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徠卡顯微系統(tǒng)(上海)貿(mào)易...

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課堂 | 連續(xù)斷層 3D 重構(gòu)中的超薄切片制備,,ARTOS 3D

閱讀:1398      發(fā)布時間:2019-10-24
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當需要以納米級分辨率觀察樣品超微結(jié)構(gòu)時,,科學家通常借助電子顯微鏡(觀察表面結(jié)構(gòu)的掃描電鏡 SEM 和觀察內(nèi)部結(jié)構(gòu)的透射電鏡 TEM)——它們是當前科研界可使用的大顯微成像工具。

 

電鏡成像要求對樣品進行通常 20-150 nm的超薄切片,,使用超薄切片機切割的切片厚度薄,、表面平整、光滑且無人為干擾因素,,因此可以滿足電鏡成像對制備樣品的嚴苛要求,。如果大量超薄切片具有樣品結(jié)構(gòu)的前后連續(xù)性,SEM 成像采集的圖像就可以進行樣品內(nèi)部結(jié)構(gòu)的 3D 重建,,形成可用于分析的完整超微,、精細立體圖像,即連續(xù)斷層成像技術(shù)(Array Tomography, AT),。

 

今天,,小編簡要介紹一下 AT 成功的關(guān)鍵環(huán)節(jié):連續(xù)超薄切片樣品制備。

 

 

111超薄切片之重要性111

AT 常用于細胞,、蛋白質(zhì)等生物 / 生物大分子結(jié)構(gòu)的納米分辨率,、3D 結(jié)構(gòu)觀察和分析,主要步驟為包埋樣品連續(xù)(超?。┣衅?、TEM / SEM 或光學顯微鏡對其進行成像、對獲得的一系列圖像進行重建分析,。AT 可以獲得的有效信息包括超微結(jié)構(gòu)的定量,、體積分析和細胞 / 蛋白的形態(tài)學數(shù)據(jù)等,相較于共聚焦顯微鏡獲得的圖像,,具有更高的水平和空間分辨率(可達 0.2 nm),。

 

超薄切片主要用于 TEM 成像前的樣品制備,以納米分辨率觀察樣品內(nèi)部結(jié)構(gòu)信息,。無污染且獲取快速的超薄切片的主要優(yōu)勢在于:

  • 整個切片均可用于電鏡成像,,適合大尺寸樣品分析;

  • 單張切片電子透射均一性好,,保證結(jié)果可靠性,;

  • 制備速度快,短時間即可獲得大量切片,;

  • 適用樣品范圍廣,,生物樣本和工業(yè)材料均適用,。

 

 

11超薄切片的基本原理11

對于 TEM 或者 3D 結(jié)構(gòu)重建,樣品高質(zhì)量連續(xù)切片是前提,。因此,,一臺如 Leica EM UC7 或者 EM ARTOS 3D(20-50 nm)(見圖 1)一樣穩(wěn)定可靠的超薄切片機是開展實驗的*工具。

▲圖 1. Leica 連續(xù)超薄切片機新品 —— EM ARTOS 3D

樣品被安裝在可上下前后移動的電動機械臂上,,機械臂垂直上下移動,、遇到固定的玻璃刀或鉆石刀時,這條樣品帶被切下(圖 2),,然后刀臺自動向左移動,,按照設(shè)定的切片厚度完成第二條切割。同理,,隨后刀臺再向左移動,,完成第三條切割(圖 3)。從刀片上直接取下切片是十分困難的,,因為它非常薄且脆弱,,徠卡超薄切片機采用溫和水流托舉的方式使條帶不斷分離,能夠保證條帶質(zhì)量不被破壞同時操作極其簡單(冷凍切片情況可借助顯微操作),,然后進行上電鏡前的其它必要處理,。

▲ 圖 2. EM ARTOS 3D 超薄切片機樣品切割位置基本結(jié)構(gòu)

 

▲ 圖 3. EM ARTOS 3D 制備的連續(xù)超薄切片條帶

 

 

連續(xù)斷層成像的樣品制備

多數(shù)未處理的生物樣品比較柔軟,AT 成像前的樣品制備主要包括下面幾個步驟:

  • 組織固定

  • 樣品水分抽提和包埋

  • 連續(xù)切片和切片條帶收集

  • 切片染色以用于成像(如果需要)

后使用 SEM 或光學顯微鏡(通常熒光成像情況)對結(jié)構(gòu)上具有連續(xù)性的切片進行成像,,合成圖像以進行 3D 重建和分析,。

 

對于市面上多數(shù)超薄切片機,使用者在 AT 成像的樣品制備時,,通常會發(fā)現(xiàn)這是一項耗時耗力,、中間一些操作必須手工完成的工作。EM ARTOS 3D 是 Leica 2019 年新推出的 3D 連續(xù)超薄切片機,,能夠自動化連續(xù)切片,、顯著縮短樣品制備時間、減少人工操作,、切片無褶皺,、厚度均一、溫和水流取條帶,、提高樣品制備成功率等眾多優(yōu)點,,在向下兼容普通超薄切片需要的同時,特別合適高通量切片和 AT 等前沿研究對樣品制備的嚴苛要求 

 

 

1111111數(shù)據(jù)展示1111111

▲ 圖 4. AT 技術(shù)獲得的鼠淋巴結(jié) 3D 結(jié)構(gòu)重建

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