電泳是指帶電顆粒在電場的作用下發(fā)生遷移的過程。許多重要的生物分子,，如氨基酸,、多肽、蛋白質(zhì),、核苷酸,、核酸等都具有可電離基團(tuán)，它們在某個特定的pH值下可以帶正電或負(fù)電,，在電場的作用下,，這些帶電分子會向著與其所帶電荷極性相反的電極方向移動。電泳技術(shù)就是利用在電場的作用下,，由于待分離樣品中各種分子帶電性質(zhì)以及分子本身大小,、形狀等性質(zhì)的差異，使帶電分子產(chǎn)生不同的遷移速度,，從而對樣品進(jìn)行分離,、鑒定或提純的技術(shù)。

電泳過程必須在一種支持介質(zhì)中進(jìn)行,。Tiselius等在1937年進(jìn)行的自由界面電泳沒有固定支持介質(zhì),，所以擴(kuò)散和對流都比較強，影響分離效果,。于是出現(xiàn)了固定支持介質(zhì)的電泳,，樣品在固定的介質(zhì)中進(jìn)行電泳過程，減少了擴(kuò)散和對流等干擾作用,。初的支持介質(zhì)是濾紙和醋酸纖維素膜,，目前這些介質(zhì)在實驗室已經(jīng)應(yīng)用得較少。在很長一段時間里，小分子物質(zhì)如氨基酸,、多肽,、糖等通常用濾紙或纖維素、硅膠薄層平板為介質(zhì)的電泳進(jìn)行分離,、分析,，但目前則一般使用更靈敏的技術(shù)如HPLC等來進(jìn)行分析。這些介質(zhì)適合于分離小分子物質(zhì),，操作簡單,、方便。但對于復(fù)雜的生物大分子則分離效果較差,。凝膠作為支持介質(zhì)的引入大大促進(jìn)了電泳技術(shù)的發(fā)展，使電泳技術(shù)成為分析蛋白質(zhì),、核酸等生物大分子的重要手段之一,。初使用的凝膠是淀粉凝膠，但目前使用得多的是瓊脂糖凝膠和聚丙烯酰胺凝膠,。蛋白質(zhì)電泳主要使用聚丙烯酰胺凝膠,。

電泳裝置主要包括兩個部分：電源和電泳槽。電源提供直流電,，在電泳槽中產(chǎn)生電場,，驅(qū)動帶電分子的遷移。電泳槽可以分為水平式和垂直式兩類,。垂直板式電泳是較為常見的一種,，常用于聚丙烯酰胺凝膠電泳中蛋白質(zhì)的分離。電泳槽中間是夾在一起的兩塊玻璃板,，玻璃板兩邊由塑料條隔開,，在玻璃平板中間制備電泳凝膠，凝膠的大小通常是12cm ´ 14 cm,，厚度為1mm～2 mm,，近年來新研制的電泳槽，膠面更小,、更薄,，以節(jié)省試劑和縮短電泳時間。制膠時在凝膠溶液中放一個塑料梳子,，在膠聚合后移去,，形成上樣品的凹槽。水平式電泳,，凝膠鋪在水平的玻璃或塑料板上,，用一薄層濕濾紙連接凝膠和電泳緩沖液，或?qū)⒛z直接浸入緩沖液中。由于pH值的改變會引起帶電分子電荷的改變,，進(jìn)而影響其電泳遷移的速度,，所以電泳過程應(yīng)在適當(dāng)?shù)木彌_液中進(jìn)行的，緩沖液可以保持待分離物的帶電性質(zhì)的穩(wěn)定,。

E=V/L

為了更好的了解帶電分子在電泳過程中是如何被分離的,，下面簡單介紹一下電泳的基本原理。在兩個平行電極上加一定的電壓（V）,，就會在電極中間產(chǎn)生電場強度（E）,，上式中L是電極間距離。

在稀溶液中,，電場對帶電分子的作用力（F）,，等于所帶凈電荷與電場強度的乘積：

F=q*E 

上式中q是帶電分子的凈電荷，E是電場強度,。

這個作用力使得帶電分子向其電荷相反的電極方向移動,。在移動過程中，分子會受到介質(zhì)粘滯力的阻礙,。粘滯力（F’）的大小與分子大小,、形狀、電泳介質(zhì)孔徑大小以及緩沖液粘度等有關(guān),，并與帶電分子的移動速度成正比,，對于球狀分子，F(xiàn)’的大小服從Stokes定律,，即：

F’=6πrηυ

式中r是球狀分子的半徑,，η是緩沖液粘度，υ是電泳速度(υ= d / t,，單位時間粒子運動的距離,，cm / s )。當(dāng)帶電分子勻速移動時： F = F’,，

∴ q·E = 6πrηυ

電泳遷移率（m）是指在單位電場強度（1V/cm）時帶電分子的遷移速度： 

所以： 
v/E=Q/6πrη 

這就是遷移率公式,，由上式可以看出，遷移率與帶電分子所帶凈電荷成正比,，與分子的大小和緩沖液的粘度成反比,。 

用SDS－聚丙烯酰胺凝膠電泳測定蛋白質(zhì)分子量時，實際使用的是相對遷移率mR,。即： 

上式中：d－帶電粒子泳動的距離,，t－電泳的時間，V－電壓,，L－兩電極交界面之間的距離,，即凝膠的有效長度。 因此，相對遷移率mR就是兩種帶電粒子在凝膠中泳動遷移的距離之比,。 

帶電分子由于各自的電荷和形狀大小不同,，因而在電泳過程中具有不同的遷移速度，形成了依次排列的不同區(qū)帶而被分開,。即使兩個分子具有相似的電荷,，如果它們的分子大小不同，由于它們所受的阻力不同,，因此遷移速度也不同,，在電泳過程中就可以被分離。有些類型的電泳幾乎*依賴于分子所帶的電荷不同進(jìn)行分離,，如等電聚焦電泳,；而有些類型的電泳則主要依靠分子大小的不同即電泳過程中產(chǎn)生的阻力不同而得到分離，如SDS－聚丙烯酰胺凝膠電泳,。分離后的樣品通過各種方法的染色,，或者如果樣品有放射性標(biāo)記，則可以通過放射性自顯影等方法進(jìn)行檢測,。