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WB實驗蛋白marker,內參的重要性不可忽視
閱讀:31004 發(fā)布時間:2015-2-12嚴謹?shù)腤estern Blot實驗設計中要求有良好的參照體系,,對實驗結果分析是非常有用。特別是當實驗出現(xiàn)問題時,,借助參照體系很容易就可以查出問題所在,。良好的參照體系通常包括分子量Marker(用來確定蛋白條帶對應的分子量大小),,空白載體對照(如果是誘導表達體系還應該有誘導前的對照),已知量標準產物的正對照,;另外還有內參,。內參即是內部參照(Internal Control),對于哺乳動物細胞表達來說一般是指由管家基因編碼表達的蛋白(Housekeeping Proteins),,它們在各組織和細胞中的表達相對恒定,,在檢測蛋白的表達水平變化時常用它來做參照物。蛋白含量是肯定要測的,。首先合適的上樣蛋白,,western圖才比較比較美觀。而且對于需要半定量的western,,那是肯定要測含量后再做western了,。
1.marker呢,就相當于一把標尺,,用于驗證你的目的蛋白的分子量,,比如你的marker上有30和35kD的蛋白條帶,而你的目的蛋白是32kD,,跑膠以后你如果看到你的目的蛋白條帶在30和35kD之間,,就可以初步斷定是你的目的蛋白。
2. 內參呢,,內參也叫看家基因,,在組織或細胞中都會表達,且表達量在不同組織或細胞中幾乎是相同的,,一般有β-ACTIN,,GAPDH等。其作用有二,,1. 是看提取蛋白質量的好壞,。如果做western的時候,內參照蛋白有條帶,,而目的蛋白沒有,,說明蛋白的提取和轉膜等步驟沒有問題,是目的蛋白的抗體質量不好或者是稀釋倍數(shù)不對,。2. 是比較客觀的說明目的蛋白的表達情況,,消除上樣量等的誤差,。不同的標本之間由于蛋白提取的量有差別,可能強陽性的表達跑出來的帶很弱,。因此設立內參照,,比較不同標本之間的表達情況。
3. 測一下蛋白濃度再上樣,,這樣好點,。當然也看你的實驗室是定性還是定量了,定性的話,,我覺得可以不用測濃度,;要是準備定量,還是盡量保證上樣量一致吧,。