paragongenomics適用于MGI SARS-CoV-2面板的CleanPlex®

該基于擴(kuò)增子的SARS-CoV-2 NGS面板專為COVID19冠狀病毒研究和監(jiān)測而設(shè)計(jì),，可對負(fù)責(zé)COVID19大流行的新型SARS-CoV-2病毒進(jìn)行完整的基因組測序,。該面板專門針對MGI Tech的DNBSEQ平臺,。其他版本可用于  Illumina測序平臺。 

SKU：paragongenomics 918001

類別：CleanPlex對于MGI,，CleanPlex為MGI現(xiàn)成的使用面板,，傳染病，產(chǎn)品,，準(zhǔn)備到使用NGS面板標(biāo)簽：靶富集,，靶向測序，擴(kuò)增子測序,，多重PCR,，下一代測序，定向重測序,，NGS面板,，NGS測定，PCR擴(kuò)增子測序,，SARS-CoV的-2 ,，研究面板，COVID19,，2019-nCoV,，傳染性疾病監(jiān)測

產(chǎn)品描述

用于MGI SARS-CoV-2的CleanPlex®面板，用于通過MGI Tech的DNBSEQ平臺上的下一代測序（NGS）的基于擴(kuò)增子的靶標(biāo)富集檢測,，跟蹤和研究COVID19冠狀病毒

Paragon Genomics設(shè)計(jì)了一個(gè)高度多重的靶標(biāo)富集板,，覆蓋了SARS-CoV-2病毒的整個(gè)基因組（末端的92個(gè)堿基除外）,。該小組能夠?qū)ω?fù)責(zé)COVID19大流行的新型SARS-CoV-2病毒進(jìn)行完整的基因組測序和流行病學(xué)研究,。借助Paragon Genomics CleanPlex技術(shù)，可在5小時(shí)內(nèi)將病毒的整個(gè)基因組從RNA擴(kuò)增到序列就緒的文庫,。該面板的兩個(gè)版本可用于兩個(gè)主要的測序平臺：Illumina和MGI,。CleanPlex技術(shù)可輕松，靈活地對樣品進(jìn)行測序,，以確保對傳染病的監(jiān)測和研究,。

強(qiáng)調(diào)

• 節(jié)省大量成本
  降低測序成本98％。許多散彈槍宏基因組測序方法所需的每個(gè)樣品僅需要0.2M讀數(shù),，而  1000萬個(gè)讀數(shù),。
• 目標(biāo)區(qū)域的高覆蓋率
  整個(gè)SARS-CoV-2基因組的覆蓋率達(dá)到99％
• 靈敏檢測
  可以高置信度檢測多達(dá)1個(gè)拷貝，而RT-qPCR可以檢測3-5個(gè)拷貝（1）
• 快速，簡化的工作流程
  使用快速的四步協(xié)議（包括RT步驟）以少的動手時(shí)間,，只需5.5小時(shí)即可生成可測序的文庫,。
• 性能超群
  準(zhǔn)備高質(zhì)量的NGS庫具有優(yōu)良的對目標(biāo)使用CleanPlex技術(shù)，使高效利用測序讀取性能,。CleanPlex專家組的準(zhǔn)靶率通常比混合捕獲的小靶標(biāo)富集專家組的靶率高得多,。

CleanPlex SARS-CoV-2面板包含帶有RT組件的CleanPlex多重PCR引物和CleanPlex靶向庫試劑盒。CleanPlex索引PCR引物和CleanMag ^®  磁珠單獨(dú)訂購?fù)瓿蓮妮斎隦NA工作流測序就緒NGS庫,。

儲存溫度

儲存在-20°C,。

（1）Corman VM等。通過實(shí)時(shí)RT-PCR檢測（2019-nCoV）https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6988269/

僅供研究使用,。不用于診斷過程,。

（左）使用含有SARS-CoV-2的N和S基因的質(zhì)粒，通過一個(gè)單一的工作流程進(jìn)行檢測,，顯示了低拷貝數(shù)下的檢測率,。結(jié)果表明，檢出率為1.1份時(shí)為56％,，當(dāng)存在2份以上時(shí)為100％,。通過使用兩個(gè)池來覆蓋整個(gè)病毒基因組，預(yù)期靈敏度只會進(jìn)一步提高,。（右）對于檢測到的這些,，該小組能夠平均捕獲10倍讀取深度范圍內(nèi)的所有靶標(biāo)，以獲得2.8個(gè)病毒拷貝,，類似地,，除了一個(gè)靶標(biāo)外，所有靶標(biāo)均捕獲1.4個(gè)病毒拷貝,。所有目標(biāo)也均勻分布在整個(gè)GC范圍內(nèi),。

附加信息