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從色譜原理上分類(lèi),，離子色譜屬液相色譜的一種,，但由于離子色譜與普通液相色譜在結(jié)構(gòu)和分析對(duì)象上有一些差異，一般作為獨(dú)立的一個(gè)色譜大類(lèi)考慮,。離子色譜與液相色譜的差別主要體現(xiàn)在儀器結(jié)構(gòu)和應(yīng)用范圍兩個(gè)方面,。 　　

1、在儀器結(jié)構(gòu)方面：離子色譜和液相色譜均有溶劑輸送系統(tǒng),、進(jìn)樣系統(tǒng),、檢測(cè)系統(tǒng)和信號(hào)記錄和處理系統(tǒng)，但由于離子色譜和液相色譜所用的流動(dòng)相不同,，因而檢測(cè)方式及信號(hào)處理也不同,，在各部件上有一些差別,。 　　
1）離子色譜一般采用酸、堿及鹽的水溶液作為流動(dòng)相,，要求系統(tǒng)可以耐酸,、耐堿，因此通常離子色譜裝置采用非金屬材質(zhì),。例如：采用聚醚醚酮（PEEK）塑料作為泵體,、流路和閥體等要求耐高壓的部分，而以聚四氟乙烯或PEEK材料作為檢測(cè)器,，外接管路等,。由于加工和強(qiáng)度方面的差異，一般情況下全塑的材料在耐壓強(qiáng)度和精度上比金屬材料要略低一些,。 　
液相色譜一般采用有機(jī)溶劑作淋洗液,，因此多數(shù)采用金屬泵體，可以耐任何類(lèi)型的有機(jī)溶劑,，但對(duì)于酸或堿性流動(dòng)相,，易產(chǎn)生腐蝕現(xiàn)象。隨著液相色譜在生物領(lǐng)域的廣泛應(yīng)用,，為了避免金屬對(duì)一些生物活性物質(zhì)的吸附作用,，一些在生物方面應(yīng)用的液相色譜儀器也采用PEEK材料作為泵體、流路和閥,。在這一領(lǐng)域,，離子色譜和液相色譜具有了一定的通用性。
2）離子色譜可分為抑制型和非抑制型,，采用抑制器的抑制型離子色譜目前應(yīng)用廣泛,。液相色譜沒(méi)有類(lèi)似的裝置。抑制器在結(jié)構(gòu)上與液相色譜的柱后衍生系統(tǒng)相似,，但抑制器是抑制型離子色譜*組件之一。非抑制型離子色譜不用抑制器,，與液相色譜十分相似,，一些非抑制型離子色譜有時(shí)可以采用液相色譜的泵、流路和進(jìn)樣閥,。
3)檢測(cè)器是離子色譜與液相色譜的又一主要差別,。液相色譜常采用紫外-可見(jiàn)光度檢測(cè)器；而離子色譜較通用的是電導(dǎo)檢測(cè)器,。 　　

2,、離子色譜與液相色譜的分析對(duì)象差別很大。
液相色譜作為分析儀器中廣泛使用的一類(lèi)儀器,，在許多領(lǐng)域中被廣泛應(yīng)用,。采用液相色譜時(shí),，常要求被測(cè)物具有一定光度吸收，因此液相色譜一般可以用于有機(jī)化合物的分析,。而離子色譜主要利用離子在水溶液中電離產(chǎn)生電導(dǎo)的特點(diǎn),，因而主要用于無(wú)機(jī)離子的分析。 　　
當(dāng)然,，離子色譜和液相色譜的應(yīng)用并不是的沒(méi)有交叉,，目前離子色譜已經(jīng)廣泛用于有機(jī)化合物的分析，而液相色譜也可以解決大量無(wú)機(jī)離子的分析問(wèn)題,，兩種分離模式具有一定的互補(bǔ)性,。一些液相色譜無(wú)法解決的分析難題，可以嘗試用離子色譜的方法來(lái)解決,。