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WB實驗蛋白marker,,內(nèi)參的重要性不可忽視
閱讀:31845 發(fā)布時間:2015-2-12嚴(yán)謹(jǐn)?shù)腤estern Blot實驗設(shè)計中要求有良好的參照體系,,對實驗結(jié)果分析是非常有用,。特別是當(dāng)實驗出現(xiàn)問題時,借助參照體系很容易就可以查出問題所在,。良好的參照體系通常包括分子量Marker(用來確定蛋白條帶對應(yīng)的分子量大?。瞻纵d體對照(如果是誘導(dǎo)表達體系還應(yīng)該有誘導(dǎo)前的對照),,已知量標(biāo)準(zhǔn)產(chǎn)物的正對照,;另外還有內(nèi)參。內(nèi)參即是內(nèi)部參照(Internal Control),對于哺乳動物細(xì)胞表達來說一般是指由管家基因編碼表達的蛋白(Housekeeping Proteins),,它們在各組織和細(xì)胞中的表達相對恒定,,在檢測蛋白的表達水平變化時常用它來做參照物。蛋白含量是肯定要測的,。首先合適的上樣蛋白,,western圖才比較比較美觀。而且對于需要半定量的western,,那是肯定要測含量后再做western了,。
1.marker呢,就相當(dāng)于一把標(biāo)尺,,用于驗證你的目的蛋白的分子量,,比如你的marker上有30和35kD的蛋白條帶,而你的目的蛋白是32kD,,跑膠以后你如果看到你的目的蛋白條帶在30和35kD之間,,就可以初步斷定是你的目的蛋白。
2. 內(nèi)參呢,,內(nèi)參也叫看家基因,,在組織或細(xì)胞中都會表達,且表達量在不同組織或細(xì)胞中幾乎是相同的,,一般有β-ACTIN,,GAPDH等。其作用有二,,1. 是看提取蛋白質(zhì)量的好壞,。如果做western的時候,內(nèi)參照蛋白有條帶,,而目的蛋白沒有,,說明蛋白的提取和轉(zhuǎn)膜等步驟沒有問題,是目的蛋白的抗體質(zhì)量不好或者是稀釋倍數(shù)不對,。2. 是比較客觀的說明目的蛋白的表達情況,,消除上樣量等的誤差。不同的標(biāo)本之間由于蛋白提取的量有差別,,可能強陽性的表達跑出來的帶很弱,。因此設(shè)立內(nèi)參照,比較不同標(biāo)本之間的表達情況,。
3. 測一下蛋白濃度再上樣,,這樣好點。當(dāng)然也看你的實驗室是定性還是定量了,,定性的話,,我覺得可以不用測濃度;要是準(zhǔn)備定量,還是盡量保證上樣量一致吧,。