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    Feulgen stain 的原理是DNA經(jīng)溫和的弱酸(例如鹽酸)水解后,，嘌呤堿與脫氧核糖間的糖苷鍵被打開,，并且使脫氧核糖與磷酸間的磷酯鍵斷開，在脫氧核糖的一端形成游離的醛基,。醛基在原位與Schiff reagent結(jié)合,，形成紫紅色化合物，使細(xì)胞內(nèi)含有DNA的部位呈紫紅色,。紫紅色的產(chǎn)生是因?yàn)榉磻?yīng)產(chǎn)物的分子內(nèi)有醌基（醌基是一個(gè)具有顏色的發(fā)色團(tuán)）,，所以凡含有DNA的部位，就呈紫紅色,。
    染色后用SO2水洗片,，目的是洗去多余的非特異性色素及擴(kuò)散的染料。亞硫酸可與堿性品紅反應(yīng)生成品紅亞硫酸,，從而可以將用schiff劑染色時(shí)所殘留的堿性品紅反應(yīng)掉,。使其更加清晰、潔凈,。