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用于 CUT&RUN 和 CUT&Tag 的 CUTANA™ 檢測

高性能基因組作圖分析

用于 CUT&RUN 和 CUT&Tag 的 CUTANA™ 檢測 利用免疫束縛技術(shù)的最新進(jìn)展提供高效、超靈敏的染色質(zhì)定位能力,。與表觀基因組分析的標(biāo)準(zhǔn)檢測方法 ChIP-seq 相比,，這兩項激動人心的新技術(shù)具有明顯的優(yōu)勢,，包括：

需要更少的細(xì)胞每個樣本只需要 3-5 百萬個測序讀數(shù)改進(jìn)的信噪比顯著節(jié)省時間和成本

超低輸入染色質(zhì)作圖分析

CUTANA™ CUT&Tag 檢測基于免疫束縛技術(shù)的最新進(jìn)展,，提供創(chuàng)新的工作流程，使用 < 5,000 個細(xì)胞對組蛋白 PTM 進(jìn)行分析,。

CUT&Tag 是一項新興技術(shù),，其協(xié)議正在積極開發(fā)中，包括單細(xì)胞工作流程,。當(dāng)使用 < 5,000 個細(xì)胞核或細(xì)胞分析組蛋白 PTM 時,，這種方法是理想的。對于大多數(shù)實驗,，EpiCypher 強烈建議使用我們強大的 CUTANA™ CUT&RUN 檢測,，該檢測兼容 5,000 至 500,000 個細(xì)胞，并針對各種靶標(biāo),、樣品輸入,、固定條件進(jìn)行了優(yōu)化。

* 不建議將 CUT&Tag 用于染色質(zhì)相關(guān)蛋白 – 請改用 CUTANA CUT&RUN 檢測,。

CUT&Tag 是如何工作的,？

Ç leavage ü的nDer ?具體目標(biāo)和標(biāo)記心理狀態(tài)（CUT＆標(biāo)記）是一種新型的immunotethering測定中，基于切割下目標(biāo)和推出使用核酸酶（CUT＆RUN）方法,。

在 CUT&Tag 中,，蛋白 A、蛋白 G 和 Tn5 轉(zhuǎn)座酶的融合用于催化抗體結(jié)合染色質(zhì)上的同步切割和測序接頭連接,。在 CUT&Tag 中使用 Tn5 是一個關(guān)鍵的進(jìn)步,，因為這一步驟消除了染色質(zhì)碎裂和文庫制備的需要。

與 ChIP-seq 分析相比,，CUT&Tag 分析顯示出顯著改善的信噪比 (S/N),，特別是用于在超低樣本輸入中映射組蛋白 PTM。

SNAP-ChIP ®

認(rèn)證抗體

您可以信賴的 ChIP 抗體

抗體選擇是研究人員在設(shè)計 ChIP 實驗時必須做出的最重要的決定,，但嚴(yán)格的抗體驗證既昂貴又耗時,。在 EpiCypher，我們認(rèn)識到這一挑戰(zhàn)，并已著手進(jìn)行大量工作來分析和鑒定性能最高的 ChIP 抗體,。

SNAP-ChIP ®認(rèn)證抗體使用 EpiCypher 專有的SNAP-ChIP ®摻入 技術(shù)進(jìn)行測試,，提供針對特定核小體底物的強大應(yīng)用內(nèi)抗體驗證。這種嚴(yán)格的測試可確保在您的 ChIP 實驗中發(fā)揮可靠的性能,。

低交叉反應(yīng)性知識產(chǎn)權(quán)效率高廣泛的批量測試定期添加新抗體

SNAP-ChIP ® Spike-in Controls 如何工作,？

SNAP-ChIP 摻入是 DNA 條形碼重組核小體的集合，可直接添加到 ChIP 實驗中以評估抗體特異性和效率,。

在 IP 之前,，spike-ins 被添加到標(biāo)準(zhǔn)的 ChIP 工作流程中。PTM 特異性 DNA 條形碼的回收率由 qPCR 或下一代測序確定,，揭示脫靶相互作用和富集（與摻入的輸入染色質(zhì)）,。

SNAP-ChIP：使用核小體鑒定 ChIP 抗體的平臺

抗體特異性

SNAP-ChIP ®認(rèn)證抗體經(jīng)過特異性（即交叉反應(yīng)性；左 y 軸）和富集（即回收率,、效率,；右 y 軸）測試，SNAP-ChIP 認(rèn)證抗體與相關(guān)抗體的交叉反應(yīng)性低于 20% PTM（藍(lán)色條）并從輸入染色質(zhì)（綠色條）中恢復(fù)至少 5% 的目標(biāo) PTM,。

不符合這些標(biāo)準(zhǔn)的抗體（參見“失敗”圖）不適合 ChIP-seq,，使用時應(yīng)格外小心，因為它們可能會導(dǎo)致不正確的生物學(xué)解釋,。

為什么核小體環(huán)境很重要,？

使用 SNAP-ChIP 摻入對照，我們發(fā)現(xiàn)：

常用的組蛋白 PTM 肽陣列不能預(yù)測 ChIP 中的抗體性能（Shah et al. Mol. Cel 2018）,。

許多被高度引用的抗體與相關(guān)標(biāo)記發(fā)生交叉反應(yīng),，導(dǎo)致錯誤的生物學(xué)解釋（ Shah et al. 2018 and Lam et al. 2019）。

生產(chǎn)批次之間的抗體特異性可能會有很大差異（請參閱我們的博客）,。

SNAP-ChIP ® Spike-In 控制面板

為ChIP 定義的對照,。我們提供各種組蛋白 PTM 的面板，包括賴氨酸甲基化和?；?。

SNAP-ChIP ®認(rèn)證抗體

這些抗體已經(jīng)使用 SNAP-ChIP 摻入進(jìn)行了驗證，并具有特異性和目標(biāo)富集,。

SNAP-ChIP ®驗證服務(wù)

讓專家?guī)兔?！借?span> SNAP-ChIP 驗證服務(wù)，EpiCypher 將幫助您找到適合您的 ChIP-seq 研究的抗體,。

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