DMi8與轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究
——如何為您的研究選擇和配置顯微鏡
新冠也許是人類已知的作為危險(xiǎn)的病毒之一,，其傳播力強(qiáng)、途徑隱秘危害性大,，而面臨如此大敵,，多虧了核酸檢測(cè)技術(shù)發(fā)展才可以使其無所遁形。但是核酸檢測(cè)技術(shù)首先都需要對(duì)核酸中的信號(hào)進(jìn)行放大,，以新版的國家新冠指南中所描述,，需要將收集到的DNA進(jìn)行35個(gè)循環(huán)的擴(kuò)展后才可以用于檢測(cè)，這個(gè)參數(shù)雖然較之之前的40個(gè)循環(huán)有所減少,，但是放大倍數(shù)也有235之多,，可以想象如果中間有任何錯(cuò)誤都會(huì)被放大如此高的倍數(shù),。怎么樣才能測(cè)得準(zhǔn)確呢？標(biāo)準(zhǔn)品是關(guān)鍵的保證之一,。
面對(duì)新冠的核酸檢測(cè)方案中的標(biāo)準(zhǔn)品,，上海交通大學(xué)的樊春海院士在此方面做出了最關(guān)鍵的貢獻(xiàn)。2020年初在他主持下的國家轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)科學(xué)中心積極支持下,，上海市計(jì)量院與交大的聯(lián)合團(tuán)隊(duì)夜以繼日攻關(guān),，僅用42天及時(shí)研發(fā)出新冠核酸標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)——GBW（E）091111和GBW（E）091112，并經(jīng)國家緊急授權(quán)于2020年3月19日獲批,，為核酸試劑盒提供計(jì)量溯源和質(zhì)量控制依據(jù),，供百余家研制單位使用，為疫情防控做出重要貢獻(xiàn)和基礎(chǔ)保障,。擁有170年光學(xué)技術(shù)沉淀的徠卡顯微系統(tǒng)也非常有幸能為樊院士的研究提供力所能及的支持,。
圖片轉(zhuǎn)載自“上海科技”公眾號(hào),，作者：一諾
工欲善其事必先利其器,，在成就偉大的科研成果之前，對(duì)設(shè)備的配置選擇是首要因素之一,。光學(xué)顯微鏡通常是生命科學(xué)研究實(shí)驗(yàn)室的主要設(shè)備之一,。它可在多種應(yīng)用中幫助解開科學(xué)謎團(tuán)。因此,，從明場(chǎng)顯微鏡到熒光顯微鏡和活細(xì)胞成像,，顯微鏡的配置和功能對(duì)于其應(yīng)用范圍至關(guān)重要。
您研究什么樣本,？
選擇研究顯微鏡時(shí),，首要的考慮因素是研究的樣本類型。如果是放置在薄載玻片上的固定樣本,，您可以選用正置顯微鏡,。活細(xì)胞檢測(cè)則需要使用顯微鏡的特殊功能,，因?yàn)樗鼈兪欠旁诔錆M細(xì)胞培養(yǎng)液的大細(xì)胞培養(yǎng)容器中,。
圖1：左：放置固定樣本的載玻片,，例如組織切片,。右圖：用于細(xì)胞培養(yǎng)的有蓋培養(yǎng)皿。
只有物鏡在樣本下方而聚光鏡在樣本上方的倒置配置,，才能提供基本的自由空間和物鏡與樣本之間的接近度,。與此同時(shí)，倒置顯微鏡還可以很好地接近細(xì)胞,，例如添加顯微操縱器,。
此外,，活細(xì)胞需要適當(dāng)?shù)沫h(huán)境才能生存。溫度和二氧化碳濃度必須保持在一定水平,。完成這項(xiàng)任務(wù)需要一個(gè)帶有相應(yīng)控制器的氣候室,。
圖2：左：正置顯微鏡的特點(diǎn)是物鏡在樣本上方，聚光鏡在樣本下方,。右：倒置顯微鏡的設(shè)置恰好相反,，主要是為了向用戶提供更多空間以及物鏡與樣本之間所需的接近度。
您認(rèn)為是在哪些維度,？
顯微樣本展開成三個(gè)維度：長度,、寬度和高度。一些樣本,，例如組織切片,，僅在xy方向上成像，而其他應(yīng)用可能也需要在z方向上進(jìn)行采集,。成像3D體積,，例如，對(duì)于活細(xì)胞,，建議使用電動(dòng)物鏡轉(zhuǎn)盤,，它能夠逐步引導(dǎo)您的樣本通過焦點(diǎn)。成像軟件應(yīng)該能夠重建單個(gè)圖像以進(jìn)行3D可視化,。
對(duì)于活細(xì)胞,，您必須添加時(shí)間維度。在這種情況下,，系統(tǒng)穩(wěn)定性便是另一個(gè)關(guān)鍵特性,。由于在采集過程中溫度變化會(huì)影響成像系統(tǒng)，因此必須采取有效的應(yīng)對(duì)措施,。自適應(yīng)對(duì)焦控制（AFC）等自動(dòng)對(duì)焦調(diào)整可消除這些熱影響,，并始終找到預(yù)定義的焦點(diǎn)。
圖3：自適應(yīng)對(duì)焦控制（AFC）也可以在長時(shí)間延時(shí)采集期間自動(dòng)穩(wěn)定顯微鏡焦點(diǎn),。傳感器檢測(cè)到LED光束（850 nm）的運(yùn)動(dòng),，如果載有樣本的蓋玻片改變其位置，例如由于熱活動(dòng),，就會(huì)發(fā)生這種運(yùn)動(dòng),。
哪種對(duì)比方法適合您的樣本？
用顯微鏡研究的大多數(shù)細(xì)胞——尤其是動(dòng)物細(xì)胞——沒有足夠的內(nèi)在對(duì)比度來讓研究人員觀察細(xì)節(jié),。研究人員使用對(duì)比方法來解決這個(gè)問題,。相襯（PH）和微分干涉對(duì)比（DIC）可操縱穿過樣本的光以增加對(duì)比度，您也可以分別使用熒光蛋白通過熒光染料（免疫熒光）對(duì)其進(jìn)行染色,。
根據(jù)對(duì)比方法,，顯微鏡需要特定的設(shè)備,；例如相襯需要特殊的物鏡，而DIC使用某些必須切換到光路中的棱鏡,。對(duì)于熒光顯微鏡,，您需要特殊的熒光濾色塊，以促使正確的光波長進(jìn)入和退出樣本,。
圖4：用不同對(duì)比方法獲得的一系列神經(jīng)元細(xì)胞,。從左到右：明場(chǎng)、DIC,、相襯,、熒光
光源呢？
對(duì)比方法的選擇也決定了光源,。用于傳統(tǒng)明場(chǎng)顯微鏡,、相襯和DIC的透射光照明可以使用鹵素或LED照明進(jìn)行。熒光顯微鏡可以通過LED照明或在汞燈,、氙燈或汞金屬鹵化物燈的幫助下進(jìn)行,。
您想記錄或發(fā)布您的結(jié)果嗎？
如果您想拍攝樣本圖像或進(jìn)行活細(xì)胞成像,，則需要一個(gè)數(shù)碼顯微鏡攝像頭,。特別是在熒光活細(xì)胞成像的情況下，建議使用靈敏的攝像頭,，以盡量減少可能傷害細(xì)胞的激發(fā)光量,。除了成熟的CCD和EMDDC攝像頭外，如今的sCMOS攝像頭也因其高量子效率和采集速度而得到應(yīng)用,。有關(guān)數(shù)碼顯微鏡攝像頭的更多信息,，請(qǐng)閱讀文章“數(shù)碼攝像頭技術(shù)簡介”。
此外,，大視野（FOV）有助于更快地找到感興趣的區(qū)域并同時(shí)成像更多細(xì)胞?，F(xiàn)代研究顯微鏡的攝像頭端口具有19毫米FOV，與19毫米sCMOS攝像頭芯片匹配,。
通常,，僅拍攝樣本圖像是不夠的，還需要分析您獲得的數(shù)據(jù),。為此,，易于使用的成像和分析軟件有助于獲取定量數(shù)據(jù)并進(jìn)行可靠的數(shù)據(jù)分析。
您是否需要采集厚樣本的（3D）信息,？
厚樣本對(duì)顯微鏡檢查來說是一個(gè)挑戰(zhàn),。尤其是寬場(chǎng)顯微鏡在同時(shí)照亮整個(gè)樣本的情況下,，來自焦點(diǎn)外區(qū)域的額外光會(huì)顯著減少焦點(diǎn)內(nèi)的樣本特征,。
成像解析可以幫助獲得沒有失焦光的圖像,。該技術(shù)可以應(yīng)用于單個(gè)圖像平面以獲得即時(shí)結(jié)果（ICC：即時(shí)成像解析），或者可以與額外的反卷積步驟（SVCC：小容量成像解析,；LVCC：大容量成像解析）以獲得更好的結(jié)果,。反卷積將光子信息重新分配給它們的起源，從而在焦平面中提供更好的所需結(jié)構(gòu)對(duì)比度,。與傳統(tǒng)的寬場(chǎng)圖像相比,，這可以讓用戶更容易地將感興趣的結(jié)構(gòu)與背景區(qū)分開來。
圖5：癌組織中的單分子RNA-FISH,。RNA-01（綠色）,、RNA-02（品紅色）左：原始數(shù)據(jù)。中：使用即時(shí)成像解析,。右圖：大容量成像解析之后,。由蘇黎世大學(xué)（瑞士）的Andreas Moor教授提供。
您想在顯微鏡上操作細(xì)胞嗎,？
在過去的幾年里,，樣本的圖像處理變得日益普遍。這意味著研究人員不僅要觀察活細(xì)胞,，還要借助光來操縱它們,。光漂白后的熒光恢復(fù)（FRAP）是有助于了解動(dòng)態(tài)細(xì)胞過程的一個(gè)示例。對(duì)于這些類型的操作技術(shù),，通常需要額外的光源,，這些光源必須集成到顯微鏡的光路中。
這種方法并非易事,。徠卡無限端口是一種通用解決方案,，可將附加光源耦合到顯微鏡的光路中，而不會(huì)影響圖像質(zhì)量,，例如：FRAP,、光開關(guān)、消融或光遺傳學(xué),。有了合適的適配器,，研究人員甚至可以連接他們的自制設(shè)備。
圖6：徠卡WFFRAP模塊（左側(cè)黑框）可通過無限端口與倒置研究顯微鏡徠卡DMi8連接,。
您的預(yù)算是多少,？
一個(gè)重要的問題是您可以投入的資金。一些顯微鏡供應(yīng)商提供適合特殊應(yīng)用的預(yù)定義配置,。但是,，如果您不需要所有付費(fèi)的預(yù)配置組件怎么辦？這就是為什么免費(fèi)配置組件比購買預(yù)定義的顯微鏡系統(tǒng)更經(jīng)濟(jì)的原因。
此外,，對(duì)顯微鏡的要求可能會(huì)隨著時(shí)間而改變,。在這種情況下，可升級(jí)系統(tǒng)具有一定的優(yōu)勢(shì),。通過預(yù)定義和固定的配置,，您會(huì)發(fā)現(xiàn)僅需有限數(shù)量的應(yīng)用程序。可升級(jí)性讓您可以根據(jù)不斷變化的需求靈活配置,。
考慮到這些因素,，徠卡DMi8等模塊化顯微鏡平臺(tái)可以使研究人員從經(jīng)濟(jì)的顯微鏡系統(tǒng)入門，然后隨著需求的增長而不斷升級(jí),。
圖7：利用模塊化設(shè)計(jì),，徠卡DMi8可以根據(jù)研究人員的需要進(jìn)行配置。此外,，如果需求發(fā)生變化,，后期還可以進(jìn)行升級(jí)。
誰使用顯微鏡,？
顯微鏡用戶的范圍可能差異很大,。尤其是在大學(xué)，用戶可能非常有經(jīng)驗(yàn),，也可能是絕對(duì)的初學(xué)者,。因此，由徠卡應(yīng)用套件X(LAS X)等直觀軟件運(yùn)行的易于使用的顯微鏡系統(tǒng)有助于人們快速入門并快速獲取數(shù)據(jù),。例如,，面向工作流的設(shè)計(jì)、圖像分析向?qū)б约皩⑼鈬O(shè)備無縫集成到系統(tǒng)中可以簡化您的工作,。
除了寬場(chǎng)研究顯微鏡外,，體視顯微鏡也經(jīng)常用于生命科學(xué)研究實(shí)驗(yàn)室。您可以在“選擇體視顯微鏡時(shí)要考慮的因素”一文中了解更多信息,。
了解更多：徠卡顯微
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