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用scFv接頭PCR裝配VH和VL進(jìn)行scFv基因文庫的構(gòu)建
閱讀:848 發(fā)布時間:2010-7-21器材和試劑]
● PCR試劑和設(shè)備
● Geneclear試劑盒(Qbiogene,,Inc.)
● V區(qū)特異性正向(JΚFOR和JΛFOR)和反向(VuBACK)PCR引物
● scFv接頭DNA
[方法]
1.在0.5ml微量離心管內(nèi)配制以下PCR反應(yīng)混合液。配制成2個“反應(yīng)管”,,1個含有 V,。文庫DNA,另1個則含有Vl文庫DNA,。
反應(yīng)管 對照1 對照2
● scFV接頭DNA(100ng/ul) 1.0ul 1.0ul
● VH文庫DNA(100ng/ul) 3.5ul 1.0ul
● V-文庫DNA(Vκ或Vλ)(100ng/ul) 3.0ul 1.0ul
● 水 6.5ul 5.5ul
2.在每管中加入:
● 水,,33ul
● 10×Vent緩沖液,5.0ul
● 20×dNTP,, 2.5ul
3.在熱循環(huán)儀格內(nèi)加熱反應(yīng)管到94℃,5分鐘,。如果沒有加熱蓋,,則滴加1滴輕質(zhì)礦物油覆蓋反應(yīng)液(Sigma),。
4.加入2.Ogl Vent DNA聚合酶。
5.以94℃1分鐘,、65℃1分鐘,、72℃2分鐘的條件共循環(huán)7次,隨機(jī)地連接片段,。
6.7次循環(huán)后,,保持94℃;每套旁側(cè)引物各加入lul(等物質(zhì)的量的6種VHBACK引物的混合物,、等物質(zhì)的量的5種JκFOR或JλFOR引物的混合物,,使每種引物混合液zui終總濃度達(dá)到10pmol/ul)。
7.以94℃ 1分鐘,、60℃ 1分鐘,、72℃ 1分鐘,共25個循環(huán)擴(kuò)增片段,。
8.取3ul PCR反應(yīng)物,, 以確定剪接是否成功。已裝配好的scFv長度應(yīng)為0.8~0.9kb,,而且在陰性對照反應(yīng)中沒有相同大小的產(chǎn)物,。
9.用1.0%瓊脂糖凝膠電泳純化已裝配好的基因文庫,再用Geneclean提取,。將每種產(chǎn)物重懸于20ul水中,。在1%瓊脂糖凝膠中,與已知大小和濃度的標(biāo)準(zhǔn)對照品比較,,測定DNA濃度,。為構(gòu)建抗體文庫,已剪接的scFv基因文庫接著必須進(jìn)行再擴(kuò)增,,添加上限制性位點(diǎn)以便能克隆到噬菌粒載體中