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iTRAQ定量蛋白質(zhì)組學(xué)
- 公司名稱 武漢傲星生物科技有限公司
- 品牌 其他品牌
- 型號
- 產(chǎn)地
- 廠商性質(zhì) 經(jīng)銷商
- 更新時間 2024/3/11 11:07:52
- 訪問次數(shù) 131
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實驗介紹
iTRAQ(isobaric tags for relative and absolute quantitation)技術(shù)是一種多肽體外標記技術(shù),。該技術(shù)采用4-plex或8-plex同位素的標簽,,通過特異性標記多肽的氨基基團,進行LC-MS/MS分析,,可同時比較多種不同樣本中蛋白質(zhì)的相對表達含量
實驗流程
*包括蛋白質(zhì)定量,、SDS-PAGE測試、酶解和質(zhì)譜分析,,對樣本質(zhì)量及樣本之間的平行性進行初步判斷,。
應(yīng)用方向
生物領(lǐng)域各個研究方面,,如:
? 農(nóng)林領(lǐng)域:抗逆脅迫機制,生長發(fā)育機制,,育種保護研究等
? 畜牧業(yè):肉類及乳品質(zhì)研究,,致病機理研究等
? 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床診斷:生物標志物,,疾病機理機制,,疾病分型,個性化治療等
? 生物醫(yī)藥:藥物作用機理,,藥效評價,,藥物開發(fā)等
? 微生物領(lǐng)域:致病機理,,耐藥機制,,病原體-宿主相互作用研究等
? 海洋水產(chǎn):漁業(yè)資源,海水養(yǎng)殖,,漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等
? 生物能源,、環(huán)境科學(xué)領(lǐng)域:發(fā)酵過程優(yōu)化,生物燃料生產(chǎn),,環(huán)境危定風(fēng)險評估研究等
? 食品營養(yǎng):食品儲藏及加工條件優(yōu)化,,食品組分及品質(zhì)鑒定,功能性食品開發(fā),,食品安全監(jiān)檢測等
數(shù)據(jù)分析
標準數(shù)據(jù)分析內(nèi)容 | |
蛋白質(zhì)總鑒定數(shù)量分析 | 蛋定與定量結(jié)果統(tǒng)計,、差異結(jié)果統(tǒng)計、火山圖,、聚類熱圖 |
差異蛋白質(zhì)功能分析 | 亞細胞定位,、結(jié)構(gòu)域分析、GO功能分析,、KEGG通路分析,、PPT互作網(wǎng)絡(luò)分析 |
質(zhì)量控制分析 | 肽段離子質(zhì)量偏差分布、肽段離子得分分布,、蛋白質(zhì)豐度比分布 |
高級數(shù)據(jù)分析內(nèi)容 | |
WGCNA共表達分析 | 獲得與表型強關(guān)聯(lián)的核心蛋白質(zhì) |
趨勢聚類分析 | 探討蛋白質(zhì)的表達趨勢模式 |
技術(shù)優(yōu)勢
? 具有2-8 plex標簽,,可同時標記2-8組樣本進行表達差異分析
? 是一種體外標記技術(shù),可標記動物,、植物,、微生物、臨床,、體液或細胞等多種樣本
? 不同標簽混合后上機,,具有較好的平行性,避免技術(shù)誤差,,提高檢測效率
? 與凝膠方法相比,,iTRAQ可發(fā)現(xiàn)膜蛋白,、核蛋白、胞外蛋白,、強堿和強酸蛋白以及小于10KD和大于200KD的蛋白質(zhì),,對低豐度蛋白質(zhì)亦有較好的檢出率