實(shí)驗(yàn)方法原理

瓊脂糖凝膠電泳是用瓊脂糖作支持介質(zhì)的一種電泳方法。其分析原理與其他支持物電泳的主要區(qū)別是：它兼有“分子篩”和“電泳”的雙重作用,。

瓊脂糖凝膠具有網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu),，物質(zhì)分子通過時(shí)會(huì)受到阻力,，大分子物質(zhì)在涌動(dòng)時(shí)受到的阻力大,，因此在凝膠電泳中，帶電顆粒的分離不僅取決于凈電荷的性質(zhì)和數(shù)量,，而且還取決于分子大小,，這就大大提高了分辨能力。但由于其孔徑相當(dāng)大,，對(duì)大多數(shù)蛋白質(zhì)來說其分子篩效應(yīng)微不足道,，現(xiàn)廣泛應(yīng)用于核酸的研究中。

蛋白質(zhì)和核酸會(huì)根據(jù)pH不同帶有不同電荷,，在電場中受力大小不同,，因此跑的速度不同，根據(jù)這個(gè)原理可將其分開,。電泳緩沖液的pH在6~9之間,，離子強(qiáng)度0.02~0.05適合。常用1%的瓊脂糖作為電泳支持物,。瓊脂糖凝膠約可區(qū)分相差100 bp的DNA/片段，其分辨率雖比聚丙烯酰胺凝膠低,，但它制備容易,，分離范圍廣。普通瓊脂糖凝膠分離DNA的范圍為0.2-20 kb，利用脈沖電泳,，可分離高達(dá)107 bp的DNA/片段,。

DNA分子在瓊脂糖凝膠中泳動(dòng)時(shí)有電荷效應(yīng)和分子篩效應(yīng)。DNA分子在高于等電點(diǎn)的pH溶液中帶負(fù)電荷,，在電場中向正極移動(dòng),。由于糖-磷酸骨架在結(jié)構(gòu)上的重復(fù)性質(zhì)，相同數(shù)量的雙鏈DNA幾乎具有等量的凈電荷,，因此它們能以同樣的速率向正極方向移動(dòng),。

實(shí)驗(yàn)材料 DNA

試劑、試劑盒 瓊脂糖TBE電泳緩沖液電泳載樣緩沖液溴化乙錠(EB)溶液母液DNAGreen

儀器,、耗材 水平式電泳裝置電泳儀臺(tái)式高速離心機(jī)恒溫水浴鍋微量移液槍微波爐或電爐紫外透射儀照相支架照相機(jī)及其附件

實(shí)驗(yàn)步驟

一,、試劑配制

1. 5×TBE緩沖液：450 mmol/L Tris-硼酸，10 mmol/L EDTA,，pH值8.0,。使用時(shí)將上述儲(chǔ)存液稀釋10倍至0.5×TBE緩沖液，可同時(shí)作為電泳及制膠用的緩沖液,。

二,、制膠

1. 根椐制膠量及凝膠濃度，在加有一定量的電泳緩沖液的三角錐瓶中,，加入準(zhǔn)確稱量的瓊脂糖粉（總液體量不宜超過錐瓶的50%

容量）,。瓊脂糖粉末與0.5×TBE buffer的比例（w：v）參考表1，常用瓊脂糖濃度為0.7-1%,。

瓊脂糖凝膠濃度與線形DNA的分辨范圍

2. 在錐瓶的瓶口上蓋上保鮮膜或牛皮紙,，并在膜或紙上扎些小孔，然后在微波爐中加熱溶解瓊脂糖,。加熱時(shí),，當(dāng)溶液沸騰后，請(qǐng)戴上防熱手套,，小心搖動(dòng)錐瓶,，使瓊脂糖充分均勻溶解。此操作重復(fù)數(shù)次,，直至瓊脂糖*溶解,。

3. 使溶液冷卻至50℃-60℃左右，如需要可在此時(shí)加入溴化乙錠溶液（終濃度0.5 μg/ml）或按照1 μL / 30 mL的比例加入DNAgreen染料,，并充分混勻,。

4. 將瓊脂糖溶液倒入制膠模中，然后在適當(dāng)位置處插上梳子,。凝膠厚度一般在3~5 mm之間,。制膠模如下圖所示,，小膠倒入25-30 mL左右瓊脂糖溶液，大膠則60-70 mL左右,，若需切膠回收,，凝膠可適當(dāng)加厚。

5. 在室溫下使膠凝固,，大約30分鐘~1小時(shí),。

三、上樣

1. 取適量樣品與6×上樣緩沖液混勻（如：1 μl樣品與5 μl 6×上樣緩沖液）,，用微量移液槍小心加入樣品槽中,。

2. 上樣量根據(jù)樣品濃度可適當(dāng)調(diào)整，若DNA含量偏低,，則可依上述比例增加上樣量,，但總體積不可超過樣品槽容量（一般小孔40 μl 為上限，大孔200 μl 為上限,，具體和制膠膜規(guī)格相關(guān)）,。

3. 每加完一個(gè)樣品要更換槍頭，以防止互相污染,，注意上樣時(shí)要小心操作,，避免損壞凝膠或?qū)悠凡鄣撞磕z刺穿。

四,、電泳

1. 加完樣后,，合上電泳槽蓋，立即接通電源,?？刂齐妷罕３衷?10 V，電流在40 mA以上,。

2. 當(dāng)條帶移動(dòng)到距凝膠前沿約2 cm時(shí)（約40 min）,，停止電泳。

3. 紫外下拍照并觀察,。

注意事項(xiàng)

1. 5×TBE緩沖液放置時(shí)間過久會(huì)沉淀,，因此一次性不要配太多。工作用電泳緩沖液為0.5×TBE緩沖液,，取5×TBE緩沖液貯存液稀釋,，現(xiàn)配現(xiàn)用。

2. 用于電泳的緩沖液和用于制膠的緩沖液必須統(tǒng)一,。

3. 瓊脂糖粉在微波爐中加熱時(shí)間不宜過長,，每次當(dāng)溶液起泡沸騰時(shí)停止加熱，否則會(huì)引起溶液過熱暴沸,，造成瓊脂糖凝膠濃度不準(zhǔn),，也會(huì)損壞微波爐,。溶解瓊脂糖時(shí),，必須保證瓊脂糖充分*溶解,，否則，會(huì)造成電泳圖像模糊不清,。

4. 凝膠不立即使用時(shí),，請(qǐng)用保鮮膜將凝膠包好后在4℃下保存，一般可保存2～5天,。