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摘要
分析儀器對于評估產(chǎn)品質(zhì)量和生物藥產(chǎn)品開發(fā)過程控制至關(guān)重要,它在制藥行業(yè)中應(yīng)用于各種應(yīng)用,,如與產(chǎn)品質(zhì)量相關(guān)的研究,,如單克隆抗體中的糖基分析和細(xì)胞培養(yǎng)基中氨基酸和代謝物濃度。盡管液相質(zhì)譜(LC-MS)具有靈活應(yīng)用解決復(fù)雜問題的能力,,但其實(shí)驗(yàn)開發(fā)通常比其他分析方法耗時更多,。最近,如908 Devices的REBEL等新型分析設(shè)備采用了操作簡化用戶友好的方法,,以替代傳統(tǒng)勞動密集型LC-MS,。REBEL是一種能夠快速定量氨基酸和其他重要代謝物,實(shí)現(xiàn)全面分析和高通量樣本測試的儀器,,而我們的目的是比較這一代分析平臺(908 Devices的REBEL)與經(jīng)典LC-ToF MS方法,,并評估數(shù)據(jù)質(zhì)量。
引言
生物制藥公司越來越關(guān)注培養(yǎng)基成分的理解和產(chǎn)品的質(zhì)量,,為了提高生產(chǎn)效率,,他們必須面對的是耗時的傳統(tǒng)方法。細(xì)胞系開發(fā)和優(yōu)化是過程策略的重要組成部分,。傳統(tǒng)上,,使用液相質(zhì)譜(LC-MS)進(jìn)行培養(yǎng)基營養(yǎng)和代謝組學(xué)研究,,這需要高度的技術(shù)專長,且耗時較長,。然而,,優(yōu)化實(shí)驗(yàn)需要對生物反應(yīng)器參數(shù)的實(shí)時監(jiān)測、過程分析和產(chǎn)品質(zhì)量屬性的結(jié)果來支持,。908 Devices的全自動培養(yǎng)基組分分析儀系統(tǒng),,即REBEL,作為一種新型分析儀器,,因其快速分析和簡單操作而受到生物制藥行業(yè)的廣泛關(guān)注,。
本文介紹REBEL替代傳統(tǒng)LC-MS方法,在生物反應(yīng)器培養(yǎng)基監(jiān)測方面的最新進(jìn)展,。REBEL進(jìn)行培養(yǎng)基分析的主要優(yōu)勢包括無需衍生化即可分析,、快速的分析時間和簡單的操作。然而,,由于該儀器是市場新秀,,其分析技術(shù)描述尚不充分。因此,,我們采用Waters的非衍生化和正相色譜方法,,使用BioAccord RDa飛行時間(ToF)LC-MS進(jìn)行培養(yǎng)基分析的比較。我們的目標(biāo)是展示REBEL和RDa培養(yǎng)基分析結(jié)果的可比性,,并探討兩種分析儀器方法的成本效益,。此外,我們將在實(shí)驗(yàn)室中建立這兩種分析方法,,以便在未來代謝研究中評估過程變化,、補(bǔ)料策略及其對產(chǎn)品質(zhì)量的影響,從而深化我們對關(guān)鍵過程參數(shù)及其對藥物產(chǎn)品質(zhì)量特性影響的理解,。
結(jié)果與討論
圖1. 生物反應(yīng)器1(頂部)和2(底部)的68到227小時的氨基酸濃度趨勢,,pH 設(shè)定在7.1。樣品由Waters BioAccord RDa LC-MS(藍(lán)色)和REBEL培養(yǎng)基分析儀(紅色)進(jìn)行分析,。
圖2. 生物反應(yīng)器3(頂部)和4(底部)的68到227小時的氨基酸濃度趨勢,,pH設(shè)定在 7.3。樣品由Waters BioAccord RDa LC-MS(藍(lán)色)和REBEL培養(yǎng)基分析儀(紅色)進(jìn)行分析,。
表1:REBEL和LC-MS之間的比較,其中+代表所需的技術(shù)專業(yè)知識或需要的數(shù)量,。
我們能夠成功地使用REBEL和BioAccord RDa LC-MS上的初步方法運(yùn)行所有樣品,,從而在UNIFI上創(chuàng)建一種處理方法,以在我們的RDa LC-質(zhì)譜分析中從標(biāo)準(zhǔn)校準(zhǔn)曲線中識別,、質(zhì)量確認(rèn)和量化所有氨基酸,。Rebel導(dǎo)出了所有氨基酸的計(jì)算濃度,,并創(chuàng)建了手動數(shù)據(jù)透視表來說明左側(cè)顯示的結(jié)果。生物反應(yīng)器復(fù)制品1和2在pH 7.1設(shè)定值下運(yùn)行,,并在整個培養(yǎng)物中顯示出相似的氨基酸趨勢(圖1),。類似地,生物反應(yīng)器復(fù)制品3和4在pH 7.3設(shè)定值下運(yùn)行時相互共享趨勢(圖2),。生物反應(yīng)器1-4的氨基酸趨勢以藍(lán)色表示用于BioAccord RDa LC-MS分析,,以紅色表示用于REBEL分析。REBEL和RDa LC-MS數(shù)據(jù)顯示所有反應(yīng)器的氨基酸趨勢相當(dāng),。對于樣品制備,,與RDa LC-MS的1:500相比,REBEL方法的樣品稀釋比例為1:100,,這表明RDa LC-MS的靈敏度至少是REBEL的五倍,。然而,我們可以看到,,RDa LC-MS中204和227小時氨基酸濃度的較晚時間點(diǎn)遠(yuǎn)高于REBEL,。這很可能是因?yàn)檫@些值是在標(biāo)準(zhǔn)曲線之外發(fā)現(xiàn)的,因此,,外推濃度會導(dǎo)致計(jì)算誤差,。REBEL只能分析33種分析物,包括22種氨基酸,、5種維生素和6種生物胺,,其中RDa是Tof LC-MS,可以分析這些和其他未知的分析物,。表1列出了REBEL與傳統(tǒng)LC-MS的比較,,其中REBEL易于使用,不需要太多時間或精力來操作,,但犧牲了在其范圍之外進(jìn)行分析的能力,,并且相比于TOF質(zhì)譜靈敏度略低。傳統(tǒng)的LC-MS方法可以以更好的靈敏度進(jìn)行專門優(yōu)化,,但這需要更高水平的技術(shù)技能,。REBEL為自動化分析提供了包羅萬象的試劑盒,但每個樣本的試劑盒分析成本遠(yuǎn)高于LC-MS方法所需的材料,??傮w而言,REBEL在其分析范圍內(nèi)以更高的運(yùn)行成本/表現(xiàn)相對較好,,但其易用性和快速分析是推進(jìn)實(shí)時過程優(yōu)化的主要優(yōu)勢,。
材料與方法
我們從Sartorius的AMBR250生物反應(yīng)器(VRC01 CHO細(xì)胞培養(yǎng))中采集每日樣本,進(jìn)行了一次10天的批次實(shí)驗(yàn)。重復(fù)的生物反應(yīng)器1和2的pH為7.1,,生物反應(yīng)器3和4的pH為7.3,,其余保持一致。樣本經(jīng)過處理和過濾,,用于分析細(xì)胞培養(yǎng)基反應(yīng)液的游離氨基酸濃度,。
REBEL的培養(yǎng)基分析試劑盒(908 Devices)提供了BGE溶液和稀釋液,還有預(yù)制好的標(biāo)準(zhǔn)品,。樣品用稀釋液稀釋100倍,。所有的濃度數(shù)據(jù)以.csv文件形式輸出。而BioAccord RDa(Waters)的LC-MS方法是基于Waters的應(yīng)用指南調(diào)整的,,以適應(yīng)Accuilty Patrols作為LC系統(tǒng)的特定設(shè)置,。氨基酸細(xì)胞培養(yǎng)標(biāo)準(zhǔn)品(Waters)根據(jù)說明書新鮮制備,每個氨基酸的6點(diǎn)校準(zhǔn)曲線為5uM-0.5uM,,除了2.5uM-0.25uM的胱氨酸,。新鮮制備樣品,并用0.1%甲酸以1:500稀釋,。用UNIFI(Waters)處理獲得的LC-MS數(shù)據(jù),,以創(chuàng)建標(biāo)準(zhǔn)曲線,識別和量化氨基酸濃度,。所有樣品(REBEL和BioAccord RDa)均進(jìn)行三次重復(fù),。
結(jié)論
我們的初步RDa LC-MS方法表明,REBEL細(xì)胞培養(yǎng)基分析儀收集的數(shù)據(jù)與CHO細(xì)胞培養(yǎng)生物反應(yīng)器具有可比性,。目前,,基于REBEL的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,我們正在優(yōu)化RDa LC-MS方法,,使用8點(diǎn)校準(zhǔn)曲線(范圍0.1-30uM),,以捕捉所有氨基酸濃度。一旦使用最終確定的RDa LC-MS方法對所有樣本進(jìn)行分析,,將進(jìn)行進(jìn)一步的方法比較和統(tǒng)計(jì)分析,。我們將評估零假設(shè)的方法,即用REBEL進(jìn)行的測量與用RDa LC-MS進(jìn)行的測量不同,,然后尋找基于數(shù)據(jù)的證據(jù),,證明測量是相同的。如果數(shù)據(jù)支持否定零假設(shè),,那么我們可以得出結(jié)論,,這些儀器在每次比較的代謝物測量中都具有同等的性能。未來的研究將進(jìn)一步測試REBEL評估代謝對產(chǎn)品質(zhì)量影響的能力,,例如溫度變化對代謝產(chǎn)物利用的影響及其對微生物反應(yīng)器中聚糖譜的影響,。由于細(xì)胞代謝可以在代謝產(chǎn)物的利用和濃度方面產(chǎn)生共線性,,我們將使用多變量數(shù)據(jù)分析(MVDA)來評估細(xì)胞代謝及其對聚糖譜的影響。REBEL的易用性和快速分析的優(yōu)勢允許更大的樣本通量,,同時保留與傳統(tǒng)LC-MS方法相似的數(shù)據(jù)質(zhì)量,以快速推進(jìn)我們對關(guān)鍵質(zhì)量屬性的影響的理解,,從而提高關(guān)鍵工藝參數(shù)的理解,。
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