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PCR的基本原理

時間:2023/6/15閱讀:2344
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1概述
聚合酶鏈式反應(yīng)(Polymerase chain reaction,,縮寫:PCR,又稱多聚酶鏈式反應(yīng)),,是一項利用DNA雙鏈復(fù)制的原理,,在生物體外復(fù)制特定DNA片段的核酸合成技術(shù)。透過這項技術(shù),,可在短時間內(nèi)大量擴增目的基因,,而不必依賴大腸桿菌或酵母菌等生物體。

2 PCR原理
PCR技術(shù)的基本原理首先基于DNA半保留復(fù)制原理,,還有堿基互補配對原則,,即復(fù)制的過程中雙鏈DNA會解鏈,由雙鏈變成單鏈,,溫度一般為95℃,;之后溫度降下來,引物會結(jié)合到DNA單鏈上,,在DNA聚合酶的作用下,,把游離的dNTP按照堿基互補配對原則結(jié)合到單鏈上,形成一條由舊鏈和新鏈雜合成的新的雙鏈DNA,。這個過程可概括為‘變性-退火-延伸’三個基本步驟,。

一般的聚合酶鏈式反應(yīng)由20到35個循環(huán)組成,每個循環(huán)包括以下3個步驟:

變性:利用高溫(94℃~98℃)使雙鏈DNA分離,。高溫將連接兩條DNA鏈的氫鍵打斷,。在第一個循環(huán)之前,通常加熱長一些時間以確保模板和引物全分離,,僅以單鏈形式存在,。該步驟時間1~2分鐘,接下來機器就控制溫度進入循環(huán)階段,。

退火(又稱復(fù)性,、降溫貼合、緩冷配對,、引物黏合):在DNA雙鏈分離后,,降低溫度使得引物可以結(jié)合于單鏈DNA上,。此階段的溫度通常低于引物熔點5℃。錯誤的退火溫度可能導(dǎo)致引物不與模板結(jié)合或者錯誤地結(jié)合,。該步驟時間1~2分鐘,。新技術(shù)的融合型核酸聚合酶在此階段的溫度會高于熔點3~5℃,僅需時間5~10秒,。

延伸:DNA聚合酶由降溫時結(jié)合上的引物開始沿著DNA鏈合成互補鏈,。此階段的溫度依賴于DNA聚合酶。該步驟時間依賴于聚合酶以及需要合成的DNA片段長度,。傳統(tǒng)的Taq估計合成1000 bp大概需要1分鐘,、較新的Tbr(來自于嗜熱菌Thermus brockianus)約40秒、商業(yè)公司生產(chǎn)的融合型聚合酶僅需約10-15秒,。有修正功能的則會比較慢,。

3 PCR反應(yīng)體系表1 標準的PCR反應(yīng)體系

組分用量
10×擴增緩沖液10μl
4種dNTP混合物200μl
引物10~100μl
模板DNA0.1~2μg
Taq DNA聚合酶2.5 μl
Mg2+1.5mmol/L
加雙蒸水100 μl


4 PCR反應(yīng)特點

4.1特異性強   
PCR反應(yīng)的特異性決定因素為:
①引物與模板DNA特異正確的結(jié)合;
②堿基配對原則,;
③Taq DNA聚合酶合成反應(yīng)的忠實性,;
④靶基因的特異性與保守性。
4.2 靈敏度高
PCR產(chǎn)物的生成量是以指數(shù)方式增加的,,能將皮克(pg=10-12)量級的起始待測模板擴增到微克(μg=10-6)水平,。能從100萬個細胞中檢出一個靶細胞;在病毒的檢測中,,PCR的靈敏度可達3個RFU(空斑形成單位),;在細菌學(xué)中最小檢出率為3個細菌。
4.3簡便,、快速
PCR反應(yīng)用耐高溫的Taq DNA聚合酶,,一次性地將反應(yīng)液加好后,經(jīng)過變性-退火-延伸反應(yīng),,一般在2~4 小時完成擴增反應(yīng),。擴增產(chǎn)物一般用電泳分析,不一定要用同位素,,無放射性污染,、易推廣。
4.4 對標本的純度要求低
不需要分離病毒或細菌及培養(yǎng)細胞,,DNA粗制品及RNA均可作為擴增模板,。可直接用臨床標本如血液,、體腔液,、洗嗽液、毛發(fā),、細胞,、活組織等DNA擴增檢測,。


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