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DNA合成儀的使用方法
閱讀:1317 發(fā)布時間:2010-12-30亞磷酰胺寡核苷酸合成為例介紹該類儀器的一般操作步驟,。亞磷酰胺DNA合成的試劑有:保護(hù)堿基的5/—DMT,,A,、G,、C,、T亞磷酰胺單體,,四唑偶聯(lián)催化劑,乙酐,,N—甲基咪唑封閉試劑,,三氯乙酸(TCA)脫保護(hù)溶液,12氧化混合物,,乙腈清洗溶劑,,氨水切除溶液。使用步驟如下:
1)仔細(xì)檢查合成儀上所有試劑瓶中的試劑量,,必要時換掉試劑瓶,,特別注意乙腈的量,因為該溶劑用量較大,。
2)將標(biāo)記好的清潔的收集瓶裝在合成儀上,。
3)將要合成的DNA序列輸入合成儀。
4)檢查選擇的合成步驟是否正確,。
5)選擇結(jié)束方法:TritylOffAuto是儀器的原始狀態(tài),,若打算以5,—DMT基團(tuán)連接純化寡核苷酸,,將其轉(zhuǎn)變?yōu)門ritylOnAuto結(jié)束狀態(tài),。
6)選擇結(jié)束方法,一般為系統(tǒng)的原始狀態(tài),。
7)在每個柱監(jiān)視器的Username下,,輸入你所希望的保存名字。
8)以代碼代替相應(yīng)的DNA序列標(biāo)記每一個收集瓶,。
9)打印出每一個柱設(shè)置的詳細(xì)資料,。
10)檢查打印出來的資料是否正確。
11)運行StartColumn步驟檢查每一個柱的位置,,確保合成儀上合成柱處于正確的位置,。
12)檢查連接在合成儀上的溶劑殘留(廢液瓶)是否充滿。
13)如果分部收集器用來收集每個DMT脫保護(hù)步驟的流出物,,確保試管充分清潔干凈,,并打開分部收集器,確保DMT廢液管路通向分部收集器。
14)啟動循環(huán),,運行開始程序清洗試劑管路,,除去原來的試劑。
注意:TritylOnAuto表示在合成寡核苷酸的5’端核苷酸帶有一個DMT,,并將其從固相載體上切下來,,儲存在收集瓶中;TritylOffAuto表示在合成寡核苷酸的5,,端核苷酸沒有保護(hù)基團(tuán),,將其從固相載體上切下來,儲存在收集瓶中,;TritylOnManual表示合成寡核苷酸的5’端核苷酸帶有一個DMT,,寡核苷酸沒有從固相載體上切下來,而是保留在合成柱中,;TritylOffManual表示在合成寡核苷酸的5,,端核苷酸沒有保護(hù)基團(tuán),寡核苷酸沒有從固相載體上切下來,,而是保留在合成柱中,。