公司動態(tài)
恒遠告訴大家:關(guān)于WB實驗的常見問題以及解決方案(3)
閱讀:2414 發(fā)布時間:2012-9-14
上海恒遠生物科技有限公司是一家生物技術(shù)企業(yè),主要從事免疫學,、分子生物學和常規(guī)生化試劑的研發(fā),、銷售。并代理銷售Omega,、Sigma,、R&D、ATCC,、HYCLONE等二十多家國外,,致力于為廣大高校、科研院所和企事業(yè)單位提供*的科研試劑和完善的技術(shù)服務,,滿足生物化學,、分子生物學、細胞生物學,、免疫學等生物科技實驗需求,。
21、想分離的蛋白是分子量200kd的,,SDS-PAGE電泳的分離膠濃度多大合適,?積層膠的濃度又該用多少?這么大分子量的蛋白容易作Western Blot嗎,?
答:200kd的蛋白不好做,,分離膠用7%,積層膠 3.5%,。
22,、如果上樣量超載,要用什么方法來增加上樣量,?
答:可以濃縮樣品,,也可以根據(jù)你的目標分子量透析掉一部分小分子蛋白。一般地,,超載30%是不會有問題的,。如果已經(jīng)超了不少了,而且小分子量的也要,,可以考慮加大膠的厚度,,可以試試1.5mm的。
23,、蛋白變性后可以存放多久,?
答:-80℃,,一兩年沒有問題。zui關(guān)鍵兩條:不要被蛋白酶水解掉,;不要被細菌消化掉(也是被酶水解了),。
24、我所測定的蛋白分子量是105KD,,按理說分離膠應當采用7.5%,但資料卻要求分離膠和濃縮膠均采用11%的配方,,不知為何,?
答:上述提到的兩種凝膠均可以使用,因為105KD的蛋白在上述兩種膠的線性分辨范圍內(nèi),,但需注意條帶位置,。
25、二抗是生物素化的抗體,,三抗是親和素生物素體系,,不知采用這樣的方案后,封閉液是否要作調(diào)整,,能否再用5%的脫脂奶粉呢,?好像有資料說脫脂奶粉會影響親和素生物素的,是嗎,?
解答:不能使用脫脂奶粉,,因為脫脂奶粉中含生物素,用BSA代替應該好一點.
26,、問一般一次上樣的蛋白總量是多少,,跟目的蛋白的表達量有關(guān)系嗎?
答:Western Blot一般上樣30-100微克不等,,結(jié)果跟目的蛋白的豐度,、上樣量、一二抗的量和孵育時間都有關(guān)系,,也與顯色時間長短有關(guān),。開始摸條件時,為了拿到陽性結(jié)果,,各個步驟都可以量多一點時間長一點,,當然背景也就出來了。要拿到好的結(jié)果,,如果抗體好的話比較容易,,抗體不好的話就需要反復地試了,當然有的不適合Western Blot的怎樣做也不行,。
27,、做組織樣品的western的時候,怎樣處理樣品?
答:必須進行研磨,、勻漿,、超聲處理,蛋白質(zhì)溶解度會更好,,離心要充分,,膜蛋白需用更劇烈的方法抽提,低豐度膜蛋白可能還要分步抽提(超速離心),。還有一點就是組織中的蛋白酶活性更強,,需要注意抑制蛋白酶的活性(加入PMSF)。
28,、問大分子量蛋白200KD,,在做western要注意什么呢?
答:做200kd蛋白的Western Blot時要注意,,分離膠選擇>7%的,;剝膠時要小心;轉(zhuǎn)移時間需要相應延長,;要做分子量參照(否則出現(xiàn)雜帶不知道如何分析),。
29、有什么方法可以提高上樣量,?
答:a)可以濃縮樣品,;增大上樣體積來增大上樣量;b)用5倍的上樣緩沖液來稀釋變性
30,、蛋白的上樣量有沒有什么具體的要求,?
答:上樣量要根據(jù)實驗的要求來定,如果要求是定量和半定量的Western Blot 則上樣量要均等,,如果只是要定性,,則沒有太大的關(guān)系,盡量多上就行了,,但是不要超載,。
答:200kd的蛋白不好做,,分離膠用7%,積層膠 3.5%,。
22,、如果上樣量超載,要用什么方法來增加上樣量,?
答:可以濃縮樣品,,也可以根據(jù)你的目標分子量透析掉一部分小分子蛋白。一般地,,超載30%是不會有問題的,。如果已經(jīng)超了不少了,而且小分子量的也要,,可以考慮加大膠的厚度,,可以試試1.5mm的。
23,、蛋白變性后可以存放多久,?
答:-80℃,,一兩年沒有問題。zui關(guān)鍵兩條:不要被蛋白酶水解掉,;不要被細菌消化掉(也是被酶水解了),。
24、我所測定的蛋白分子量是105KD,,按理說分離膠應當采用7.5%,但資料卻要求分離膠和濃縮膠均采用11%的配方,,不知為何,?
答:上述提到的兩種凝膠均可以使用,因為105KD的蛋白在上述兩種膠的線性分辨范圍內(nèi),,但需注意條帶位置,。
25、二抗是生物素化的抗體,,三抗是親和素生物素體系,,不知采用這樣的方案后,封閉液是否要作調(diào)整,,能否再用5%的脫脂奶粉呢,?好像有資料說脫脂奶粉會影響親和素生物素的,是嗎,?
解答:不能使用脫脂奶粉,,因為脫脂奶粉中含生物素,用BSA代替應該好一點.
26,、問一般一次上樣的蛋白總量是多少,,跟目的蛋白的表達量有關(guān)系嗎?
答:Western Blot一般上樣30-100微克不等,,結(jié)果跟目的蛋白的豐度,、上樣量、一二抗的量和孵育時間都有關(guān)系,,也與顯色時間長短有關(guān),。開始摸條件時,為了拿到陽性結(jié)果,,各個步驟都可以量多一點時間長一點,,當然背景也就出來了。要拿到好的結(jié)果,,如果抗體好的話比較容易,,抗體不好的話就需要反復地試了,當然有的不適合Western Blot的怎樣做也不行,。
27,、做組織樣品的western的時候,怎樣處理樣品?
答:必須進行研磨,、勻漿,、超聲處理,蛋白質(zhì)溶解度會更好,,離心要充分,,膜蛋白需用更劇烈的方法抽提,低豐度膜蛋白可能還要分步抽提(超速離心),。還有一點就是組織中的蛋白酶活性更強,,需要注意抑制蛋白酶的活性(加入PMSF)。
28,、問大分子量蛋白200KD,,在做western要注意什么呢?
答:做200kd蛋白的Western Blot時要注意,,分離膠選擇>7%的,;剝膠時要小心;轉(zhuǎn)移時間需要相應延長,;要做分子量參照(否則出現(xiàn)雜帶不知道如何分析),。
29、有什么方法可以提高上樣量,?
答:a)可以濃縮樣品,;增大上樣體積來增大上樣量;b)用5倍的上樣緩沖液來稀釋變性
30,、蛋白的上樣量有沒有什么具體的要求,?
答:上樣量要根據(jù)實驗的要求來定,如果要求是定量和半定量的Western Blot 則上樣量要均等,,如果只是要定性,,則沒有太大的關(guān)系,盡量多上就行了,,但是不要超載,。
如果你想了解更多關(guān)于western blot的信息,來函,!