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Echo如何以快速,、精|準、任意孔到任意孔移液加快細胞株開發(fā)
細胞株構(gòu)建是生物學(xué)常用的工具之一,,也是很多項目的關(guān)鍵步驟,構(gòu)建一個好的細胞株也就成功了一半,。但目前我們可能更多關(guān)注的是下游的細胞實驗,,例如獲得的構(gòu)建好的質(zhì)粒轉(zhuǎn)染,、富集,、篩選,、優(yōu)化及放大等等。而且已經(jīng)有很成熟的自動化設(shè)備來幫助我們進行相應(yīng)的液體操作,,包括貝克曼也有全套的自動化解決方案,。但這些前提都是我們獲得了一個優(yōu)質(zhì)的質(zhì)粒。如果不是呢,?
那我們該如何快速又系統(tǒng)的設(shè)計我們想要的細胞株呢,?如何提高細胞株效能,,降低風(fēng)險,?有如何利用有限的資源更快的做更多的測試,?
基因-蛋白-細胞,,系統(tǒng)化設(shè)計
非常幸運的是,,分子生物學(xué)和生物信息學(xué)技術(shù)的發(fā)展,,給了我們從基因,、蛋白,、細胞層面等系統(tǒng)設(shè)計的可能,各種新的思路和新的技術(shù),,如基因組裝、基因編輯,、PCR,、NGS測序技術(shù)和TXTL無細胞表達系統(tǒng)等技術(shù)可以幫助我們開展測試。
Echo微量化,,顯著降低成本,,讓新技術(shù)更經(jīng)濟
系統(tǒng)化的設(shè)計必然會帶來更大的樣本量,,從而導(dǎo)致更高的費用,這也是大家對新技術(shù)和多因素考慮一個望而卻步的原因,。Echo采用聲波的能量進行無接觸式移液,,且每滴液滴僅為2.5nL或25nL,因此可以直接省去吸頭耗材的消耗,,也可以將檢測反應(yīng)體系降低5-100倍,,使成本急劇下降。
Echo快速任意孔到任意孔移液,,加快組裝,使結(jié)果更一致
在基因組裝中將不同的DNA|片段混合,,在檢測反應(yīng)中將不同的成本組合,,在NGS文庫構(gòu)建過程中將多個文庫pooling到一起,在CRISPr基因編輯中構(gòu)建sgRNA文庫等等,,都需要進行快速,、變化體積,、靈活加樣,這也是傳統(tǒng)移液工作站很難突破的一點,,往往也要1小時甚至幾小時才能完成。聲波移液技術(shù)Echo的任意孔到任意孔的快速移液特點則讓此類應(yīng)用簡單,、快速化,,僅需幾分鐘即可,大大優(yōu)化工作流,。
Echo加樣精|準,,提高克隆效率
使用Echo進行微量化DNA組裝,可以在構(gòu)建更低的情況下獲得更高的轉(zhuǎn)化效率,。在Gibson組裝中,,反應(yīng)體系500nL和1000nL時轉(zhuǎn)化效率不差于手工操作20uL,反應(yīng)體系降低40倍,;在Golden Gate組裝中,表現(xiàn)更優(yōu)|秀,,反應(yīng)體系低至50nL時轉(zhuǎn)化效率就不差于手動操作7.5uL,,反應(yīng)體系可降低150倍。
Echo以微量化,、納升精|準化,、快速任意孔到任意孔移液,加快細胞株開發(fā)
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Reference:
Smart DNA Fabrication Using Sound Waves: Applying Acoustic Dispensing Technologies to Synthetic Biology. Kanigowska et al. Journal of Laboratory Automation 1–8, 2015.
*以上涉及產(chǎn)品僅用于科研和工業(yè),不用于診斷