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Genetic Signatures成立于2001年,,由Geoffrey Grigg博士(原澳大利亞聯(lián)邦科學與工業(yè)研究組織(CSIRO)分子生物學部主任)創(chuàng)立。甲基化分析中使用廣泛的方法是亞硫酸氫鹽法,,由Grigg博士在英國劍橋設想,,并被減少到CSIRO實驗室的實踐中[1]。初的方法隨后得到改進,,這些改進導致了遺傳簽名MethylEasy™DNA亞硫酸氫鈉修飾產(chǎn)品系列的開發(fā)和發(fā)布,。
由于改進的轉(zhuǎn)化方法和用于胞嘧啶甲基化檢測的應用,發(fā)現(xiàn)了一個有趣的發(fā)現(xiàn):通過亞硫酸氫鈉處理微生物DNA能夠?qū)⑺姆N核酸堿基還原成僅三個堿基,,通過將胞嘧啶轉(zhuǎn)化為胸腺嘧啶,。該技術被稱為3base ™,是我們的EasyScreen ™病原體檢測試劑盒的基石,。
此后,,遺傳標志開發(fā)并商業(yè)化了一套基于EasyScreen ™實時PCR的產(chǎn)品,用于常規(guī)檢測傳染病,。EasyScreen ™產(chǎn)品為醫(yī)院和病理實驗室提供了分子工具,,可在快速高通量的環(huán)境中篩查各種傳染性病原體。
胃腸疾病可能由各種各樣的感染因素引起,,包括病毒,,細菌和原生動物。因此,,傳染性胃腸疾病的診斷可能具有挑戰(zhàn)性,,并且涉及微生物學,病毒學和寄生蟲學方面的專家,。
據(jù)估計,,澳大利亞每年有1680萬胃腸炎病例,導致醫(yī)院急診科就診25萬人,,住院15,000人,,死亡80人[1]。
為了簡化感染性胃腸道疾病病原體的檢測,,我們開發(fā)了 EasyScreen™ 實時PCR篩選檢測方法,,用于所有主要胃腸炎病原體。所有的分析方法都采用通用樣品處理方法,,并采用我們之前描述的 3base™ 技術 [2],。
傳統(tǒng)的胃腸炎診斷在某些情況下可能需要長達5天[3]才能提供明確的結(jié)果。為了減少這種情況,我們的實驗提供了樣品,,可以在3小時內(nèi)完成結(jié)果周轉(zhuǎn)時間,。
遺傳特征 EasyScreen ™腸道病原體檢測試劑盒具有以下優(yōu)點:
該 EasyScreen™ 腸道病原體檢測試劑盒包括:
產(chǎn)品# | EasyScreen™套件 | 檢測到微生物 |
---|---|---|
EB001和EB001-HT | 腸道細菌檢測 | (i)沙門氏菌屬 (ii)彎曲桿菌屬(Campylobacter spp,。) (iii)痢疾桿菌/腸內(nèi)侵襲性大腸桿菌(EIEC) (iv)小腸結(jié)腸炎耶爾森氏菌,。 (v)產(chǎn)毒的艱難梭菌和 (vi)單核細胞增生李斯特菌 |
EP001和EP001-HT | 腸道原生動物檢測 | (i)隱孢子蟲屬, (ii)腸道賈第蟲,, (iii)脆弱東部阿米巴, (iv)溶組織內(nèi)阿米巴,,和 (v)人芽囊原蟲(Blastocystis hominis) |
EV002和EV002-HT | 腸道病毒檢測 | (i)諾如病毒GI (ii)諾如病毒GII (iii)星狀病毒 (iv)輪狀病毒A (v )沙波病毒 (vi)腸病毒 (vii)博卡 病毒(viii)腺病毒和 (ix)腺病毒(僅40 + 41) |
CDD001 | 艱難梭菌檢測 | 致病性艱難梭菌(針對tcdA和tcdB) |
CDD002 | 艱難梭菌反射 | 超致病性艱難梭菌包括 (i)位置117處的tcdC基因缺失,, (ii)二元毒素基因(cdtA)和 (iii)gyrA基因突變(氟喹諾酮耐藥性)的核糖體027和078 , |
對于HT(384孔格式)試劑盒,,所有試劑盒都足夠用于100RXNs或500RXNs,。
所有 EasyScreen™ 腸道病原體檢測試劑盒可用于使用EasyScreen™ 樣品處理試劑盒制備的核酸 。
有關EasyScreen™ 工作流程以及與核酸提取和實時PCR平臺的兼容性的更多信息,, 請訪問我們的EasyScreen™ 工作流程頁面,。
[1]來源:澳大利亞政府衛(wèi)生與老齡部,“澳大利亞食源性疾病的年成本”,,2006年3月
[2] Baleriola C,,Millar D,Melki J,,Coulston N,,Altman P,Rismanto N和Rawlinson W.2008,。新型HPV測試與Hybrid Capture II(hcII)和參考PCR方法的比較顯示高特異性和陽性對13例高危人乳頭瘤病毒感染的預測價值,。J. Clin。病毒學雜志,。42:22-6 2008
[3] Cunningham SA,,Sloan LM,Nyre LM,,Vetter EA,,Mandrekar J和Pa R. 2010.三小時分子檢測糞便中彎曲桿菌,沙門氏菌,,耶爾森氏菌和志賀菌的準確性與培養(yǎng)物一樣高,。J. Clin,。微。48:2929-33
英文信息如下:
Product | EasyScreen™ Kit | Microorganisms Detected |
---|---|---|
EB001 & EB001-HT | Enteric Bacteria Detection | (i) Salmonella spp. (ii) Campylobacter spp. (iii) Shigella spp. /Enteroinvasive E.coli (EIEC) (iv) Yersinia enterocolitica. (v) toxigenic C. difficile and (vi) Listeria monocytogenes |
EP001 & EP001-HT | Enteric Protozoan Detection | (i) Cryptosporidium spp. (ii) Giardia intestinalis (iii) Dientamoeba fragilis (iv) Entamoeba histolytica and (v) Blastocystis hominis |
EV002 & EV002-HT | Enteric Viral Detection | (i) Norovirus GI (ii) Norovirus GII (iii) Astrovirus (iv) Rotavirus A (v) Sapovirus (vi) Enterovirus (vii) Bocavirus (viii) Adenovirus and (ix) Adenovirus (40 + 41 only) |
CDD001 | C. difficile Detection | Toxigenic C. difficile (targets both tcdA and tcdB) |
CDD002 | C. difficile Reflex | Hypervirulent C. difficile incl. ribotype 027 & 078 targeting: (i) tcdC gene deletion at position 117, (ii) binary toxin gene (cdtA) and (iii) gyrA gene mutation (fluoroquinolone resistance) |
對于HT(384孔格式)試劑盒,,所有試劑盒都足夠用于100RXNs或500RXNs
所有 EasyScreen™ 病原體檢測試劑盒都可用于使用EasyScreen™ 樣品處理試劑盒準備的 樣品,。
有關EasyScreen™ 工作流程以及與核酸提取和實時PCR平臺的兼容性的更多信息, 請訪問我們的 EasyScreen™ 工作流程頁面,。
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