冷凍干燥技術用途十分廣泛包括：
1)實驗室：用凍干的方法來保存生物標本,、菌種等,。此外，凍干被用于準備用做結構研究(例如電鏡研究)的組織樣品,，冷凍干燥也應用于化學分析中,，它能得到干燥態(tài)的樣品，或者濃縮樣品以增加化析敏感度,。在實驗室中一般以臺式和小型 干燥機 為主,。
2)制藥行業(yè)：一些制藥廠用凍干的方法來生產(chǎn)抗菌素、疫苗,、血清和各種生物藥品,。在生產(chǎn)中只要使用大型冷凍 干燥機 。
3)食品行業(yè)：用凍干的方法生產(chǎn)食品,，主要品種有：蘑菇,、大蒜、蔬菜,、牛肉,、海產(chǎn)品、咖啡等等,。也是主要使用大型冷凍 干燥機 ,。
4)其他：凍干產(chǎn)品生產(chǎn)幾乎包羅萬象，諸如各種飲料,、調(diào)料、快餐食品,、小食品,、保健食品、水產(chǎn),、肉蛋,、食用菌、酶制劑,、藻類等等
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