iTRAQ定量蛋白質組學
- 公司名稱 武漢傲星生物科技有限公司
- 品牌 其他品牌
- 型號
- 產(chǎn)地
- 廠商性質 經(jīng)銷商
- 更新時間 2024/3/11 11:07:52
- 訪問次數(shù) 88
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實驗介紹
iTRAQ(isobaric tags for relative and absolute quantitation)技術是一種多肽體外標記技術,。該技術采用4-plex或8-plex同位素的標簽,通過特異性標記多肽的氨基基團,,進行LC-MS/MS分析,,可同時比較多種不同樣本中蛋白質的相對表達含量
實驗流程
*包括蛋白質定量,、SDS-PAGE測試、酶解和質譜分析,,對樣本質量及樣本之間的平行性進行初步判斷,。
應用方向
生物領域各個研究方面,如:
? 農(nóng)林領域:抗逆脅迫機制,,生長發(fā)育機制,,育種保護研究等
? 畜牧業(yè):肉類及乳品質研究,致病機理研究等
? 基礎醫(yī)學,、臨床診斷:生物標志物,疾病機理機制,,疾病分型,,個性化治療等
? 生物醫(yī)藥:藥物作用機理,藥效評價,,藥物開發(fā)等
? 微生物領域:致病機理,,耐藥機制,病原體-宿主相互作用研究等
? 海洋水產(chǎn):漁業(yè)資源,,海水養(yǎng)殖,,漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等
? 生物能源、環(huán)境科學領域:發(fā)酵過程優(yōu)化,,生物燃料生產(chǎn),,環(huán)境危定風險評估研究等
? 食品營養(yǎng):食品儲藏及加工條件優(yōu)化,食品組分及品質鑒定,,功能性食品開發(fā),,食品安全監(jiān)檢測等
數(shù)據(jù)分析
標準數(shù)據(jù)分析內容 | |
蛋白質總鑒定數(shù)量分析 | 蛋定與定量結果統(tǒng)計、差異結果統(tǒng)計,、火山圖,、聚類熱圖 |
差異蛋白質功能分析 | 亞細胞定位、結構域分析,、GO功能分析,、KEGG通路分析、PPT互作網(wǎng)絡分析 |
質量控制分析 | 肽段離子質量偏差分布,、肽段離子得分分布,、蛋白質豐度比分布 |
高級數(shù)據(jù)分析內容 | |
WGCNA共表達分析 | 獲得與表型強關聯(lián)的核心蛋白質 |
趨勢聚類分析 | 探討蛋白質的表達趨勢模式 |
技術優(yōu)勢
? 具有2-8 plex標簽,可同時標記2-8組樣本進行表達差異分析
? 是一種體外標記技術,,可標記動物,、植物、微生物,、臨床,、體液或細胞等多種樣本
? 不同標簽混合后上機,,具有較好的平行性,避免技術誤差,,提高檢測效率
? 與凝膠方法相比,,iTRAQ可發(fā)現(xiàn)膜蛋白、核蛋白,、胞外蛋白,、強堿和強酸蛋白以及小于10KD和大于200KD的蛋白質,對低豐度蛋白質亦有較好的檢出率