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大多數(shù)動(dòng)物組織可以用裂解緩沖液和蛋白酶/蛋白酶 K 進(jìn)行裂解。在加入裂解液之前需要將組織切成小塊,，有條件的話建議使用 TissueLyser 或研缽等提前進(jìn)行均質(zhì)化,。骨骼肌，心臟,，皮膚等組織含有收縮蛋白,，結(jié)締組織和膠原蛋白，所以利用蛋白酶 / 蛋白酶 K 進(jìn)行充分消化是必須的,。

FFPE 樣本進(jìn)行 DNA 純化時(shí)需要預(yù)裂解,。福爾馬林可由 PBS 洗滌除去，石蠟可由二甲苯和乙醇進(jìn)行去除,。在蛋白酶消化后提高孵育的溫度有助于逆轉(zhuǎn)交聯(lián),，以便更好的從 FFPE 組織中釋放 DNA,，從而有助于提高 DNA 產(chǎn)量和改善下游檢測性能。 從 FFPE 中得到的 DNA 通常比從新鮮或凍存樣本中得到的 DNA 分子量??；DNA 降解的程度則取決于樣本類型，儲(chǔ)存時(shí)間和固定的條件,。

微量樣本中 DNA 的含量很低,，通常小于 5 ng DNA, 通常需要使用 carrier RNA 來提高產(chǎn)量（不會(huì)影響下游分析檢測）。如果需要使用 carrier RNA,，那么在測量 OD 的時(shí)候會(huì)因?yàn)槭褂?carrier RNA 造成濃度測量有偏差（因?yàn)?RNA 在 260 nm 也有吸收）,。

推薦使用 QIAamp DNA Micro Kit 從微量樣本中進(jìn)行 DNA 純化，該試劑盒采用 MinElute 硅膠膜柱,，洗脫體積可以低至 20 μl,，同時(shí)通過兩步洗滌去除 PCR 抑制劑等污染物，zui大程度從微量樣本中純化 DNA,。

血液樣本可以是新鮮或凍存全血或干血片,，由于血液樣本在采集后會(huì)迅速凝固，所以通常在采血時(shí)使用 EDTA,，檸檬酸鹽或肝素進(jìn)行抗凝,。經(jīng)過抗凝處理的血液樣本可以直接用于 DNA 純化，需要注意的是使用的 DNA 純化方法需要能夠去除上述抗凝劑,，以免干擾下游 PCR 檢測,。全血也可以在 DNA 純化前*行白細(xì)胞富集等再進(jìn)行 DNA 純化。

從血液中純化 DNA 的產(chǎn)量很大程度上取決于血液中的白細(xì)胞數(shù)量,，而白細(xì)胞數(shù)量則和血液的供體情況有很大關(guān)聯(lián)（如貧血或感染都會(huì)造成白細(xì)胞數(shù)量變化）,。上述情況必須在進(jìn)行 DNA 純化前就應(yīng)該考慮到。此外,，有些動(dòng)物有有核血,，這意味著這類樣本中含有更多的 DNA，在從此類血樣中純化 DNA,，上樣量需要減少 10 倍左右,。

1. 哺乳動(dòng)物細(xì)胞可以使用蛋白酶 K 進(jìn)行裂解
2. 酵母細(xì)胞需要首先使用溶菌酶對(duì)細(xì)胞壁進(jìn)行處理,，然后使用蛋白酶或蛋白酶 K 進(jìn)行消化
3. 許多細(xì)菌細(xì)胞可以使用裂解 buffer 和蛋白酶 / 蛋白酶 K 進(jìn)行裂解,，某些細(xì)菌如革蘭氏陽性菌需要預(yù)先使用溶菌酶對(duì)細(xì)胞壁進(jìn)行處理
4. 細(xì)菌細(xì)胞需要先從生物體液中沉淀，然后從中純化細(xì)菌 DNA,，拭子樣本需要先使用殺菌劑進(jìn)行預(yù)處理然后再離心
5. 使用機(jī)械裂解會(huì)比用酶消化的效果要好,，尤其是針對(duì)革蘭氏陽性菌或真菌而言