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技術(shù)專欄:磷酸化蛋白WB實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng)
閱讀:947 發(fā)布時(shí)間:2024-4-28蛋白磷酸化是一種非常重要的翻譯后加工,做信號通路必然是要檢測蛋白磷酸化的,,Western blot是評估蛋白磷酸化狀態(tài)的常用方法,,其實(shí)和跑正常蛋白沒什么出入,只不過孵育的是識別磷酸化的抗體,。下面恒遠(yuǎn)生物帶大家總結(jié)一下實(shí)驗(yàn)中的注意要點(diǎn),。
一、關(guān)于磷酸化蛋白樣品
裂解液問題蛋白的磷酸化是一個(gè)非常迅速的反應(yīng),,取樣品的過程要迅速,,樣品要新鮮,樣品處理最好在冰上操作,操作時(shí)間盡量短,。用PBS洗滌細(xì)胞時(shí),,PBS一定要4℃預(yù)冷。如果是組織的話,,提取蛋白時(shí)采用液氮研磨的方法,,研磨器具最好提前預(yù)冷,保持低溫的狀態(tài),。
提取磷酸化蛋白的裂解液最好是新鮮配制,,裂解液中一定要有蛋白酶抑制劑和磷酸酶抑制劑,否則即使條帶壓出來也會很淺,,結(jié)果也不可信,。okadaic acid,NaF是磷酸酶抑制劑,。再者,,還要看你檢測的蛋白磷酸化位點(diǎn)是什么氨基酸。
二,、關(guān)于WB時(shí)背景和條帶的問題
磷酸化蛋白WB時(shí)背景也往往較深,所以壓片時(shí)間要適當(dāng),,不能太長或過短,,太長則背景太深蓋住想要的那條帶,時(shí)間過短則可能沒有條帶或者條帶太淺,。做磷酸化蛋白WB時(shí),,除了目標(biāo)蛋白的條帶以外,往往會出現(xiàn)非特異性的條帶,。磷酸化抗體不好的話,,甚至?xí)撼龇翘禺愋缘臈l帶,反而沒有你想要的條帶,,所以壓片后,,一定要根據(jù)Markers比對一下你壓出的條帶分子量是否正確。
三,、關(guān)于蛋白總的表達(dá)量問題
研究完某一蛋白的磷酸化情況后最好也要研究一下該蛋白總的表達(dá)量,。這有兩種方法,一是:相同的樣品在不同的孔中上樣兩次(可在相同的膠上,,也可在不同的膠上),,其一壓磷酸化蛋白,另一壓該蛋白總的表達(dá)量(包括磷酸化和未磷酸化的該蛋白),,甚至還可跑另一個(gè)膠,,壓內(nèi)標(biāo)。但是一般不建議如此做,因?yàn)檫@樣比較時(shí)誤差還是較大的,。因此,,比較常用的方法,即用strip液將原先結(jié)合上的磷酸化抗體及二抗洗去,,然后用同一張膜壓總蛋白,。然后再洗脫一次,再壓內(nèi)標(biāo),。
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