TGIRT™-III Enzyme

規(guī)格：

 10 Reactions (TGIRT10)

50 Reactions (TGIRT50)

5 x 50 µl (TGIRT5x50)

10 x 50 µl (TGIRT10x50)

單位定義：

TGIRT的一個(gè)單元® -III逆轉(zhuǎn)錄酶（RT）活性是酶的使用聚在60℃下聚合1納摩爾的dNTP的在1分鐘（RA）所需要的量/寡（dT）42作為底物。

酶濃度：

200單位/μl

酶儲(chǔ)存緩沖液：

20mM Tris-HCl（pH 7.5）,，500mM KCl,，1mM EDTA,，1mM DTT，50％甘油

酶屬性和新穎活動(dòng)：

比逆轉(zhuǎn)錄逆轉(zhuǎn)錄酶更高的熱穩(wěn)定性,，持續(xù)合成能力和保真度,，允許從高度結(jié)構(gòu)化或重度修飾的RNA （例如tRNA）和包含富含GC的重復(fù)擴(kuò)增的RNA合成全長，端對(duì)端cDNA ,。1-9,12,15,18

新型端對(duì)端模板轉(zhuǎn)換活動(dòng),，可在反轉(zhuǎn)錄過程中連接RNA-seq或PCR適配器，并且無需單獨(dú)的RNA 3'-適配器連接步驟,。1這種模板轉(zhuǎn)換活性極大地促進(jìn)了鏈特異性RNA-seq文庫的構(gòu)建,，而且比使用隨機(jī)六聚體引物或使用RNA連接酶進(jìn)行銜接子連接的方法具有更小的偏差,。1,7,8

從退火引物合成cDNA。將退火的引物應(yīng)具有推測的T 米 > 60的直徑： C.酶與反應(yīng)底物混合,，在室溫下,，通過加入dNTP的反應(yīng)開始30分鐘的預(yù)溫育，建議,。新應(yīng)用的zui宜條件應(yīng)該通過測試25-450mM NaCl的一系列鹽濃度來確定,。

建議用于酶的用途：

1.全面的鏈特異性轉(zhuǎn)錄組分析。8

2.全細(xì)胞,，外泌體,，血漿和其他無細(xì)胞RNA的RNA-seq。7,8,15

3.分析miRNA,，tRNA和其他小的非編碼RNA,。1-9,12,15

4. RIP-seq，HITS-CLIP,，irCLIP和CRAC用于表征RNA-蛋白質(zhì)相互作用和核糖體分析,。1,10,11

5.通過高通量測序鑒定RNA堿基修飾。4,5,13,??14

6.使用諸如SHAPE和DMS修飾的方法進(jìn)行全基因組或靶向RNA結(jié)構(gòu)作圖,。1,16

7.富含GC重復(fù)擴(kuò)增的逆轉(zhuǎn)錄和定量。18

8.長cDNA的合成,。1

9.RT-qPCR,。1

10.單鏈DNA-seq。17

11.分析FFPE腫瘤樣本（咨詢InGex）,。

酶的優(yōu)點(diǎn)：

1.全面的鏈特異性轉(zhuǎn)錄組分析,。

核糖核碎片，通用人類參考RNA樣品的TGIRT®-seq概括了人類轉(zhuǎn)錄物和穗突起的相對(duì)豐度,，與非鏈特異性TruSeq v2相比,，并且優(yōu)于鏈特異性Tru-Seq v3。TGIRT®-seq比TruSeq v3具有更高的鏈特異性,，并消除了TruSeq固有的隨機(jī)六聚體引發(fā)的取樣偏差,。TGIRT®-seq顯示出更加統(tǒng)一的5'至3'基因覆蓋范圍，并且比TruSeq識(shí)別更多的剪接點(diǎn),。TGIRT®-seq能夠在與結(jié)構(gòu)化小型ncRNA相同的RNA-seq中同時(shí)分析mRNA和lncRNA,，包括tRNA，TruSeq數(shù)據(jù)集基本上不存在tRNA,。8

2.全細(xì)胞,，外泌體，血漿和其他細(xì)胞外RNA的RNA-seq,。

快速的處理時(shí)間（通過PCR步驟對(duì)RNA-seq文庫構(gòu)建<5小時(shí)）; 需要少量的RNA（低ng范圍）; 包括mRNA和lncRNA以及小ncRNA的全面轉(zhuǎn)錄譜,，包括tRNA,，pre-miRNA和其他結(jié)構(gòu)化小型ncRNA的全長讀段; 比常規(guī)方法更少的偏差和更大的鏈特異性。7,8,15

3.通過TGIRT®模板轉(zhuǎn)換的RNA-seq文庫構(gòu)建,，如RIP-seq,，HITS-CLIP，irCLIP,，CRAC,，??核糖體譜分析。

快速的處理時(shí)間（通過PCR步驟對(duì)RNA-seq文庫構(gòu)建<5小時(shí)）; 需要少量的RNA（低ng范圍）; 不需要RNA連接酶,，通過減少步驟中的步驟來減少偏倚并提率,。1,10,11

4.比逆轉(zhuǎn)錄病毒RT更高的熱穩(wěn)定性，持續(xù)合成能力和鏈置換活性,。

使用錨定寡核苷酸（dT）引物,，可以構(gòu)建RNA聚合腺苷酸化的RNA文庫，與沒有ribodepletion步驟的逆轉(zhuǎn)錄病毒RT相比,，具有更均勻的5'至3'覆蓋范圍,。1

通過基于毛細(xì)管電泳的方法（如SHAPE或DMS結(jié)構(gòu)圖）進(jìn)行RNA結(jié)構(gòu)作圖，其顯著的讀數(shù)長度和更少的提前停止時(shí)間比逆轉(zhuǎn)錄病毒RTs更短,。1,16

可以分析含有富含GC的重復(fù)擴(kuò)增的RNA模板,。18

能夠合成來自tRNA和其他小型結(jié)構(gòu)化/修飾的ncRNA的全長，端對(duì)端cDNA,，這些逆轉(zhuǎn)錄病毒RT難以治療,。4-9,12-15     

5.人血漿和大腸桿菌  基因組DNA的ssDNA-seq 。

通過直接在DNA鏈的3'末端啟動(dòng)DNA合成,，同時(shí)連接DNA-seq接頭而不進(jìn)行末端修復(fù),，拖尾或連接，以更簡單的工作流程捕獲的DNA末端,。能夠分析核小體定位,，轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)，DNA甲基化位點(diǎn)和起源組織,。17

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