目標(biāo)區(qū)域捕獲測序技術(shù)，是根據(jù)已知特定基因組區(qū)域序列設(shè)計寡核苷酸探針,，通過雜交將目標(biāo)區(qū)域捕獲富集進(jìn)行二代測序,。其針對目標(biāo)區(qū)域深度測序，增加了檢查靈敏度和準(zhǔn)確性,。既滿足研究需求,，又降低測序成本，在科研,、臨床中均備受關(guān)注,。

液體處理專家貝克曼庫爾特推出Biomek 自動化捕獲測序方案，幫助您實現(xiàn)自動化,、標(biāo)準(zhǔn)化的捕獲測序,。 由自動化工作站進(jìn)行基因捕獲，可以減少手工操作時間,，提高工作效率,，增加結(jié)果的重復(fù)性和均一性。 Biomek工作站可實現(xiàn)從核酸提取,，文庫構(gòu)建,，定量混樣到捕獲的整體實驗流程。

Figure 1. 捕獲測序文庫構(gòu)建自動化流程

由Biomek成功自動化的雜交捕獲試劑盒：

   Agilent HaloPlex™ Target Enrichment - Ion Torrent

   Agilent SureSelect XT®

   Epicentre ScriptSeq® Complete Gold Low Input

   Illumina Nextera® Rapid Capture

   Illumina TruSeq® Exome

   Illumina TruSeq® Rapid Exome

   Illumina TruSight® Cancer

   Illumina TruSight® Tumor 15

   Illumina TruSight® Tumor 170

   IDT xGen® Exome Research Panel

   NEB NEBNext Direct™ Cancer HotSpot Panel

   Roche Nimblegen SeqCap EZ® for Illumina NGS

Biomek自動化捕獲測序數(shù)據(jù)展示

Figure 2. IDT xGen® Exome Research Panel試劑盒捕獲測序文庫制備,。

 上圖： 片段分析,，其中主峰1和2為雜交捕獲后cfDNA目標(biāo)片段峰；

 下圖：Qubit Fluorometric Quantification核酸定量結(jié)果,。

Figure 3. IDT xGen®雜交捕獲試劑盒歷史手工數(shù)據(jù)vs. 

Biomek i7自動化工作站完成數(shù)據(jù),。A. 平均中靶率,，B. 重復(fù)率，C. 覆蓋度,，D. GC偏移,。

Biomek向?qū)杰浖僮鹘缑?/span>

在軟件操作界面上用戶可以選擇樣本數(shù)量，是否使用臺面整合的PCR儀,，以及運行工作流程的哪個部分,。此外，具備臺面自動校對功能,，當(dāng)操作人員完成耗材擺放后,，工作站可根據(jù)攝像頭拍攝，自動判定耗材擺放是否正確,，對錯誤擺放位置進(jìn)行提示,。避免由于人為擺放耗材錯誤，導(dǎo)致設(shè)備碰撞或試劑,、時間損失。

Figure 4. 向?qū)杰浖僮?，IDT xGen® 雜交捕獲試劑盒方法選擇界面,。

Biomek自動化捕獲測序——實踐速度與通量的飛躍

Figure 5. 完成 24/48/96個樣本的自動化IDT xGen®雜交捕獲測序文庫制備預(yù)估耗時。