(1)熒光顯微鏡一般分為透射和落射式兩種類型:

　　a.透射式：激發(fā)光來自被檢物體的下方，聚光鏡為暗視野聚光鏡,，使激發(fā)光不進入物鏡,，而使熒光進入物鏡。它在低倍情況下明亮,，而高倍則暗,，在油浸和調中時,，較難操作,，尤以低倍的照明范圍難于確定，但能得到很暗的視野背景,。透射式不使用于非透明的被檢物體,。

　　b.落射式：透射式目前幾乎被淘汰，新型的熒光顯微鏡多為落射式,，光源來自被檢物體的上方,，在光路中具有分光鏡，所以對透明和不透明的被檢物體都適用,。由于物鏡起了聚光鏡的作用,，不僅便于操作，而且從低倍到高倍,，可以實現(xiàn)整個視場的均勻照明,。

　　(2)熒光鏡檢術的注意事項:

　　a.激發(fā)光長時間的照射，會發(fā)生熒光的衰減和淬滅現(xiàn)象，因此盡可能縮短觀察時間,，暫時不觀察時,，應用擋板遮蓋激發(fā)光。

　　b.作油鏡觀察時,，應用"無熒光油",。

　　c.熒光幾乎都較弱，應在較暗的室內(nèi)進行,。

　　d.電源裝穩(wěn)壓器,，否則電壓不穩(wěn)不僅會降低汞燈的壽命，也會影響鏡檢的效果,。

　　目前許多新興生物研究領域應用到熒光顯微鏡,，如基因原位雜交(fish)等等。