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上海源葉生物科技有限公司
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35歲助理教授追逐表觀遺傳學(xué)的奧秘
2015-8-13 閱讀(352)
當(dāng)黃云（Yun “Nancy" Huang，音譯）還是一名大學(xué)生時(shí),，她一直希望成為一名醫(yī)生,，但在浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院獲得學(xué)士學(xué)位后，她的想法改變了,，“我意識到,，要治愈疾病，我還需要了解更多疾病的基礎(chǔ)生物學(xué)知識,。"
2005年,，黃云來到了美國，在喬治亞州立大學(xué)的Jenny Yang實(shí)驗(yàn)室開始攻讀生物化學(xué)博士學(xué)位,，Yang說,，“我還很清楚的記得她來到我們實(shí)驗(yàn)室的那一天，"當(dāng)時(shí)她讓黃云準(zhǔn)備一份后者并不了解的研究主題的介紹,，而這位初來乍到的學(xué)生立即回答道,，她將在下周準(zhǔn)備好?！八杆俚姆磻?yīng)和自信令我刮目相看,。"
Yang教授表示，她覺得比較于其他學(xué)生,，黃云主動性更強(qiáng),，“她好像毫無畏懼，"她說,。而這種壓力也為黃云帶來收獲：她找到了幾種結(jié)合細(xì)胞外鈣離子的受體,，并且在其博士四年時(shí)間里,，發(fā)表了五篇*作者文章。
2009年,，黃云獲得了博士學(xué)位,，又進(jìn)入了哈佛醫(yī)學(xué)院Anjana Rao表觀遺傳實(shí)驗(yàn)室從事博士后研究工作，一年后又選擇了La Jolla過敏與免疫學(xué)研究所工作,。Rao研究組剛剛發(fā)現(xiàn)了TET（ten-eleven translocation）蛋白,，這是一種α-酮戊二酸（α-KG）和Fe2+依賴的雙加氧酶，能催化5-甲基胞嘧啶（5-mC）轉(zhuǎn)化為5-羥甲基胞嘧啶（5-hmC）,，是DNA去甲基化過程中的一種重要的酶,。
一般來說，研究人員對TET蛋白活性的研究主要借助于一種稱為亞硫酸氫鹽測序的方法,，也就是利用亞硫酸氫鹽將單鏈DNA的胞嘧啶轉(zhuǎn)變?yōu)槟蜞奏?，保?’甲基胞嘧啶無變化,，在CpG兩端設(shè)計(jì)引物,，然后擴(kuò)增出所需片段后進(jìn)行測序，由于TG為非甲基化位點(diǎn),，CC為甲基化CG位點(diǎn),，因此可以了解CpG島內(nèi)所有的甲基化位點(diǎn)。2010年,，黃云與她的同事William Pastor 發(fā)表文章,，發(fā)現(xiàn)這種測序方法的一個(gè)問題：無法確定5-mC是否轉(zhuǎn)換成為了5-hmC。
一年后,，他們在Nature上發(fā)表文章,，開發(fā)出兩種方法分析5-羥甲基胞嘧啶（5hmC）的基因組定位。*種方法稱為GLIB,。GLIB是糖基化,、高碘酸氧化和生物素化的縮寫。它主要利用一些酶和化學(xué)反應(yīng)的組合來分離出包含單個(gè)5hmC的DNA片段,。首先利用T4噬菌體β-葡萄糖基轉(zhuǎn)移酶（BGT）在每個(gè)5hmC上添加一個(gè)葡萄糖分子,，然后用高碘酸鈉氧化葡萄糖，它將鄰近的羥基轉(zhuǎn)化成醛基,，之后用醛基反應(yīng)性探針進(jìn)一步修飾,，在每個(gè)5hmC上添加兩個(gè)生物素分子。
第二種方法是通過亞硫酸氫鈉處理基因組DNA,，將5hmC轉(zhuǎn)換成5-亞甲基磺酸胞嘧啶（CMS）,，然后利用CMS特異的抗血清將包含CMS的DNA免疫沉淀。這對于今后的甲基化研究至關(guān)重要,。
作為一名博士后,，黃云的努力得到了合作者們的認(rèn)可,，來自貝勒醫(yī)學(xué)院的Margaret Goodell就希望黃云能加入德州A&M大學(xué)健康科學(xué)中心，他表示,，“黃云能拓寬我們的思路,，也能提出非常有建設(shè)性的建議，我總是說,，你必須在科學(xué)中放開心胸，而她確實(shí)做到了這一點(diǎn),。"
