活細(xì)胞無時不在與外界進(jìn)行著物質(zhì)和能量的交換，其代謝水平應(yīng)是其生命體征的主要表現(xiàn),。在健康和疾病中,，代謝程序和它們所支持的特定生理功能之間有著密切的聯(lián)系。這些核心代謝功能的失調(diào)與許多現(xiàn)代疾病有關(guān),。由于每個細(xì)胞都生活在一個du特的環(huán)境中,，我們體內(nèi)沒有一個細(xì)胞在新陳代謝、表型和功能上wan全相同,。在單細(xì)胞分辨率下,，解決代謝的時空異質(zhì)性將推動代謝領(lǐng)域向前發(fā)展，并轉(zhuǎn)換到臨床應(yīng)用和理解體內(nèi)系統(tǒng)代謝組學(xué)變化的基礎(chǔ),。
相比DNA和RNA,，細(xì)胞內(nèi)的代謝物無法擴(kuò)增，單個細(xì)胞能夠提供的用于分析的代謝物濃度低體積小,，對分析設(shè)備和方法的要求較高,。因此，本次研究將具有單細(xì)胞取樣精度的激光顯微切割 (LMD, Laser Microdissection)技術(shù)和SCIEX 7500高靈敏度質(zhì)譜系統(tǒng)聯(lián)合使用,，測試在能夠用于有效分析的細(xì)胞數(shù)量,。
實驗設(shè)計
樣品制備：
腦組織做冰凍切片，樣本置于激光顯微切割載物臺,；接收端放置PCR管用于分離體的接收,。選擇合適的細(xì)胞數(shù)目或切割面積（如~2000μm2），在調(diào)節(jié)好相關(guān)參數(shù)（Power 49,、Aperture 5,、Speed 13、Bridge size 4）后開始進(jìn)行切割（圖1）,。切割完成后,，小心將PCR管取出，由管底倒扣至管蓋蓋緊,，防止管蓋中收集的樣品遺落,。
圖1. 腦組織切片樣本用于激光顯微切割分離體制備,。在40倍放大視野中選取合適的面積，約2000 μm2（左）進(jìn)行切割分離并用于后續(xù)分析,；一份樣品切割分離完成后（右）,，可繼續(xù)選擇其他區(qū)域進(jìn)行操作。
樣品提?。?/strong>
裝有樣品的PCR管在vortex中振蕩5s,，由點甩小型離心機(jī)將微量樣品離心至管底，小心打開管蓋,，加入30 μL提取溶液（異丙醇:乙腈:水 30:65:5 v/v/v）,，振蕩混勻，超聲15 min,，離心后將全部溶液轉(zhuǎn)移至進(jìn)樣小瓶中待LC-MS/MS分析,。LC-MS條件：樣品通過ExionLC™系統(tǒng)串聯(lián)SCIEX 7500系統(tǒng)，進(jìn)行分析,。數(shù)據(jù)通過SCIEX OS 軟件2.1中的定量功能進(jìn)行處理,。
分析結(jié)果
在分離的微量細(xì)胞中（組織切片約2000μm2），共檢測到285個脂質(zhì)化合物,，包括鞘脂SM,、膽固醇酯CE,、甘油三酯TAG,、甘油二酯DAG、磷脂酰乙醇胺PE,、磷脂酰膽堿PC,、神經(jīng)酰胺Cer7類。
圖2.微量腦組織切片中測得的不同種類脂質(zhì)化合物的數(shù)量,?；贚C-MS/MS 的靶向脂質(zhì)組學(xué)方法快速分析基質(zhì)中的多種脂類物質(zhì)。
圖3.對于微量細(xì)胞中檢測到的脂質(zhì)化合物的判定,，主要基于與空白提取溶劑（陰性對照）和血漿脂質(zhì)提取樣本（陽性對照）共同比較,，并且結(jié)合各類脂質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)品出峰位置情況、同類脂質(zhì)化合物有較為接近的出峰位置,，而同類脂質(zhì)化合物連接脂肪酸鏈越長保留時間越靠后,、連接相同碳數(shù)的脂肪酸鏈上不飽和鍵數(shù)越多保留時間越靠前的規(guī)律，對微量樣本中檢出的脂質(zhì)化合物做定性判斷,。
通過徠卡激光切割顯微鏡LMD7獲取微量樣本技術(shù)與SCIEX 7500 系統(tǒng)高靈敏度檢測相結(jié)合,，實現(xiàn)微量細(xì)胞高覆蓋靶向脂質(zhì)組學(xué) PE（P-18:0_18:0）分析檢測。在約2000μm2 組織切片樣品中檢測到脂質(zhì)化合物數(shù)目285個,，符合組學(xué)分析對化合物覆蓋度的需求,。
相關(guān)產(chǎn)品
Leica LMD6 & LMD7激光顯微切割系統(tǒng)
(空格分隔,最多3個,單個標(biāo)簽最多10個字符)
8
立即詢價
您提交后，專屬客服將第一時間為您服務(wù)