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凝膠電泳常見問題分析

閱讀:2190      發(fā)布時(shí)間:2015-4-23
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要跑瓊脂糖凝膠電泳,, 5ng 就能很清楚的跑出來是這樣嗎?能夠照相的清楚的條帶,,至少需要多少量呢,?
參考見解:5ng 已經(jīng)可以了,但是或許20ng50ng-200ng效果好,,在此范圍內(nèi)呈線性,。

把210bp的pcr產(chǎn)物進(jìn)行酶切,得到190+20bp的兩個(gè)片段,請(qǐng)問能用瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)酶切結(jié)果嗎?用多大濃度的膠和多大的電壓呢?
參考見解:可以用瓊脂糖凝膠電泳分開,電壓不變,可用1.5%到2%的膠,20bp得片斷不一定能看得到,所以應(yīng)用未酶切的PCR片斷作對(duì)照.


瓊脂糖濃度(W/V)



大小范圍(bp)



0.6%



1000-23000



0.8%



800-10000



1.0%



400-8000



1.2%



300-7000



1.5%



200-4000



2%



100-3000



丙烯酰胺凝膠電泳更適合于分離純化小分子量核酸(5-500bp)并且分辨率高,可以達(dá)到1個(gè)bp,。所以建議進(jìn)行丙烯酰胺凝膠電泳試試,。

Marker做瓊脂糖凝膠電泳,發(fā)現(xiàn)Marker在加樣孔有一個(gè)明顯的亮帶,,什么原因,?
參考見解:marker有時(shí)會(huì)出現(xiàn)這樣的問題,應(yīng)該是時(shí)間久了。新買時(shí)跑膠在點(diǎn)樣孔沒有,過一段時(shí)間就會(huì)在點(diǎn)樣孔出現(xiàn)亮點(diǎn),。也可能是蛋白,,有時(shí)DNA提的不純含有蛋白時(shí)就會(huì)出現(xiàn)上樣孔有條帶的現(xiàn)象。

瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)DNA時(shí),跑出的帶后面出現(xiàn)拖尾現(xiàn)象,什么原因造成的?
參考見解: DNA帶模糊??:
1,、 DNA降解??避免核酸酶污染,。
2、 DNA上樣量過多??減少凝膠中DNA上樣量,。
3,、 所用電泳條件不合適??電泳時(shí)電壓不應(yīng)超過20V/cm,,溫度<30℃,巨大DNA鏈,溫度應(yīng)<15℃,,核查所用電泳緩沖液是否有足夠的緩沖能力,。
4、 DNA樣含鹽過高??電泳前通過乙醇沉淀去除過多的鹽,。
5,、 有蛋白污染??電泳前酚抽提去除蛋白。
6,、 DNA變性,,?電泳前勿加熱,用20mM NaCl緩沖液稀釋DNA,。

將從組織提取的DNA進(jìn)瓊行脂糖凝膠電泳,,用的1.5%的膠加了EB,80V跑1小時(shí),,溴酚藍(lán)已經(jīng)跑到頭了,,在紫外燈觀察什么帶也沒有,只見孔里面有橘紅色的亮光,。好象沒跑出來,,是怎么回事?

參考見解:
1,、 根據(jù)目的條帶長度來調(diào)整凝膠濃度,一般1.5%左右,,也不一定,。
2、 紫外燈下沒見帶,,不一定沒有出孔,,而是量少看不到,可以測(cè)一下濃度看一下,,或直接試跑一下PCR,。
3、 加一個(gè)marker孔,,尤其你*次跑膠時(shí),。
4、 電泳時(shí)間可能過長,,一般75v×30min左右,,但是具體看溴酚藍(lán)的離孔距離和目的條帶離孔距離。

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