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中級(jí)會(huì)員 | 第22年

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詳述ABI Prism 7000型定量PCR儀使用說明

時(shí)間:2017/1/5閱讀:3497
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熒光定量PCR 因操作方便,、運(yùn)行速度快,、實(shí)驗(yàn)結(jié)果準(zhǔn)確,受到越來越多的分子生物學(xué)研究者青睞,。在實(shí)驗(yàn)過程中您又該如何準(zhǔn)確操作熒光定量PCR呢,?今天小編就為您列舉一款熒光定量PCR儀的操作步驟:

ABI Prism 7000型定量PCR儀

1、新建文件菜單File → New,,Assay選擇Absolute Quantification(實(shí)時(shí)定量模式),,打開一個(gè)空白的96孔板文件。
2,、探針設(shè)置雙擊任意一個(gè)孔,,打開Well Inspector窗口。該窗口也可以從菜單View → Well Inspector打開,。
3,、使用軟件,或者探針(Detector)沒有設(shè)置好,,請點(diǎn)擊Add Detector按鈕,,打開Detector 
Manager窗口。該窗口也可以從菜單Tools → Detector Manager打開,。如果Detector列表中沒有合適的探針,,點(diǎn)擊按鈕File → 
New,新建探針:設(shè)定探針的名稱(建議使用所研究基因符號(hào)加標(biāo)記熒光,,如GAPDH_FAM,、ACTIN_VIC等)、報(bào)告基團(tuán)(FAM或者VIC)、淬滅基團(tuán)(TaqMan探針選TAMRA,;MGB探針選None),、顏色(任意)等。設(shè)置完成后點(diǎn)擊OK,,該探針即出現(xiàn)在探針列表中,。重復(fù)此過程,設(shè)立其他的探針,。
4,、在Detector Manager窗口,從探針列表中點(diǎn)擊選擇所需探針,,按住Ctrl鍵可以選擇多個(gè)探針,,再點(diǎn)擊Add to Plate 
Document按鈕。較為后點(diǎn)擊Done關(guān)閉Detector Manager窗口,。此時(shí)Well Inspector窗口仍然是打開的。
5,、填樣品表在96孔表中選定有樣品的一個(gè)或多個(gè)孔,,在Well Inspector頁面的Sample 
Name欄中填入樣品名稱;在探針列表的Use項(xiàng)下的方框中,,打鉤選擇要用的一個(gè)或多個(gè)探針,;在Task欄中選擇樣品類領(lǐng):陰性對照選NTC;未知樣品選Unknown,;標(biāo)準(zhǔn)品選Standard,。對于Standard,還要在Quantity欄中輸入DNA拷貝數(shù),。注意:只有在這里輸入拷貝數(shù)后,,軟件才能自動(dòng)生成標(biāo)準(zhǔn)曲線。建議標(biāo)準(zhǔn)品的濃度在5點(diǎn)以上,。建議每個(gè)樣品(包括標(biāo)準(zhǔn)品)都按照統(tǒng)計(jì)學(xué)要求作一定數(shù)量的復(fù)管,。
6、參比熒光如果使用的是ABI公司的定量PCR試劑,,如TaqMan Universal PCR Master Mix或者SYBR Green PCR 
Master Mix等,,參比熒光(Passive 
Reference)選ROX;如果使用的試劑中不含有參比熒光,,請選None,。完成后點(diǎn)擊右上角的X按鈕,關(guān)閉Well Inspector窗口,。
7,、循環(huán)參數(shù)切換到Instrument頁面,設(shè)定及修改PCR熱循環(huán)程序:在ABI公司默認(rèn)的程序中,,50℃


min是UNG酶起作用的步驟,,UNG酶可以預(yù)防PCR產(chǎn)物(其中以U代替T)對定量PCR的污染,;95℃ 10 
min的作用是激活Taq酶,同時(shí)滅活UNG酶,;40個(gè)循環(huán)的95℃ 15 sec和60℃ 1 
min是定量PCR的循環(huán)步驟,。7000默認(rèn)在較為后一步,也就是60℃ 1 
min復(fù)性和延伸時(shí)收集熒光信號(hào),。如果使用ABI公司的定量PCR試劑,,上述參數(shù)不需要調(diào)整,直接運(yùn)行PCR循環(huán)就可以了,。在使用其他廠家試劑的情況下,,如果其中沒有UNG酶,請刪除50℃ 
2 min步驟,;如果使用的不是Taq酶而是其他普通的Taq酶,,請刪除95℃ 10 min步驟。
8,、循環(huán)參數(shù)的修改方法刪除:按住Shift鍵并在相應(yīng)的Stage或Step中點(diǎn)擊,,使該步驟被選中變黑,再按Del鍵即可刪除,。插入:在需要插入?yún)?shù)的位置點(diǎn)擊,,出現(xiàn)粗黑豎線后,分別點(diǎn)擊Add 
Hold,、Add Cycle或Add 
Step按鈕添加保溫,、循環(huán)或循環(huán)中的一個(gè)步驟。修改溫度和時(shí)間:拖動(dòng)鼠標(biāo),,選中需要修改的溫度或時(shí)間數(shù)字,,輸入新的數(shù)值即可。
9,、其他設(shè)置反應(yīng)體積:定量PCR的標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)體積是50 µL,;如果想修改的話,建議大于25 µL,。融解曲線試驗(yàn):在Dissociation 
Protocol選項(xiàng)左邊的方框中打鉤,,儀器即在定量PCR循環(huán)完成后繼續(xù)做融解曲線試驗(yàn)。如果是采用SYBR Green 
I染料方法進(jìn)行定量研究,,建議進(jìn)行融解曲線試驗(yàn),,以判定PCR反應(yīng)特異與否。單峰表示單一的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,,多峰表示PCR擴(kuò)增有雜帶,。注意:只有SYBR 
Green I染料方法才需要進(jìn)行融解曲線試驗(yàn),TaqMan探針和MGB探針法都不需要。9600 
Emulation:選中此項(xiàng),,即可使7000的升降溫速度減慢,,與9600和7700一樣,從而可以直接使用在9600,、7700型PCR儀上優(yōu)化好的循環(huán)條件,,而不需任何修改。
10,、啟動(dòng)擴(kuò)增點(diǎn)Save按鈕保存文件設(shè)置,。確認(rèn)96孔板或全部樣品管在主機(jī)內(nèi)放置妥當(dāng)后,點(diǎn)擊Start按鈕,,開始PCR循環(huán),。屏幕上動(dòng)態(tài)顯示PCR進(jìn)程和剩余時(shí)間。
11,、監(jiān)控進(jìn)程切換到Results頁面的Amp 
Plot子頁面,,可以實(shí)時(shí)顯示PCR曲線隨著循環(huán)增加而逐步增長的實(shí)際情況。如果Detector選FAM或VIC,,只顯示對應(yīng)探針的變化情況,;如果選All,則同時(shí)顯示所有探針的反應(yīng)進(jìn)程,。
12、保存結(jié)果程序結(jié)束后,,點(diǎn)Disconnect按鈕,,然后File → 
Save保存實(shí)驗(yàn)結(jié)果??梢员4鏋?sds格式,,也可以保存為.sdt格式,作為以后同類實(shí)驗(yàn)的模板,,節(jié)省軟件設(shè)置時(shí)間,。

以上的內(nèi)容就是今天小編要和大家分享的內(nèi)容,希望對大家有所幫助,,如想了解更多關(guān)于pcr儀或是有意向購買者,,巴玖?xí)o您一個(gè)滿意的服務(wù)!

 

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