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PCR就是利用DNA聚合酶對特定基因做體外或試管內(nèi)In Vitro的大量合成,基本上它是利用DNA聚合酶進行專一性的連鎖復制。目前常用的技術(shù),,可以將一段基因復制為原來的一百億至一千億倍,。根據(jù)DNA擴增的目的和檢測的標準,,可以將PCR儀分為普通PCR儀,梯度PCR儀,原位PCR儀,實時熒光定量PCR儀四類,。
基本要素
基本的PCR須具備
1.要被復制的DNA模板 Template
2.界定復制范圍兩端的引物Primers.
3.DNA聚合酶Taq. Polymearse
4.合成的原料(四種脫氧核苷酸)及水。
工作原理
利用升溫使DNA變性,在聚合酶的作用下使單鏈復制成雙鏈,,進而達到基因復制的目的,。
反應步驟
分別是1. Denaturation 2. Annealing of primers,3. Extension of primers。 所謂 Denaturing乃是將DNA加熱(至90~95℃)變性,, 將雙股的DNA加熱后轉(zhuǎn)為單股DNA以做為復制的模板. 而Annealing 則是令 Primers于一定的溫度下(冷卻至55~60℃)附著于模板DNA兩端,。 后在DNA聚合酶e.g. Taq-polymerase 的作用下(加熱至70~75℃)進行引物的延長 Extension of primers及另一股的合成。
PCR的早設想核酸研究已有100多年的歷史,,二十世紀60年代末,、70年代初人們致力于研究基因的體外分離技術(shù),Korana于1971年早提出核酸體外擴增的設想:“經(jīng)過DNA變性,,與合適的引物雜交,,用DNA聚合酶延伸引物,,并不斷重復該過程便可克隆tRNA基因”,。
實現(xiàn)
1985年美國PE-Cetus公司人類遺傳研究室的Mullis 等發(fā)明了具有劃時代意義的聚合酶鏈反應。其原理類似于DNA的體內(nèi)復制,,只是改進與完善Mullis初使用的DNA聚合酶是大腸桿菌 DNA 聚合酶 I 的Klenow片段,,其缺點是:
①Klenow酶不耐高溫, 90℃會變性失活,,每次循環(huán)都要重新加,。
②引物鏈延伸反應在37℃下進行,容易發(fā)生模板和引物之間的堿基錯配,,其PCR產(chǎn)物特異性較差,,合成的DNA片段不均一。此種以Klenow酶催化的PCR技術(shù)雖較傳統(tǒng)的基因擴增具備許多突出的優(yōu)點,,但由于Klenow酶不耐熱,,在DNA模板進行熱變性時,會導致此酶鈍化,,每加入一次酶只能完成一個擴增反應周期,,給PCR技術(shù)操作程序添了不少困難。這使得PCR技術(shù)在一段時間內(nèi)沒能引起生物醫(yī)學界的足夠重視,。
1988年初,,Keohanog改用T4 DNA聚合酶進行PCR,其擴增的DNA片段很均一,,真實性也較高,,只有所期望的一種DNA片段。但每循環(huán)一次,,仍需加入新酶,。
1988年Saiki 等從溫泉中分離的一株水生嗜熱桿菌thermus aquaticus 中提取到一種耐熱DNA聚合酶。 此酶具有以下特點:①耐高溫,在70℃下反應2h后其殘留活性大于原來的90%,,在93℃下反應2h后其殘留活性是原來的60%,,在95℃下反應2h后其殘留活性是原來的40%。②在熱變性時不會被鈍化,,不必在每次擴增反應后再加新酶,。③大大提高了擴增片段特異性和擴增效率,增加了擴增長度2.0Kb,。由于提高了擴增的特異性和效率,,因而其靈敏性也大大提高。為與大腸桿菌多聚酶IKlenow片段區(qū)別,,將此酶命名為TaqDNA多聚酶Taq DNAPolymerase,。此酶的發(fā)現(xiàn)使PCR廣泛的被應用。
分類
普通的PCR儀
把一次PCR擴增只能運行一個特定退火溫度的PCR儀,,叫傳統(tǒng)的PCR儀,,也叫普通PCR儀。如果要做不同的退火溫度需要多次運行,。主要是做簡單的,,對目的基因退火溫度的擴增。該儀器主要應用于科研研究,,教學,,醫(yī)學臨床,檢驗檢疫等機構(gòu),。
梯度PCR儀
把一次性PCR擴增可以設置一系列不同的退火溫度條件(溫度梯度),,通常有12種溫度梯度,這樣的儀器就叫梯度PCR儀,。因為被擴增的不同DNA片段,,其適退火溫度是不同的,通過設置一系列的梯度退火溫度進行擴增,,從而一次性PCR擴增,,就可以篩選出表達量高的適退火溫度,進行有效的擴增,。主要用于研究未知DNA退火溫度的擴增,,這樣節(jié)約成本的同時也節(jié)約了時間。主要用于科研,,教學機構(gòu),。梯度PCR儀,在不設置梯度的情況下也可以做普通PCR擴增,。具有雙槽梯度的不多,,領(lǐng)成具備此功能,。
原位PCR儀
用于從細胞內(nèi)靶DNA的定位分析的細胞內(nèi)基因擴增儀,如病源基因在細胞的位置或目的基因在細胞內(nèi)的作用位置等,。是保持細胞或組織的完整性,,使PCR反應體系滲透到組織和細胞中,在細胞的靶DNA所在的位置上進行基因擴增,,不但可以檢測到靶DNA,,又能標出靶序列在細胞內(nèi)的位置,于分子和細胞水平上研究疾病的發(fā)病機理和臨床過程及病理的轉(zhuǎn)變有重大的實用價值,。
實時熒光定量PCR儀
在普通PCR儀的基礎(chǔ)上增加一個熒光信號采集系統(tǒng)和計算機分析處理系統(tǒng),,就成了熒光定量PCR儀。其PCR擴增原理和普通PCR儀擴增原理相同,,只是PCR擴增時加入的引物是利用同位素,、熒光素等進行標記,使用引物和熒光探針同時與模板特異性結(jié)合擴增,。擴增的結(jié)果通過熒光信號采集系統(tǒng)實時采集信號連接輸送到計算機分析處理系統(tǒng)得出量化的實時結(jié)果輸出,。把這PCR儀叫做實時熒光定量PCR儀(qPCR儀)
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