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當(dāng)前位置:上海起發(fā)實(shí)驗(yàn)試劑有限公司>>技術(shù)文章>>SGI-DNA CE1000-50K 說明書
世界*實(shí)驗(yàn)材料供應(yīng)商 SGI-DNA正式授權(quán)上海起發(fā)為其中國(guó)代理,, SGI-DNA在一直是行業(yè)的*,一直為廣大科研客戶提供zui為的產(chǎn)品和服務(wù),上海起發(fā)一直秉承為中國(guó)科研客戶帶來的產(chǎn)品,,的服務(wù),,簽約 SGI-DNA就是為了給廣大科研客戶帶來更加完善的產(chǎn)品和服務(wù),您的滿意將是我們zui大的收獲
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SGI-DNA是Synthetic Genomics,Inc(SGI)的全資子公司,,成立于2013年,,總部位于加利福尼亞州La Jolla。
SGI-DNA基于克雷格·文特爾(J.Craig Venter),,漢密爾·史密斯(Ham Smith),,克萊德·哈奇森(Clyde Hutchison),丹·吉布森(Dan Gibson)及其團(tuán)隊(duì) 等科學(xué)家的科學(xué)進(jìn)步和突破,,利用*的專有DNA技術(shù)生產(chǎn)復(fù)雜的合成基因和試劑,。SGI-DNA還提供全面的基因組服務(wù),包括全基因組測(cè)序,,文庫(kù)設(shè)計(jì)和其他生物信息服務(wù),。
SGI-DNA負(fù)責(zé)SGI合成DNA業(yè)務(wù)的所有商業(yè)方面,并專注于與學(xué)術(shù)和商業(yè)研究人員的戰(zhàn)略業(yè)務(wù)關(guān)系,。
使用這種高度純化的酶,,進(jìn)行有針對(duì)性的指導(dǎo)RNA指導(dǎo)的雙鏈DNA切割。帶有NLS的XactEdit™Cas9核酸酶是一種含有核定位信號(hào)(NLS)的純化的重組化膿性鏈球菌(Streptococcus pyogenes) Cas9蛋白,。當(dāng)與適當(dāng)設(shè)計(jì)的引導(dǎo)RNA(gRNA)復(fù)合時(shí),,XactEdit™Cas9核酸酶介導(dǎo)位點(diǎn)特異性的靶向雙鏈DNA切割。將Cas9:gRNA復(fù)合物(RNP)引入細(xì)胞產(chǎn)生雙鏈DNA斷裂(DSB),,其已經(jīng)用于多種靶向基因組編輯研究,,例如同源敲入和基因敲除。
XactEdit™Cas9核酸酶可作為試劑盒或作為獨(dú)立的酶使用,,濃度為1 mg / mL或10 mg / mL,,可配制的導(dǎo)向RNA(gRNA)靶向DNA消化。純化至> 90%均一性,,XactEdit™Cas9不顯示非特異性核酸酶活性,。這些性能,以及低內(nèi)毒素水平,,使XactEdit™Cas9成為各種應(yīng)用的理想選擇,。XactEdit™酶可用于體外切割分析,或通過電穿孔或轉(zhuǎn)染引入細(xì)胞以靶向基因組序列,。與載體或基于mRNA的Cas9系統(tǒng)不同,,XactEdit™Cas9 RNP復(fù)合物不需要轉(zhuǎn)錄或翻譯,可以在進(jìn)入細(xì)胞后立即行動(dòng),。
圖2. 使用不同量的XactEdit™Cas9核酸酶(NLS)和gRNA的體外活性,。為了確定使用的XactEdit,?Cas9核酸酶和gRNA的zui有效量,進(jìn)行體外活性測(cè)定,。在每條泳道中,,將100ng對(duì)應(yīng)于同源框轉(zhuǎn)錄因子Emx1的770bp DNA片段與量的XactEdit TM Cas9蛋白和gRNA一起溫育。XactEdit™Cas9:gRNA復(fù)合物的特異性切割產(chǎn)生兩個(gè)片段(283 bp和487 bp),。數(shù)據(jù)表明,,XactEdit?Cas9蛋白使用不同量的輸入酶和gRNA有效地和特異性地切割靶位點(diǎn)處的底物,。泳道1中顯示的分子量(MW)標(biāo)記是1kb梯,。
圖3. 具有NLS的XactEdit™Cas9核酸酶與其他市售Cas9(NLS)核酸酶相比的體內(nèi)活性,。在體內(nèi)將兩種不同批次的XactEdit TM Cas9核酸酶的核酸酶活性與來自供應(yīng)商T和N的Cas9核酸酶的核酸酶活性進(jìn)行比較,。對(duì)于每個(gè)測(cè)定,使用1μgCas9和200ng體外轉(zhuǎn)錄的指導(dǎo)RNA形成Cas9:gRNA復(fù)合物,, Emx1基因,。通過電穿孔將復(fù)合物引入HEK 293T細(xì)胞。通過突變檢測(cè)分析(圖A,,左)和MiSeq TM分析(圖B,,右)檢查Cas9雙鏈斷裂(DSB)頻率。在圖A中,,由DSB產(chǎn)生的序列在瓊脂糖凝膠電泳中顯示為裂解產(chǎn)物,,表明Cas9誘導(dǎo)的DSB位點(diǎn)。泳道1和8是分子量(MW)標(biāo)記(來自New England Biolabs的Quick-Load 2-Log DNA ladder),。在圖B中,,靶位點(diǎn)的MiSeq TM測(cè)序的定量分析顯示為轉(zhuǎn)染細(xì)胞裂解的百分比。
圖4. XactEdit™Cas9的反相HPLC分析,。使用反相HPLC分析10μgXactEdit TM Cas9,。Zorbax 300SB-C3柱,流動(dòng)相A =在水中的0.1%TFA,,流動(dòng)相B =在乙腈中的0.1%TFA,,在1.0mL / min,40℃,,214nm檢測(cè)下梯度= 5-100%B 30分鐘,。
圖5.還原XactEdit™Cas9的SDS-PAGE,。使用還原性SDS-PAGE分析XactEdit Cas9。4-15%Bio-Rad TGX凝膠,,Bio-Rad Precision Plus蛋白標(biāo)記,,SYPRO-Orange染色。
圖6. XactEdit™Cas9的批次到批次活動(dòng)比較 使用針對(duì)5.5kb目標(biāo)設(shè)計(jì)的三種不同指導(dǎo)RNA(gRNA-1,,gRNA-2和gRNA-2)比較兩種不同批次的XactEdit™Cas9的活性的體外活性測(cè)定,。gRNA-SC是不識(shí)別目標(biāo)DNA的混雜的陰性對(duì)照RNA。XactEdit™Cas9酶的存在或不存在分別由+和 - 表示,。通過瓊脂糖凝膠電泳分析樣品以分離模板DNA(5.5kb,,未切割)和消化產(chǎn)物(可變尺寸)。
Products | Catalog # | Pack Size |
---|---|---|
XactEdit™ Cas9 Nuclease (NLS) kit Includes 10X XactEdit™ Digestion Buffer, Template for scrambled gRNA, Nuclease-free water | CE1000-50K | 50 µg |
XactEdit™ Cas9 Nuclease (NLS) 1 mg/mL | CE1000-50 | 50 µg |
XactEdit™ Cas9 Nuclease (NLS) 1 mg/mL | CE1000-250 | 5 x 50 µg |
XactEdit™ Cas9 Nuclease (NLS) 10 mg/mL | CE1001-250 | 250 µg |
XactEdit™ Cas9 Nuclease (NLS) 10 mg/mL | CE1001-1000 | 1000 µg |
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