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    PCR基因擴增儀擴增DNA的原理是：先將含有所需擴增分析序列的靶DNA雙鏈經(jīng)熱變性處理解開為兩個寡聚核苷酸單鏈,，然后加入一對根據(jù)已知DNA序列由人工合成的與所擴增的DNA兩端鄰近序列互補的寡聚核苷酸片段作為引物,，即左右引物,。此引物范圍就在包括所欲擴增的DNA片段,，一般需20-30個堿基對,，過少則難保持與DNA單鏈的結(jié)合,。引物與互補DNA結(jié)合后，以靶DNA單鏈為模板,，經(jīng)反鏈雜交復(fù)性（退火）,，在Taq DNA聚合酶的作用下以4種三磷酸脫氧核苷（dNTP）為原料按5'到3'方向?qū)⒁镅由臁⒆詣雍铣尚碌腄NA鏈,、使DNA重新復(fù)制成雙鏈,。然后又開始第二次循環(huán)擴增。引物在反應(yīng)中不僅起引導(dǎo)作用,，而且起著特異性的限制擴增DNA片段范圍大小的作用,。新合成的DNA鏈含有引物的互補序列，并又可作為下一輪聚合反應(yīng)的模板,。如此重復(fù)上述DNA模板加熱變性雙鏈解開—引物退火復(fù)性—在DNA聚合酶作用下的引物延伸的循環(huán)過程,，使每次循環(huán)延伸的模板又增加1倍，亦即擴增DNA產(chǎn)物增加1倍,，經(jīng)反復(fù)循環(huán),，使靶DNA片段指數(shù)性擴增。

 

    PCR的擴增倍數(shù)Y=（1+E）n,這里Y是擴增量,，n為PCR的循環(huán)次數(shù),。E為PCR循環(huán)擴增效率。設(shè)PCR擴增效率E為100%,、循環(huán)次數(shù)n=25次,，靶DNA將擴增到33554432個拷貝，即擴增3355萬倍：若E為80%,、n=20,、則擴增數(shù)量將下降到1408865拷貝,，即擴增產(chǎn)物約丟失93%，若E=100%,，n=20,，則擴增數(shù)量減少1048576個拷貝，擴增產(chǎn)物約減少97%,?？梢奝CR循環(huán)擴增效率及循環(huán)次數(shù)都對擴增數(shù)量有很大影響。PCR擴增屬于酶促反應(yīng),，所以,，DNA擴增過程遵循酶促動力學原理。靶DNA片段的擴增zui初表現(xiàn)為直線上升,，隨著靶DNA片段的逐漸積累,，當引物—模板/DNA/聚合酶達到一定比值時，酶的促化反應(yīng)趨于飽和,，此時靶DNA產(chǎn)物的濃度不再增加,，即出現(xiàn)所謂平臺效應(yīng)。PCR反應(yīng)達到平臺期的時間主要取決于反應(yīng)開始時樣品中的靶DNA的含量和擴增效率,，起始模板量越多到達平臺期的時間就越短,、擴增效率越高到達平臺期的時間也越短。另外酶的含量,，dNTp 濃度,，非特異性產(chǎn)物的擴增都對到達平臺期時間有影響。