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公司動(dòng)態(tài)

如何利用CRISPR改造植物基因組

閱讀:524          發(fā)布時(shí)間:2017-4-27

如今,CRISPR技術(shù)已經(jīng)用于許多植物基因組的改造,包括的模式生物,,如擬南芥和蒺藜苜蓿,以及重要的經(jīng)濟(jì)作物,,如馬鈴薯,、玉米,、小麥、水稻和蘑菇等,。盡管CRISPR系統(tǒng)在大多數(shù)物種中都通用,,但涉及到植物細(xì)胞的編輯,還是不能一成不變,。

AddgeneJoel McDade在此介紹了植物基因組的改造,,突出了CRISPR系統(tǒng)針對(duì)植物的特定改變,并概括了科研人員的植物基因組編輯工具,。

CRISPR的各個(gè)組分

總的來說,,之前的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)規(guī)則也適用于植物的基因編輯。不過,,常用的CRISPR質(zhì)??赡苄枰鲆恍└淖儯拍茉谥参锛?xì)胞中起作用,。與其他模式系統(tǒng)一樣,,Cas9Cas9變異體和單鏈向?qū)?/span>RNAgRNA)的表達(dá)就足以修飾植物的基因組。

與其他生物一樣,,gRNA也是由~20個(gè)核苷酸的靶向序列和~75個(gè)核苷酸的支架序列組成,,不過驅(qū)動(dòng)gRNA表達(dá)的啟動(dòng)子則取決于所使用的細(xì)胞類型。在植物細(xì)胞中,,gRNA的表達(dá)可通過植物特異的RNA pol III啟動(dòng)子來驅(qū)動(dòng),,如AtU6TaU6,、OsU6OsU3,。Addgene提供了30多種不含gRNA的骨架,方便你插入靶向序列,,zui快構(gòu)建好載體,。

目前,研究人員已經(jīng)對(duì)一些Cas9變異體進(jìn)行密碼子優(yōu)化,,以加強(qiáng)在植物細(xì)胞中的翻譯,。同時(shí),他們也使用缺乏核酸酶活性的Cas9激活物(如dCas9-VP64)或阻遏物(dCas9-KRAB dCas9-SRDX)來激活或抑制植物細(xì)胞中的目標(biāo)基因,。

Cas9表達(dá)通常是由植物來源的RNA pol II啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)的,。舉個(gè)例子,常用的RNA pol II啟動(dòng)子包括花椰菜花葉病毒35S啟動(dòng)子(CaMV 35S)或泛素啟動(dòng)子,。Addgene也提供了含有Cas9的質(zhì)粒,,可用于目標(biāo)基因的敲除、激活和抑制,。之前提到的許多不含gRNA的骨架也包含Cas9,,可同時(shí)表達(dá)Cas9gRNA,。

將這些組分導(dǎo)入植物細(xì)胞

一旦萬事俱備,下一步就是將CRISPR組分導(dǎo)入細(xì)胞了,。記住,,這些組分的導(dǎo)入對(duì)任何實(shí)驗(yàn)而言都是至關(guān)重要的,若gRNACas9表達(dá)失敗,,結(jié)果肯定不樂觀,。CRISPR組分可瞬時(shí)表達(dá),也可穩(wěn)定表達(dá),,這取決于導(dǎo)入方法和細(xì)胞類型,。

你可以選擇用PEG(聚乙二醇)來導(dǎo)入CRISPR組分并瞬時(shí)表達(dá),但這種方法于原生質(zhì)體細(xì)胞,,也就是細(xì)胞壁被去除的植物細(xì)胞。你也可以選擇農(nóng)桿菌介導(dǎo)的導(dǎo)入,,它利用農(nóng)桿菌作為載體,,將你感興趣的基因?qū)肽康募?xì)胞。Johannes Stuttmann實(shí)驗(yàn)室提供了pDGE Dicot Genome Editing Kit,,包含了各種帶有Cas9且與農(nóng)桿菌兼容的載體,。

對(duì)于植物的基因組改造,盡管許多細(xì)節(jié)不同,,如啟動(dòng)子,、蛋白序列或轉(zhuǎn)染方法,但基本原理還是與其他系統(tǒng)無異,。目前已經(jīng)有很多文獻(xiàn)發(fā)表,,也有很多工具出現(xiàn),因此你*不必?fù)?dān)心,。大膽地去試試吧

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