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Southern 轉(zhuǎn)印分析
閱讀:338 發(fā)布時(shí)間:2010-11-25在膠體中的DNA 可利用毛細(xì)現(xiàn)象的作用將DNA 牽引轉(zhuǎn)印至覆蓋在膠片上的濾膜,,經(jīng)烘烤或UV 照射后,,可使DNA 固定在膜上,以進(jìn)行探針的雜合(hybridization) 反應(yīng),。
儀器用具:
玻璃缸;玻璃板或吸水海綿;Crosslinker (Stratalinker 1800, Stratagene)
藥品試劑:
10×SSC (1.5 M NaCl; 0.15 M sodium citrate) 或20×SSC
變性溶液 (1.5 M NaCl; 0.5 N NaOH)
中和溶液 (1 M Tris-Cl; 1.5 M NaCl, pH 7.5)
Nylon membrane 尼龍膜
40 Methods in Biotechnology Vol 1
Whatman 3MM 濾紙
吸水紙
方法步驟:
1) 電泳的洋菜膠片,,浸于0.25 N HCl 中15 min (當(dāng)DNA 分子量不大時(shí),可省去此步驟),;以無菌水潤洗膠片后,,將膠片置于變性溶液中,于室溫緩慢震蕩15 min,,更換新的變性溶液后再處理15 min,。
2) 以無菌水潤洗膠片,再以中和溶液浸泡30 min,,其間更換一次,。
3) 戴手套將尼龍膜剪裁成膠體大小,在角落剪一缺口作記號(hào),。另裁剪數(shù)張較膠片稍小的3MM 濾紙,。
4) 取一玻璃缸,加入10×SSC,。將一塊長形玻璃板架在缸上,,裁剪一張長形3MM 濾紙,,寬度須略大于膠片,將濾紙置于玻璃板上,,使濾紙兩端順著玻璃板垂入缸內(nèi)溶液中,。加一些10×SSC 于濾紙上使其濕透,并趕掉濾紙與玻璃板間的氣泡,。
?? 若有3~5 cm 厚的干凈海綿,,則可取代玻璃板??蓪⒑>d置于缸中,,加入10×SSC,但不可淹過海綿,。海綿濕透后,,其上放一張比膠片大的3MM 濾紙,,要趕掉濾紙與海綿間的氣泡,。
5) 將處理過的膠片置于濾紙上,趕掉氣泡,,小心將尼龍膜蓋在膠片上,,不要有氣泡產(chǎn)生。 再依序蓋上兩張以10×SSC 浸濕的濾紙及兩張干的濾紙,,并以保鮮膜將膠片四周封住,。zui后覆蓋一迭吸水紙,上面放一塊玻璃板或塑料板,,以重物壓住即可,。在室溫下靜置過夜。
6) 轉(zhuǎn)印后,,小心移去重物,、吸水紙、3MM 濾紙等,,在尼龍膜相對(duì)于樣品槽的位置作記號(hào),。將尼龍膜掀開,與膠片接觸面朝上,,置于10×SSC中緩慢震蕩5 min,,以洗去附著在膜上的洋菜膠。 轉(zhuǎn)印后的膠片可再以EtBr 染色,,視是否轉(zhuǎn)印*,。
7) 將尼龍膜置于干凈的濾紙上 (與膠片接觸面朝上),移至UV crosslinker中,,進(jìn)行crosslinking 以將DNA 固定在膜上,。
8) 干燥后的尼龍膜即可進(jìn)行雜合,。 若不立即進(jìn)行雜合,可將尼龍膜夾于兩張濾紙間,,置于干燥箱中存放,。