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QA-Bio是一家致力于提供糖基化研究工具的公司,,所提供的糖基化研究產(chǎn)品涵蓋糖苷內(nèi)/外切酶,,去糖基化沒(méi),,唾液酸產(chǎn)品,,多糖產(chǎn)品純化試劑盒,,多糖標(biāo)記試劑盒等,,同時(shí)提供多糖分析服務(wù),。
qa-bio E-PNG01說(shuō)明書(shū)
產(chǎn)品編號(hào):E-PNG01
- 內(nèi)切糖苷酶切割來(lái)自糖蛋白的完整聚糖 -
清潔制劑中的高度穩(wěn)定的酶 - 不含甘油,NaCl或其他添加劑,,如EDTA,。
- 測(cè)試所有酶不存在蛋白水解或意外的糖苷活性
內(nèi)切糖苷酶是用于分析糖蛋白的廣泛使用的酶。這些酶從糖蛋白釋放完整的聚糖,,而外切糖苷酶釋放單個(gè)單糖(即唾液酸,,半乳糖,β-N-乙?;咸前?,甘露糖等)。
PNGase F通常包含在酶組中,,因?yàn)槠淝懈钔暾腘-連接聚糖具有相似的活性,,盡管它實(shí)際上是酰胺酶。它在天冬酰胺氨基酸和N-連接聚糖的殼二糖核心的個(gè)β-N-乙酰葡糖胺糖(GlcNAc)之間切割,。Endo F酶和Endo H在和第二GlcNAc之間切割N-連接的聚糖,,留下帶電荷的殘基,其有助于增加去糖基化蛋白質(zhì)的溶解度,,降低蛋白質(zhì)聚集體沉淀的可能性,。PNGase F切割所有N-連接的聚糖,,而Endo H和Endo F酶切除特定類型的N-連接聚糖。
酶的這種分類還包括O-糖苷酶,,其從絲氨酸或蘇氨酸氨基酸中除去核心1O-連接的聚糖(Galβ1,3GalNAcα),。通常,O-連接的聚糖含有在分支和線性連接中與半乳糖連接的另外的單糖,,需要使用外切糖苷酶如唾液酸酶和半乳糖苷酶來(lái)除去額外的糖,。
PNGase F從糖蛋白切割N-連接(天冬酰胺連接的)寡糖。
產(chǎn)品編號(hào) - 酶的量
E-PNG01 - 60μLs
E -PNG01-20 - 20μLs¹
E -PNG01-200 - 200μls²(以前的E-PNG05)
¹包括緩沖液,,變性劑和Triton-
X²僅含酶
PNGase F,,肽N糖苷酶F,N-糖苷酶,,N-聚糖酶
PNGase F從糖蛋白切割N-連接(天冬酰胺連接的)寡糖,。該酶將天冬酰胺脫氨基成天冬氨酸,使寡糖保持完整,。變性增加了解理速率,。大多數(shù)天然蛋白質(zhì)仍然可以*N-去糖基化,但必須增加孵育時(shí)間,。酶在反應(yīng)條件(37℃)下保持*活性至少96小時(shí),。PNGase F不會(huì)去除植物糖蛋白上常見(jiàn)的含有α-(1,3) - 連接的核心巖藻糖的寡糖; 為此目的,使用肽N-糖苷酶A.
有許多替代酶可用于去除N-聚糖,,特別是Endo F家族的酶和Endo H.這些酶切割寡糖核心中的兩個(gè)N-乙酰氨基葡萄糖殘基,,產(chǎn)生截短的糖在天冬酰胺上殘留一個(gè)N-乙酰氨基葡萄糖殘基的分子。這留下帶電荷的糖,,其可以幫助將蛋白質(zhì)保持在溶液中,,所述溶液在用PNGase F去糖基化后沉淀,其去除了完整的寡糖,。Endo F1切割高甘露糖和一些雜合型N-聚糖,。Endo F2將去除雙觸角和高甘露糖(降低40倍速率)。Endo F3釋放出triantennarry和巖藻糖基化的雙觸角N-聚糖,。遠(yuǎn)藤H. 去除雜交或高甘露糖聚糖,。
來(lái)源 Elizabethkingia miricola(是Chryseobacterium meningosepticum)
EC 3.5.1.52
PDB 1PGS
UniProt Q9XBM8
內(nèi)容
PNG酶的F的20mM的Tris-HCl,pH 7.5中
包含20μL和60μL包裝尺寸:
5x反應(yīng)緩沖液7.5 - 250 mM磷酸鈉,,pH 7.5
變性溶液 - 2%SDS,,1Mβ-巰基乙醇
Triton X-100 - 15%溶液
比活度 > 25 U / mg
活性 5U / ml
分子量 36,000道爾頓
pH范圍 6-10,適7.5
方案
1.將多200μg的糖蛋白添加到Eppendorf管中,。用去離子水調(diào)節(jié)至35μl終體積,。
2.加入10μl5x反應(yīng)緩沖液7.5和2.5μl變性溶液。在100°C加熱5分鐘。
很酷,。加入2.5μlTritonX-100并混合,。
4.向反應(yīng)中加入2.0μl酶。在37°C孵育3小時(shí),。
特異性切割所有天冬酰胺連接的復(fù)合物,,雜交或高甘露糖寡糖,除非α(1-3)核心巖藻糖基化; 天冬酰胺必須在兩個(gè)末端都是肽鍵合,,Endo F游離
比活性定義為在37℃,,pH7.5下在1分鐘內(nèi)催化從1微摩爾變性的RNase B釋放N-連接的寡糖所需的酶量。通過(guò)SDS-PAGE監(jiān)測(cè)切割(切割的RNase B遷移更快),。
儲(chǔ)存在4°C下儲(chǔ)存酶,。
參考
- 拜耳,EA,,F(xiàn),。De Meester,T,。Kulik和M. Wilchek,。去糖基化蛋清抗生物素蛋白的制備。 Appl Biochem Biotech 53: 1-9(1995)
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- Tarentino,A .L,。,,CM Gomez和TH Plummer,Jr ,。天冬酰胺連接的聚糖的去糖基化肽:N-糖苷酶 F.Biochemistry 24: 4665-4671(1985)
- Tarentino AL和TH Plummer,。天冬酰胺連接的聚糖的酶促去糖基化:來(lái)自Flavobacterium meningosepticum的寡糖切割酶的純化,性質(zhì)和特異性,。 Meth Enzymol 230: 44-57(1994)
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- Tarentino AL,,Trimble RB,,Plummer TH。用于研究糖蛋白的結(jié)構(gòu),,合成和加工的酶促方法,。 細(xì)胞生物學(xué)方法: 32:111-39(1989)
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貨號(hào) | 名稱 | 規(guī)格 |
E-PNG01 | PNGase F | 60 µL |
E-EF01 | Endo F1 | 60 µL |
E-S001 | Sialidase Au | 60 µL |
E-BG07 | Beta Galactosidase | 60 µL |
KE-DG01 | Enzymatic CarboRelease Kit | 1 Kit |
LL-ORELA-A2 | Orela O-Linked Glycan Release Kit | 1 Kit |
LT-KDMB-A1 | DMB Sialic Acid Labeling Kit | 1 Kit |
KE-SIALIQ | Sialic Acid Quantitation Kit | 1 Kit |
LT-MONO-96 | Monosaccharide Analysis Kit | 1 Kit |
LT-VTAG-24 | V-Tag Glycopeptide Labeling Kit | 1 Kit |
KE-EFX3 | Endo F Multi-Kit | 1 Kit |
E-AG02 | Alpha Galactosidase | 60 µL |
LL-MR-A2 | Ludger Liberate Membrane Release kit | 1 Kit |
E-S001 | Sialidase Au | 60 µL |
E-AM02 | Core Alpha Mannosidase | 60 µL |
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