結(jié)構(gòu)變異,,并使用長測序讀數(shù)將質(zhì)粒與基因組區(qū)分開,。簡化從頭組裝并更正現(xiàn)有的參考基因組??蓴U(kuò)展以適應(yīng)您從工作臺到現(xiàn)場的需求,。
實時準(zhǔn)確識別微生物和相關(guān)的抗藥性(AMR),。Oxford Nanopore提供了完整的解決方案-從快速的10分鐘文庫制備(DNA)到使用EPI2ME平臺的實時系統(tǒng)發(fā)育和AMR分析,。使用宏基因組或靶向16S rRNA方法。使用便攜式MinION或臺式GridION或PromethION設(shè)備在樣品源處或?qū)嶒炇抑羞M(jìn)行測序,。
使用全長納米孔測序讀數(shù),,解析轉(zhuǎn)錄本亞型并測量真實的基因表達(dá)譜。低投入量與快速,,簡化的工作流程相結(jié)合,,可進(jìn)行高度敏感的基因表達(dá)分析
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微生物表現(xiàn)出許多類型的堿基修飾,,可影響一系列功能,包括基因表達(dá)和抗菌素耐藥性,。與基于替代測序的分析方法不同,納米孔測序不需要擴(kuò)增或鏈合成,,可以減少偏差并保留修飾的堿基信息,,這些信息可以與核苷酸序列一起直接檢測到-無需額外的樣品轉(zhuǎn)換。
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