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35歲助理教授追逐表觀遺傳學(xué)的奧秘
2015-8-13 閱讀(366)
當(dāng)黃云（Yun “Nancy" Huang,，音譯）還是一名大學(xué)生時,，她一直希望成為一名醫(yī)生,，但在浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院獲得學(xué)士學(xué)位后,，她的想法改變了,，“我意識到,，要治愈疾病,，我還需要了解更多疾病的基礎(chǔ)生物學(xué)知識。"
2005年,，黃云來到了美國,，在喬治亞州立大學(xué)的Jenny Yang實驗室開始攻讀生物化學(xué)博士學(xué)位，Yang說,，“我還很清楚的記得她來到我們實驗室的那一天,，"當(dāng)時她讓黃云準(zhǔn)備一份后者并不了解的研究主題的介紹，而這位初來乍到的學(xué)生立即回答道,，她將在下周準(zhǔn)備好,。“她迅速的反應(yīng)和自信令我刮目相看,。"
Yang教授表示,，她覺得比較于其他學(xué)生，黃云主動性更強,，“她好像毫無畏懼,，"她說。而這種壓力也為黃云帶來收獲：她找到了幾種結(jié)合細胞外鈣離子的受體,，并且在其博士四年時間里,，發(fā)表了五篇*作者文章。
2009年,，黃云獲得了博士學(xué)位,，又進入了哈佛醫(yī)學(xué)院Anjana Rao表觀遺傳實驗室從事博士后研究工作，一年后又選擇了La Jolla過敏與免疫學(xué)研究所工作,。Rao研究組剛剛發(fā)現(xiàn)了TET（ten-eleven translocation）蛋白,，這是一種α-酮戊二酸（α-KG）和Fe2+依賴的雙加氧酶,，能催化5-甲基胞嘧啶（5-mC）轉(zhuǎn)化為5-羥甲基胞嘧啶（5-hmC），是DNA去甲基化過程中的一種重要的酶,。
一般來說,，研究人員對TET蛋白活性的研究主要借助于一種稱為亞硫酸氫鹽測序的方法，也就是利用亞硫酸氫鹽將單鏈DNA的胞嘧啶轉(zhuǎn)變?yōu)槟蜞奏?，保?’甲基胞嘧啶無變化,，在CpG兩端設(shè)計引物，然后擴增出所需片段后進行測序,，由于TG為非甲基化位點,，CC為甲基化CG位點，因此可以了解CpG島內(nèi)所有的甲基化位點,。2010年,，黃云與她的同事William Pastor 發(fā)表文章，發(fā)現(xiàn)這種測序方法的一個問題：無法確定5-mC是否轉(zhuǎn)換成為了5-hmC,。
一年后,，他們在Nature上發(fā)表文章，開發(fā)出兩種方法分析5-羥甲基胞嘧啶（5hmC）的基因組定位,。*種方法稱為GLIB,。GLIB是糖基化、高碘酸氧化和生物素化的縮寫,。它主要利用一些酶和化學(xué)反應(yīng)的組合來分離出包含單個5hmC的DNA片段,。首先利用T4噬菌體β-葡萄糖基轉(zhuǎn)移酶（BGT）在每個5hmC上添加一個葡萄糖分子，然后用高碘酸鈉氧化葡萄糖,，它將鄰近的羥基轉(zhuǎn)化成醛基,，之后用醛基反應(yīng)性探針進一步修飾，在每個5hmC上添加兩個生物素分子,。
第二種方法是通過亞硫酸氫鈉處理基因組DNA,，將5hmC轉(zhuǎn)換成5-亞甲基磺酸胞嘧啶（CMS），然后利用CMS特異的抗血清將包含CMS的DNA免疫沉淀,。這對于今后的甲基化研究至關(guān)重要,。
作為一名博士后，黃云的努力得到了合作者們的認可,，來自貝勒醫(yī)學(xué)院的Margaret Goodell就希望黃云能加入德州A&M大學(xué)健康科學(xué)中心，他表示,，“黃云能拓寬我們的思路,，也能提出非常有建設(shè)性的建議，我總是說,，你必須在科學(xué)中放開心胸,，而她確實做到了這一點,。"
