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[ELISA試劑盒]哺乳動物細胞的裂解和提取步驟
閱讀:3062 發(fā)布時間:2012-11-22 一細胞的裂解
單層細胞的裂解
懸浮培養(yǎng)的細胞或組織單細胞懸液的裂解
a.單層細胞的裂解
a)吸出培養(yǎng)液,以7ml用冰預(yù)冷的無鈣鎂離子磷酸緩沖鹽溶液PBS沖洗細胞培養(yǎng)皿內(nèi)的單層細胞,,重復(fù)1次,將平板置于冰上直至所有單層細胞沖洗完畢,。也可將平板放在一塊鋁板上,,再將鋁板置于冰盤上,。
b)直徑為90mm的培養(yǎng)皿需加0.5ml RNA提取緩沖液, 并使之遍布整個平板的表面,。
RNA提取緩沖注液
0.14mol/L NaCl
1.5mmol/L MgCl2
10mmol/L Tris.Cl(pH8.6)
0.5%NP-40
1mmol/L二硫蘇糖醇(DTT)
100單位/ml胎盤RNA酶抑制劑或20mmol/L氧釩核糖核苷復(fù)合物
c)加0.5ml蛋白酶消化緩沖液,,用刮棒混勻粘稠狀裂解物并將其刮到平板的邊緣。
蛋白酶消化緩沖液
0.2mol/L Tris.Cl(pH8.0)
25mmol/L EDTA(pH8.0)
0.3mol/L NaCl
2% SDS
d)用裝有21號針頭的皮下注射器抽吸細胞裂解物,,再將其注入聚丙烯管內(nèi),。重復(fù)3-4次,剪切DNA,。
c)加蛋白酶K至終濃度為200μg/ml,,充分混勻后置于37℃溫育30分鐘。
蛋白酶K以貯存液的形式保存,,貯存液為20mg/ml 蛋白K溶液,。
b.懸浮培養(yǎng)的細胞或組織單細胞懸液的裂解
a)于4℃以2000g離心5分鐘收集細胞,以10倍體積用冰預(yù)冷的無鈣鎂離子磷酸緩沖液懸沉淀,,洗滌細胞3次,,每次均用大口徑的吸管輕輕吹打細胞沉淀,使其*分散,。
b)估計細胞沉淀的體積,,用10-20倍體積的RNA提取緩沖液重懸之。
c)加入與步驟b)所加RNA提取緩沖液體相同的蛋白酶消化緩沖液,,用振蕩器迅速混勻,。用裝有21號針頭的皮下注射器抽吸細胞裂解物,再將其注入聚丙烯管內(nèi),。重復(fù)3-4次,,剪切DNA。
d)加蛋白酶K至終濃度為200μg/ml,,充分混勻后置于37℃溫育30分鐘,。蛋白酶K以貯存的形式保存,貯存液為20μg/ml蛋白酶K水溶液,。
二提取步驟
1)用等體積酚:氯仿抽提1次,,以去除蛋白質(zhì)。
2)用吊桶式轉(zhuǎn)頭于室溫以5000g離心10分鐘使水相與有機相分相,, 將水相吸至一個新的離心管內(nèi),,加2.5倍體積用冰預(yù)次序的乙醇,充分混勻,, 于0℃放置1小時,。
3)于0℃以5000g離心10分鐘沉淀RNA,棄上清,用含0.1mol/L 乙酸鈉(pH5.2)的70%乙酸洗滌沉淀,,用自動微量移液器盡可能將乙醇吸盡,, 隨后于室溫放置幾分鐘,晾干沉淀,。切勿抽干沉淀,,因為干的核酸沉淀很難溶解。
4)每個直徑為90mm的培養(yǎng)皿或每107細胞加200μl 50mmol/L Tris.Cl( pH7.8)1mmol/L EDTA(pH8.0)溶液重溶沉淀,。
5)分別按10mmol/L和0.1mmol/L的深度加MgCl2和二硫蘇糖醇(DTT),,然后分別按1000單位/或10mmol/L 的終深度加臺盤RNA酶抑制劑或氧釩核苷復(fù)合物。
6)加入無RNA酶的胰DNA酶I至終濃度為2μg/ml,,混勻,,于37℃溫育60分鐘。
7)分別按10mmol/L和0.2%的終濃度加EDTA和SDS,。
8)用等體積酚:氯仿抽提1次。
9)于室溫以5000g離心10分鐘使水相與有機相分相,, 將水相吸至另一個離心管內(nèi),,加3mol/L乙酸鈉(pH5.2)至終濃度為0.3mol/L,加2.5倍體積用冰預(yù)次的乙醇,,充分混勻,,冰浴放置2小時。
10)用微量離心機于4℃以12 000g離心5分鐘沉淀RNA,。
11)吸出所有的乙醇,,將打開管蓋的離心管在實驗臺放置幾分鐘,讓zui后殘存的痕量乙醇揮發(fā)干凈,。
12)用200μl TE(pH7.6)重溶沉淀,,加500μl乙醇,于-70 ℃貯存?zhèn)溆??;厥誅NA時,只須取出1小份貯存液,,加入3mol/L乙酸鈉(pH5.2 )至終濃度為0.3mol/L,,充分混勻,用微量離心機于4℃以12 000g離心5分鐘即可,。
三注意事項
1.測定zui終所得溶液的OD260值可以確定RNA的濃度,。取10μl乙醇/TE混合液[步驟13)]離心沉淀RNA,以400水重溶,, 測定OD260 值,, OD260=1的RNA溶液每毫升約含40μg RNA。
2.如果需要,可用oligo(dT) -纖維素層析法從所制備的細胞總RNA中純化無寡脫氧核糖核苷酸污染的mRNA或購買試劑盒進行mRNA的純化,。
3.某些情況下(例如從感染了DNA病毒或用DNA轉(zhuǎn)染的細胞中制備RNA時),,必須從細胞總RNA中去除寡脫氧核核苷酸。否則,,當(dāng)用這種RNA構(gòu)建cDNA庫或進行引物延伸反應(yīng)時應(yīng)會出問題,, 反轉(zhuǎn)錄過程中法染的模板DNA 片段可能會與RNA雜交而充當(dāng)引物,從而導(dǎo)致物定mRNA5'末端定位的錯誤或產(chǎn)生截短的cDNA克隆,。
a)步驟12后,,加200μl 3mol/L乙酸鈉(pH5.2),用自動微量移液器反復(fù)吹吸,,以重懸核酸沉淀,,將懸浮液移至另一個滅菌的微量離心管內(nèi)。
b)用微量離心機于室溫以12 000g離心10分鐘,,RNA沉于管底,,而絕大部分寡脫氧核糖核苷酸仍在上清中。
c)棄上清液,,用200μl TE(pH7.6)重溶沉淀,。加入20μl 3mol/L乙酸鈉(pH5.2),分混勻,,加入550μl用冰預(yù)冷的乙醇,。混勻溶液,, 在冰上驟冷30分鐘,。用微量離心機于4℃以12 000g離主10分鐘,以回收RNA,。小心吸出上清,。d)棄上清液,用300μl TE(pH7.6)重溶沉淀,,加1ml乙醇,,-70℃貯存?zhèn)溆谩?br />回收RNA時,只需取出1小份貯存液,,加3mol乙酸鈉(pH5.2 )至終濃度為0.3mol/L充分混勻,,用微量離心機于4℃以12 000g離心5分鐘即可。如需去除氧釩核糖核苷復(fù)合物,,用含0.1%羥喹啉的苯酚[用0.01mol/L Tris.Cl(pH7.8)平衡]將RNA終溶液抽提數(shù)次即可,。
4. 對大多數(shù)細胞株來說, 一個直徑90mm 培養(yǎng)甲中培養(yǎng)的RNA收率為100-200μg
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