內(nèi)毒素由脂多糖與蛋白質(zhì)復(fù)合而成（圖1-2）,。脂多糖為革蘭陰性細(xì)菌細(xì)胞膜表面的主要組成成分,，在細(xì)菌和外界環(huán)境的相互作用中扮演著重要角色。脂多糖約占細(xì)菌干重的3.4% ,，每個(gè)細(xì)胞表面約有一百多萬(wàn)個(gè)脂多糖分子，它和蛋白質(zhì),、磷脂,、脂蛋白等共同組成革蘭陰性細(xì)菌細(xì)胞壁的外膜。脂多糖分子由親水性多糖和疏水性脂質(zhì)結(jié)合組成,，故為兩性分子,，其中多糖體為雜聚糖聚合而成,，如己糖（葡萄糖,、半乳糖,、甘露糖等）,、戊糖（pentose）,，庚糖（heptose）,、鼠李糖（rham nose）等。因具有磷酸根基團(tuán),，故表面帶有負(fù)電荷,，進(jìn)行免疫電泳時(shí)，在電滲作用下移向陰極,。脂多糖分子的基本結(jié)構(gòu)由三部分共價(jià)連接而成,，即O特異性抗原多糖（O-specific antigen polysaccharide）、核心多糖（core polysaccharide）及脂質(zhì)A,。脂多糖憑借其脂質(zhì)A結(jié)構(gòu)錨定在細(xì)菌外膜磷脂層的外側(cè)部,，在某些種屬細(xì)菌中脂多糖甚至替代了磷脂。

由于細(xì)菌來(lái)源不同和提取方法不同,，內(nèi)毒素的結(jié)構(gòu)形態(tài)和化學(xué)組成可以不同,。不同學(xué)者報(bào)道的脂多糖顆粒大小以及形態(tài)差異較大，其相對(duì)分子質(zhì)量約1x106~ 20x106,。根據(jù)對(duì)大腸桿菌,、百日咳桿菌及鼠沙門菌的脂多糖的電鏡觀察證實(shí)，脂多糖為各種形態(tài)的膜碎片：如線狀,、環(huán)狀,、帶狀、細(xì)絲狀,、小點(diǎn)狀,，小泡狀以及板層狀等，均具有相似的表面結(jié)構(gòu),。