病毒是地球上數(shù)量多的生命體，在控制寄主群落演替,、遺傳基因的水平移動(dòng),、生物進(jìn)化和地球生物化學(xué)循環(huán)中起到重要的作用。細(xì)菌病毒（噬菌體）數(shù)量上一般是細(xì)菌的10倍左右,，被認(rèn)為是地球上數(shù)量多的病毒類型,。盡管噬菌體廣泛存在，但與具有細(xì)胞結(jié)構(gòu)的微生物相比,，對(duì)其基因多樣性研究甚少,。究其原因，一方面?zhèn)鹘y(tǒng)噬菌體研究依賴于分離培養(yǎng),，但環(huán)境中的細(xì)菌大多數(shù)尚處于難培養(yǎng)狀態(tài),，限制了噬菌體的獲得；另一方面也與噬菌體基因中沒(méi)有發(fā)現(xiàn)諸如像原核生物16S rDNA和真核生物18S rDNA中存在共有的保守序列,，用于通用引物設(shè)計(jì)有關(guān),。
但近研究發(fā)現(xiàn)，噬菌體某些家族的結(jié)構(gòu)或功能蛋白質(zhì)氨基酸片段序列高度保守，利用這些保守片段氨基酸序列設(shè)計(jì)引物,，可以直接PCR擴(kuò)增出不同噬菌體家族基因序列,，用于噬菌體生態(tài)學(xué)研究。其中編碼噬菌體主要?dú)さ鞍椎膅23基因被認(rèn)為是研究T4型噬菌體基因多樣性和群落結(jié)構(gòu)的重要分子標(biāo)記基因,。
盡管采用PCR技術(shù)從稻田土壤中已經(jīng)獲得了大量的g23基因,，但2008年美國(guó)學(xué)者撰文指出，他們采用PCR技術(shù)未能從旱地土壤中獲得g23基因,，認(rèn)為從稻田土壤中獲得g23基因的結(jié)果很難認(rèn)同為是針對(duì)純粹土壤環(huán)境的研究,，原因在于稻田長(zhǎng)期有水層存在，與海洋具有相似的水環(huán)境特征,。
研究發(fā)現(xiàn),，旱地黑土農(nóng)田g23基因分布與其在海洋和湖泊水體環(huán)境中*不同，與稻田環(huán)境相近,，但也有多個(gè)新的黑土類群存在,。采用Unifrac方法分析不同環(huán)境條件下的T4型噬菌體群落結(jié)構(gòu)發(fā)現(xiàn)，T4型噬菌體在陸地生態(tài)系統(tǒng)較海洋環(huán)境分布廣泛,，表明陸地生態(tài)環(huán)境中具有豐富的噬菌體基因資源；另外,，T4型噬菌體在稻田和旱地黑土中群落結(jié)構(gòu)差異明顯,，且其在東北稻田與東北旱地黑土中分布相對(duì)較近的研究結(jié)果，說(shuō)明在陸地生態(tài)系統(tǒng)中,，T4型噬菌體群落結(jié)構(gòu)受到地理環(huán)境和生態(tài)過(guò)程的雙重影響,。
(空格分隔,最多3個(gè),單個(gè)標(biāo)簽最多10個(gè)字符)
會(huì)員.png)
16
立即詢價(jià)
您提交后,，專屬客服將第一時(shí)間為您服務(wù)