DNA片段乳液包裹分選系統(tǒng)
- 公司名稱 世聯(lián)博研(北京)科技有限公司
- 品牌 其他品牌
- 型號
- 產(chǎn)地
- 廠商性質(zhì) 經(jīng)銷商
- 更新時間 2024/4/26 23:03:22
- 訪問次數(shù) 248
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應(yīng)用領(lǐng)域 | 醫(yī)療衛(wèi)生,生物產(chǎn)業(yè),農(nóng)業(yè),制藥,綜合 |
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Xdrop 是一種多功能且用戶友好的儀器,,用于制備活的哺乳動物或微生物細(xì)胞,、細(xì)胞器、DNA 或其他生物材料以進(jìn)行高分辨率下游分析,。
使用我們的Xdrop 試劑盒,,Xdrop 安全快速地將活細(xì)胞、細(xì)胞器或 DNA 片段連同測定化學(xué)物質(zhì)一起封裝在高度穩(wěn)定的皮升體積雙乳化液滴中,。這些液滴通過移液,、渦旋、孵育,、流式細(xì)胞術(shù),、分選,甚至長期儲存都很穩(wěn)定,。更重要的是,,可以從液滴中回收細(xì)胞進(jìn)行擴(kuò)增。
與適當(dāng)?shù)姆治黾夹g(shù)一起,,Xdrop 應(yīng)用包括:
• 人體免疫細(xì)胞,、NK細(xì)胞
• 微生物細(xì)胞的酶分泌
• 哺乳動物細(xì)胞分泌細(xì)胞因子
• 驗(yàn)證基因編輯,包括評估意外的在靶和脫靶重排
借助 Xdrop,,研究人員可以更輕松地深入了解人類,、動物、植物和微生物的細(xì)胞功能和基因組學(xué),。Xdrop 還可以為其他工作流程生成單乳液液滴,,包括封裝 DNA 以進(jìn)行無偏差的全基因組擴(kuò)增。 我們提供 Xdrop 所需的全套試劑,、試劑盒和附件,。此外,用戶培訓(xùn)是我們標(biāo)準(zhǔn) Xdrop 安裝服務(wù)的一部分,。
優(yōu)勢
• Xdrop 可以將活的哺乳動物或微生物細(xì)胞包裹在高度穩(wěn)定的雙乳液滴中,,用于功能測定、孵育,、表型分析和篩選,。
• Xdrop 幫助 回答工程細(xì)胞和基因治療研究中的關(guān)鍵問題。
• Xdrop 支持分子工程工作流程,,包括酶進(jìn)化和途徑工程,。
• Xdrop 具有用戶友好的界面和較小的占地面積,使每個分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室都能使用微流體的強(qiáng)大功能,。
雙層乳化試劑盒
所有試劑都包含在試劑盒內(nèi),,每次操作能封裝數(shù)百萬個細(xì)胞或分子,。
應(yīng)用實(shí)例:
1、全基因組的準(zhǔn)確擴(kuò)增
事實(shí)上,,99%的靶基因組不止一次被文庫的測序讀取所覆蓋,。
使用 Xdrop™ dMDA 技術(shù)擴(kuò)增基因,即使在輸入量低至 1 pg 時也能保真準(zhǔn)確的擴(kuò)增全部基因,。
2,、基因定相Phasing
CYP2D6*7等位基因包含1個單核苷酸多態(tài)性(SNP),而CYP2D6*25A包含22個SNP,。
Xdrop技術(shù)能夠準(zhǔn)確測出所有 23 種變體,,包括Phasing(見下圖)。
Xdrop™通過簡單的設(shè)計和長DNA片段(~100 kb)的間接序列捕獲為應(yīng)用提供支持,。結(jié)合長讀長測序,,Xdrop™克服了在單個遺傳異質(zhì)樣品中基因定相的困難。
富集的高保真度能夠檢測等位基因中的一個或多個SNP,,并使從頭組裝能夠解決結(jié)構(gòu)變化。
3,、監(jiān)測基因復(fù)雜的結(jié)構(gòu)變化
對跨越斷點(diǎn)的讀數(shù)的詳細(xì)分析顯示,,在8號染色體上的區(qū)域中存在多個HPV18整合位點(diǎn)。PacBio,、Oxford Nanopore和Illumina數(shù)據(jù)集支持已識別的整合位點(diǎn),。
Xdrop®技術(shù)是一種新的靶向DNA富集方法,其可取之處在于可以選擇,、富集和測序天然DNA片段,。這允許富集大的基因組部分(約100kb),包括未知區(qū)域,。使用Xdrop®方法生成的長片段不僅適用于長讀測序,,還可以為短讀測序提供有價值的上下文信息。
4,、對未知的感興趣區(qū)域(ROI)的測序
PCR和基于探針的靶向DNA富集方法需要密集的設(shè)計優(yōu)化和完整的感興趣區(qū)域(ROI)知識,。這些傳統(tǒng)方法在表征復(fù)雜的基因組環(huán)境(例如重復(fù)區(qū)域、結(jié)構(gòu)變異,、富含GC的區(qū)域)以及未知和重排的區(qū)域方面也失敗,。為了克服這些限制,Samplix開發(fā)了一種新的微流體方法,,即基于間接序列捕獲的Xdrop®富集工作流,。
Xdrop®可以富集需要在檢測序列上設(shè)計單個引物對的長(~100 kb)靶DNA區(qū)域,對應(yīng)于ROI的一小部分或側(cè)翼區(qū)域,。該擴(kuò)增子專門用于檢測,、選擇和富集全長ROI,最終進(jìn)行捕獲和測序。
使用Xdrop®技術(shù)解決這些挑戰(zhàn)性區(qū)域的能力為解決許多其他挑戰(zhàn)性區(qū)域打開了大門,,這些區(qū)域可能代表了很大比例的基因組,。將Xdrop®富集與長讀和短讀測序技術(shù)相結(jié)合,可以提供所需的高分辨率,,以快速且經(jīng)濟(jì)的方式解決復(fù)雜的基因組場景,,繞過全基因組測序。
5,、識別和確認(rèn)CRISPR基因編輯操作
通過簡單的設(shè)計和長DNA片段的間接序列捕獲,,Xdrop有助于識別通常難以找到且成本高昂的轉(zhuǎn)基因插入位點(diǎn)。
構(gòu)建體中的隨機(jī)整合和宿主基因組序列的存在使整合位點(diǎn)鑒定變得復(fù)雜,。 Xdrop使驗(yàn)證基因組工程變得簡單明了,。