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罕見病診斷的新思路
2015-4-11 閱讀(298)
罕見病的診斷和治療一直都是難題,而測序技術(shù)的出現(xiàn)則帶來了一絲曙光,。一般來說,,患者出現(xiàn)一些癥狀后,通常先看醫(yī)生,,然后開展外顯子組測序,,并借助研究人員,找到分子機(jī)制,。然而,,根據(jù)《美國醫(yī)學(xué)會(huì)雜志》(JAMA)上的一篇文章,,這個(gè)順序現(xiàn)在反過來了。
文章講述了一個(gè)荷蘭男孩的故事,。他叫Vincent Pieterse,出生在2002年底,。在嬰兒時(shí)期,,他似乎很健康,不過隨著他漸漸長大,,出現(xiàn)了學(xué)習(xí)障礙、輕微自閉癥,、肌張力低下等癥狀,,這表明他可能患有遺傳綜合征,。不過,,神經(jīng)系統(tǒng)疾病和染色體異常的檢測結(jié)果均為陰性,而家族中也沒有親戚有相同的癥狀,。
在*莫展之時(shí),,他的父親Marc了解到外顯子組測序,并意識(shí)到這種方法能提供許多基因的信息,。于是,,他找到了荷蘭內(nèi)梅亨大學(xué)的Joris Veltman博士。在他的堅(jiān)持下,,Veltman博士同意對(duì)Vincent及其父母進(jìn)行外顯子組測序,。
測序發(fā)現(xiàn)Vincent編碼核糖體蛋白的基因上有一個(gè)de novo突變,但沒有數(shù)據(jù)表明這個(gè)突變?nèi)绾沃虏?。Marc查看了文獻(xiàn),,發(fā)現(xiàn)一種Diamond-Blackfan貧血(DBA)的癥狀與Vincent有些相似,不過Vincent并沒有貧血,,他的突變也從未與DBA相關(guān)聯(lián),。
于是,Marc了這篇文章的作者 – 美國施耐德兒童醫(yī)院的Jeffrey Lipton博士,。2014年秋季,,研究人員確認(rèn)Vincent的RNA加工是正常的,。不過Marc確認(rèn)他的兒子患有DBA,,于是他給十幾名研究這種疾病的研究人員發(fā)了郵件,,包括荷蘭Sanger Research and Landsteiner Laboratory的Alyson MacInnes博士,。
Alyson談道:“之前是患者拿著一系列特征來到診所,,進(jìn)行診斷,開展外顯子組測序,,然后借助研究人員找到分子機(jī)制,,而如今正相反?;颊吣弥怙@子組數(shù)據(jù),,研究人員,推測疾病的機(jī)制,,再聯(lián)合醫(yī)生進(jìn)行診斷,。"
與其他的DBA病例不同,Vincent的核糖體未發(fā)現(xiàn)異常,,因此他的父親懷疑兒子患有一種新穎但相關(guān)的疾病ribosomopathy。在征得醫(yī)生的同意后,,Marc將Vincent的亮氨酸送去檢測,。對(duì)于Vincent這樣的病例,外顯子組測序能幫助醫(yī)生診斷,,或至少指明正確的方向,。
在JAMA的這篇文章中,作者Ricki Lewis 談到了外顯子組測序的崛起,。如今,大約有幾萬人已經(jīng)進(jìn)行了外顯子組測序,,不過通過它來診斷疾病的比例不是太高,。根據(jù)加州大學(xué)洛杉磯分校的研究,在一個(gè)814名患者的隊(duì)列中,,診斷率為25%,。不過,隨著人類基因組的注釋逐步完善,,這個(gè)比例有望提高,。
此外,外顯子和基因組測序已進(jìn)入預(yù)防醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,。專家正在討論,,用外顯子組和基因組測序來取代目前的新生兒篩查檢測,是否可行,。有人預(yù)測,,在未來5到10年,新生兒的基因組測序?qū)⒆兊贸R?guī),。