實(shí)驗(yàn)室用水在質(zhì)譜分析中扮演著重要角色。下面以除草劑西瑪津分析為例 ,，可以看到空白溶液用水中TOC含量較高時(shí),，背景噪聲較高，影響西瑪津的定性和定量檢測(cè),。

將上述空白溶液用水替換為Milli-Q^®超純水（低TOC含量）,，并對(duì)奶粉樣品中的雙酚-A進(jìn)行分析，可以看到背景噪音明顯下降，能夠清楚看到目標(biāo)檢測(cè)物的特征峰,，峰形較好且呈現(xiàn)正態(tài)分布,。管中窺豹，水質(zhì)對(duì)于質(zhì)譜分析的重要意義可見一斑,。

除此之外，水中的離子也會(huì)影響質(zhì)譜分析,。比如鈉離子,，鉀離子可能會(huì)與有機(jī)物形成加和物；水中離子污染還可能在ICP-MS中形成多原離子干擾,；同時(shí)其他污染物比如顆粒,，細(xì)菌會(huì)給質(zhì)譜等高精密分析設(shè)備帶來機(jī)械性損傷，導(dǎo)致儀器維護(hù)成本增高,，增加用戶不必要的支出,。