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上海起發(fā)實(shí)驗(yàn)試劑有限公司

pnabio PNA鉗夾套件

時(shí)間:2018-9-5閱讀:3617

PNA BIO INC致力于為基礎(chǔ)研究和應(yīng)用領(lǐng)域的實(shí)驗(yàn)室提供的研究產(chǎn)品和服務(wù),。

PNA Bio提供PNA(Peptide Nucleic Acid)產(chǎn)品,包括定制寡核苷酸,,F(xiàn)ISH探針,,miRNA抑制劑,PNA鉗夾探針和Fmoc單體,。HPLC純化后,,它們與MS / MS數(shù)據(jù)一起提供> 95%的純度。PNA產(chǎn)品由Panagene制造,。

PNA Bio還提供工程化核酸酶服務(wù),,包括CRISPR / Cas9核酸酶(RGEN)合成,驗(yàn)證和Cas9蛋白以及敲除和敲入細(xì)胞系服務(wù),。

 

PNA Clamp Kits   PNA鉗夾套件

 

PNAClamp技術(shù)是基于PNA的PCR鉗制,,其僅選擇性地?cái)U(kuò)增突變的靶DNA序列作為與主要野生型DNA序列的混合物中的次要部分。它充分利用了PNA探針的性質(zhì),其對(duì)其靶DNA具有強(qiáng)結(jié)合親和力和特異性,,并且不被DNA聚合酶識(shí)別為引物,。

PNAClamp突變檢測(cè)試劑盒可以使用來(lái)自手術(shù)組織或福爾馬林固定的石蠟包埋活組織檢查(FFPE)的DNA樣本。

PNAClamp突變檢測(cè)試劑盒與傳統(tǒng)方法相比具有許多優(yōu)勢(shì),。

·  在短時(shí)間內(nèi)檢測(cè)到突變(3小時(shí)運(yùn)行時(shí)間,,30分鐘手動(dòng)操作時(shí)間)

·  簡(jiǎn)單的協(xié)議 

·  檢測(cè)需要少量DNA樣品(1~25 ng)

·  靈敏度高(檢出限<1%)

·  一貫

·  保質(zhì)期長(zhǎng)(> 1年) 

·  兼容各種實(shí)時(shí)PCR機(jī)(ABI-7500,ABI-7900HT,,Biorad CFX-96/384,,Roche Lightcycler,Qiagen RGQ等) 

·  用于簡(jiǎn)單數(shù)據(jù)解釋的分析軟件

我們還提供專(zhuān)門(mén)的技術(shù)支持來(lái)設(shè)置和分析數(shù)據(jù),。

 

 

 

EGFR突變細(xì)節(jié)

表皮生長(zhǎng)因子受體(EGFR)是受體酪氨酸激酶的家族成員,,在表皮細(xì)胞的表面上表達(dá)。EGFR的過(guò)度表達(dá)或過(guò)度活化與許多癌癥有關(guān),,包括肺癌,,肛門(mén)癌和多形性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤。

PNAClamp EGFR突變檢測(cè)試劑盒檢測(cè)迄今為止EGFR基因中描述的普遍的突變,,包括T790M,,其存在與酪氨酸激酶抑制劑的抗性相關(guān)。檢測(cè)EGFR基因中的體細(xì)胞突變可以提供預(yù)測(cè)酪氨酸激酶抑制劑響應(yīng)的有用策略,,以提高接受靶向治療的肺癌患者的存活率,。

<PNAClamp EGFR Kit檢測(cè)到的突變>

外顯子

氨基酸改變

基數(shù)變化

18

Gly719Ala

2156 G> C.

Gly719Ser

2155 G> A.

Gly719Cys

2155 G> T.

19

Glu746_Ala750del

2235_2249 del 15

Glu746_Thr751delinslle

2235_2252 AAT(復(fù)雜)

Glu746_Ser752del

2236_2253 del 18

Glu746_Thr751delinsAla

2237_2251 del 15

E746_S752>一個(gè)

2237_2254 del 18

Glu746_Ser752delinsVal

2237_2255> T(復(fù)雜)

Glu746_Ala750del

2236_2250 del 15

Glu746_Ser752delinsAsp

2238_2255 del 18

L747_A750>點(diǎn)

2238_2248> GC(復(fù)雜)

Leu747_Thr751delinsGln

2238_2252> GCA(復(fù)雜)

Leu747_Glu749del

2239_2247 del 9

Leu747_Thr751del

2239_2253 del 15

Leu747_Ser752del

2239_2256 del 18

Leu747_Glu749del:Ala750Pro

2239_2248 TTAAGAGAAG> C.

Leu747_Pro753delinsGln

2239_2258> CA(復(fù)雜)

Leu747_Thr751delinsSer

2240_2251 del 12

Leu747_Pro753delinsSer

2240_2257 del 18

Leu747_Thr751del

2240_2254 del 15

Leu747_Thr751deinsPro

2239_2251> C(復(fù)雜)

20

Thr790Met

2369 C> T.

Ser768lle

2303 G> T.

Ala767_Val769dupAlaSerVal

2307_2308 ins9

His773dupHis

2319_2320 insCAC

Asp770_A771insGly

2310_2311 insGGT

21

leu858Arg

2573 T> G.

leu861Gln

2582 T> A.

KRAS變異細(xì)節(jié)

KRAS突變存在于幾種癌癥中,包括結(jié)腸直腸癌,,肺癌,,甲狀腺癌和胰腺癌以及膽管癌。KRAS突變通常位于外顯子2的密碼子12和13內(nèi),,這可能導(dǎo)致p21-ras蛋白的異常生長(zhǎng)信號(hào)傳導(dǎo),。細(xì)胞生長(zhǎng)和分裂的這些改變可能引發(fā)癌癥發(fā)展,因?yàn)樾盘?hào)過(guò)度,。

KRAS突變通常作為藥物反應(yīng)的有用預(yù)后標(biāo)志物,。例如,KRAS突變被認(rèn)為是對(duì)酪氨酸激酶抑制劑如吉非替尼(易瑞沙)或厄洛替尼(特羅謝)的反應(yīng)的強(qiáng)預(yù)后標(biāo)志物,。近,,在許多結(jié)腸直腸癌患者中檢測(cè)到KRAS突變,并且可能與用于結(jié)腸癌治療的西妥昔單抗(Erbitux)或帕尼單抗(Vectibix)的應(yīng)答相關(guān),。

<PNAClamp KRAS Kit檢測(cè)到的突變>

密碼子

突變

基數(shù)變化

Codon12

Gly12Asp

35G>甲

Gly12Ala

35G>Ç

Gly12Val

35G>?

Gly12Ser

34G>甲

Gly12Arg

34G>Ç

Gly12Cys

34G>?

Codon13

Gly13Ser

34G>?

Gly13Arg

37G>Ç

Gly13Cys

37G>?

Gly13Asp

38G>甲

Gly13Ala

38G>Ç

Gly13Val

38G>?

 

 

 

Codon59

Ala59Ser

175G>?

Ala59Thr

175GA

Ala59Glu

176C>甲

Ala59Gly

176C“G

Ala59del

176_178 del CAG

 

 

 

Codon61

Gly60Asp

179克>甲

Gly60Ala

179克>Ç

Gly60Val

179克>?

Gly60Gly

180T>甲

Gly60Gly

180T>Ç

Gln61Glu

181C“G

Gln61Lys

181C>甲

Gln61Leu

182A>?

Gln61Arg

182A“G

Gln61Pro

182A>Ç

Gln61His

183A>?

Gln61His

183A>Ç

 

 

 

密碼子117

Lys117Glu

349A“G

Lys117Arg

350A“G

Lys117Asn

351A>Ç

Lys117Asn

351A>?

 

 

 

密碼子146

Ala146Pro

436G>Ç

Ala146Thr

436G>甲

Ala146Gly

437C“G

Ala146Val

437C>?

Ala146Ala

438A“G

Ala146Ala

438A>Ç

Ala146Ala

438A>?

NRAS突變細(xì)節(jié)

NRAS突變發(fā)現(xiàn)于幾種癌癥,,如黑色素瘤(13~25%),結(jié)直腸癌(1~6%),,肺癌(1%),,甲狀腺癌(7%)和肝細(xì)胞癌(10%),。據(jù)了解,如果患者患有NRAS突變,,對(duì)于結(jié)腸直腸癌藥物如Erbitux和西妥昔單抗的藥物反應(yīng)降低,,轉(zhuǎn)移性結(jié)直腸癌患者的預(yù)后很差。

NRAS突變細(xì)節(jié)

 ·PNAC-1101(43個(gè)突變)

沒(méi)有,。

試劑

密碼子

氨基酸變化

核苷酸變化

宇宙號(hào)

1

N_G12 PNA 
混合

2

p.G12S

c.34G>甲

563

p.G12R

c.34G>Ç

561

p.G12C

c.34G>?

562

p.G12N

c.34_35GG> AA

12723

p.G12P

c.34_35GG> CC

559

p.G12Y

c.34_35GG> TA

560

p.G12D

c.35G>甲

564

p.G12A

c.35G>Ç

565

p.G12V

c.35G>?

566

2

N_G13 PNA 
混合

p.G13S

c.37G>甲

571

p.G13R

c.37G>Ç

569

p.G13C

c.37G>?

570

p.G13N

c.37_38GG> AA

24668

p.G13Y

c.37_38GG> TA

568

p.G13D

c.38G>甲

573

p.G13A

c.38G>Ç

575

p.G13V

c.38G>?

574

p.G13V

c.38_39GT> TC

572

p.G13G

c.39T>Ç

576

3

N_A59 PNA 
混合

3

p.A59T

c.175G>甲

578

p.A59D

c.176C>甲

253327

p.A59G

c.176C“G

1178067

4

N_Q61 PNA 
混合

p.Q61K

c.181C>甲

580

p.Q61E

c.181C“G

581

p.Q61R

c.181_182CA> AG

579

p.Q61L

c.181_182CA> TT

12725

p.Q61P

c.182A>Ç

582

p.Q61R

c.182A“G

584

p.Q61L

c.182A>?

583

p.Q61R

c.182_183AA> GG

33693

p.Q61L

c.182_183AA> TG

30646

p.Q61H

c.183A>Ç

586

p.Q61Q

c.183A“G

587

p.Q61H

c.183A>?

585

N_K117 PNA 
混合

4

p.K117E

c.349A“G

-

p.K117R

c.350A“G

-

p.K117N_T

c.351G>?

-

p.K117N_C

c.351G> C ^

-

6

N_A146 PNA 
混合

p.A146T

c.436G>甲

27174

p.A146P

c.436G> C ^

-

p.A146S

c.436G>?

-

p.A146V

c.437C>?

-

p.A146G

c.437C“G

-

 

BRAF突變檢測(cè)試劑盒

在幾種癌癥中發(fā)現(xiàn)B-raf突變,,包括甲狀腺癌,惡性黑素瘤,,卵巢癌,,結(jié)腸直腸癌。

在甲狀腺癌病例中,,有超過(guò)40種不同類(lèi)型的B-raf突變,。在這些突變中,外顯子15上的V600E突變(在1799堿基中從T變?yōu)锳)是重要的,,超過(guò)90%的頻率,。特別是,乳頭狀甲狀腺癌中檢測(cè)到B-raf V600E突變的頻率約為45%,,被認(rèn)為是甲狀腺癌的預(yù)后因素。

另外,,結(jié)腸直腸癌中的B-raf突變被報(bào)道為減少對(duì)西妥昔單抗(Erbitux)或panitumuab(Vectibix)的藥物反應(yīng)的預(yù)后標(biāo)志物,。這些結(jié)果意味著B(niǎo)-raf突變檢測(cè)對(duì)于結(jié)直腸癌和甲狀腺癌的藥物反應(yīng)的診斷和預(yù)后是必需的,。

PI3K3CA突變細(xì)節(jié)

PI3K(磷酸肌醇3-激酶或PI3-激酶)是能夠磷酸化磷脂酰肌醇的肌醇環(huán)的3'位羥基的脂質(zhì)激酶家族。它們參與協(xié)調(diào)多種細(xì)胞功能,包括細(xì)胞生長(zhǎng),,增殖,分化,,運(yùn)動(dòng),,存活和細(xì)胞內(nèi)運(yùn)輸。

近在某些類(lèi)型的癌細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)了激活p110α亞基(PIK3CA)的PI3K催化結(jié)構(gòu)域中的突變,。PIK3CA突變?cè)诟鞣N類(lèi)型的腫瘤中以25%~40%的頻率被發(fā)現(xiàn),,包括結(jié)腸直腸癌,胃癌,,肺癌,,腦癌,子宮內(nèi)膜癌,,卵巢癌,,乳腺癌。大約80%的點(diǎn)突變主要在外顯子9(假定的螺旋結(jié)構(gòu)域)和外顯子20(假定的激酶結(jié)構(gòu)域)中,,而在不同的位置也可以看到其他類(lèi)型的突變,。

<PNAClamp PIK3CA試劑盒檢測(cè)到的突變>

管號(hào)

試劑

氨基酸變化

基數(shù)變化

外顯子

翻譯地區(qū)

1

E542

Glu542Lys

1624 G> A.

外顯子9

螺旋形的

Glu542Gly

1624 A> G.

Glu542Val

1624 A> T.

2

E545

Glu545Lys

1633 G> A.

Glu545Gly

1634 A> G.

Glu54sp

1635 G> T.

3

H1047

His1047Tyr

3139 C> T.

外顯子20

激酶

His1047Leu

3140 A> T.

His1047Arg

3140 A> G.

IDH1突變檢測(cè)試劑盒

IDH1(異檸檬酸脫氫酶1,,IDH1)的突變可以在膠質(zhì)母細(xì)胞瘤和骨髓增生性腫瘤中發(fā)現(xiàn)。

IDH1突變的檢測(cè)可以是預(yù)后的陽(yáng)性預(yù)測(cè)因子和膠質(zhì)母細(xì)胞瘤患者的分子標(biāo)記物,。另一方面,,據(jù)報(bào)道,IDH1突變與骨髓增生性腫瘤的預(yù)后不良相關(guān),。

PNAClamp IDH1突變檢測(cè)試劑盒以高靈敏度檢測(cè)R132位置的突變,。

 

 

目錄號(hào)

產(chǎn)品名稱(chēng)

描述

尺寸

PNAC-1002

PNAClamp KRAS套件(v2)

G12,G13

30次測(cè)試

PNAC-1003

PNAClamp KRAS套件(v3)

G12,,G13,,Q61

25次測(cè)試

PNAC-1004

PNAClamp KRAS套件(加)

A59,K117,,A146

25次測(cè)試

PNAC-1006

PNAClamp KRAS套件(v4)

G12,,G13,A59,,Q61,,K117,A146

25次測(cè)試

PNAC-1101

PNAClamp NRAS套件(v4)

G12,,G13,,A59,Q61,,K117,,A146

25次測(cè)試

PNAC-2001

PNAClamp BRAF套件

BRAF V600突變

50次測(cè)試

PNAC-3002

PNAClamp EGFR試劑盒

G619,E19 d??el,,T790,,S768,E20 in,,L858,,L861

25次測(cè)試

PNAC-4002

PNAClamp PIK3CA套件

E542,E545,,H1047

25次測(cè)試

PNAC-5001

PNAClamp IDH1套件

R132突變

25次測(cè)試

 

 

 

Pnabio 部分產(chǎn)品列表

貨號(hào)

品名

規(guī)格

品牌

CP01-20

Reconstitutes to 1 mg/ml, 120 pmol (6 uM x 20 ul)

20 ug

pnabio

CP01-50

Reconstitutes to 1 mg/ml, 300 pmol (6 uM x 50 ul)

50 ug

pnabio

CP01-200

Reconstitutes to 1 mg/ml, 1200 pmol (6 uM x 200 ul)

200 ug (50 ug x 4)

pnabio

CP02

Reconstitutes to 5 mg/ml, 1530 pmol (30 uM x 50 ul)

250 ug

pnabio

CP03

Reconstitutes to 5 mg/ml, 6000 pmol (30 uM x 50 ul x 4 tubes)

1 mg (250 ug x 4)

pnabio

CP04-100

Liquid form 1 mg/ml, 600 pmol (6 uM x 20 ul x 5 tubes)

100 ug (20 ug x 5)

pnabio

CP04-500

Liquid form 5 mg/ml, 3000 pmol (30 uM x 20 ul x 5 tubes)

500 ug (100 ug x 5)

pnabio

CN01

Reconstitutes to 1 mg/ml, 300 pmol (6 uM x 50 ul)

50 ug

pnabio

CN02

Reconstitutes to 5 mg/ml,1530 pmol (30 uM x 50 ul)

250 ug

pnabio

CD01

Reconstitutes to 1 mg/ml,  300 pmol (6 uM x 50 ul)

50 ug

pnabio

CD02

Reconstitutes to 5 mg/ml,1530 pmol (30 uM x 50 ul)

250 ug

pnabio

F1001

C-rich telomere probe, FAM labeled

5 nmole

pnabio

F1002

C-rich telomere probe, Cy3 labeled

5 nmole

pnabio

F1003

C-rich telomere probe,  Cy5 labeled

5 nmole

pnabio

F1004

C-rich telomere probe, Alexa Fluor 488 labeled

5 nmole

pnabio

F1005

G-rich telomere probe, FAM labeled

5 nmole

pnabio

F1006

G-rich telomere probe, Cy3 labeled

5 nmole

pnabio

F1007

G-rich telomere probe, Cy5 labeled

5 nmole

pnabio

F1008

G-rich telomere probe, Alexa Fluor 488 labeled

5 nmole

pnabio

F1009

C-rich telomere probe, FITC labeled

5 nmole

pnabio

F1010

G-rich telomere probe, FITC labeled

5 nmole

pnabio

F1013

   C-rich telomere probe,     Alexa Fluor 647 labeled

5 nmole

pnabio

F1014

   G-rich telomere probe,   Alexa Fluor 647 labeled

5 nmole

pnabio

F1020

TelC probe for arthropods, Alexa Fluor 488 labeled

5 nmole

pnabio

F2001

C-rich telomere probe, Biotin labeled

5 nmole

pnabio

F3001

Centromere probe, FAM labeled

5 nmole

pnabio

F3002

Centromere probe, Cy3 labeled

5 nmole

pnabio

F3005

Centromere probe, Cy5 labeled

5 nmole

pnabio

F3004

Centromere probe, Alexa Fluor 488 labeled

5 nmole

pnabio

F3008

Centromere probe, Biotin labeled

5 nmole

pnabio

F3003

Centromere probe, Cy3 labeled

5 nmole

pnabio

F3006

Centromere probe, FAM labeled

5 nmole

pnabio

F5001

CAG repeats, Cy3 labeled

5 nmole

pnabio

G2001-3

A set of 4 PNA oligos against human globin,

3 nmole

pnabio

G2001-10

A set of 4 PNA oligos against human globin

10 nmole

pnabio

MP01-25

ggcaagtgttcttcgga

25 nmole

pnabio

MP01-50

ggcaagtgttcttcgga

50 nmole

pnabio

PP01-25

ggctcaaccctggacag

25 nmole

pnabio

PP01-50

ggctcaaccctggacag

50 nmole

pnabio

RV01

Surrogate reporter vector with GFP for FACS

5 ug

pnabio

RV02

Surrogate reporter vector with GFP and H2KK for MACS

5 ug

pnabio

RV03

Surrogate reporter vector with GFP and Hygromycin-R

5 ug

pnabio

CV01

Cas9 co-transfection vector (CMV promoter)

5 ug

pnabio

CV02

Cas9, Hygromycin R, and GFP expression vector (CMV promoter)

5 ug

pnabio

CV03

Cas9, RFP, puromycin R expression vector (CMV promoter)

5 ug

pnabio

CV11

Cas9 co-expression vector (EF1a promoter)

5 ug

pnabio

CV12

Cas9, Hygromycin R, and GFP expression vector (EF1a promoter)

5 ug

pnabio

CV13

Cas9, RFP, and Puromycin R expression vector (EF1a promoter)

5 ug

pnabio

FMA-1001

Fmoc-A(Bhoc)-aeg-OH

1 g / 2 g

pnabio

FMG-1001

Fmoc-G(Bhoc)-aeg-OH

1 g / 2 g

pnabio

FMC-1001

Fmoc-C(Bhoc)-aeg-OH

1 g / 2 g

pnabio

FMT-1001

Fmoc-T-aeg-OH

1 g / 2 g

pnabio

FMO-1001

Fmoc-AEEA-OH

1 g / 2 g

pnabio

PNAC-1002

PNAClamp KRAS Kit (v2)

30 tests

pnabio

PNAC-1003

PNAClamp KRAS Kit (v3)

25 tests

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