它包括取材、固定,、脫水,、包埋、切片,、染色,、封片等幾個(gè)主要步驟。

特殊染色

包括：膠原纖維染色（Masson等）,、網(wǎng)狀纖維染色,、彈力纖維染色、肌肉組織染色（磷鎢酸蘇木素）,、脂肪染色（蘇丹III）,、糖原染色（PAS）、粘液染色（PAS）等,。

細(xì)胞制片

細(xì)胞制片包括各種來(lái)源的樣本的制備,，比如宮頸脫落細(xì)胞樣本、呼吸系統(tǒng)樣本,、體腔液樣本,、腦脊液脫落細(xì)胞樣本、消化道脫落細(xì)胞樣本等的制備,；細(xì)胞固定,；細(xì)胞染色等。

免疫組化

免疫組化是應(yīng)用免疫學(xué)基本原理——抗原抗體反應(yīng),，即抗原與抗體特異性結(jié)合的原理,，通過(guò)化學(xué)反應(yīng)使標(biāo)記抗體的顯色劑（熒光素,、酶、金屬離子,、同位素） 顯色來(lái)確定組織細(xì)胞內(nèi)抗原（多肽和蛋白質(zhì)）,，對(duì)其進(jìn)行定位、定性及定量的方法,。免疫組化方法有直接法和間接法,；按照標(biāo)記物的種類(lèi)可分為免疫熒光法、免疫酶法,、免疫鐵蛋白法,、免疫金法及放射免疫自影法等。

分子診斷技術(shù)

通過(guò)從分子水平上完成DNA,、RNA或蛋白質(zhì)檢測(cè),，從而對(duì)疾病作出診斷的方法稱(chēng)為分子診斷技術(shù)，常用的方法有基因診斷和腫瘤標(biāo)志物檢測(cè),。
1.基因診斷 用分子生物學(xué)的理論和技術(shù),，通過(guò)直接探查基因的存在狀態(tài)或缺陷，從基因結(jié)構(gòu),、定位,、復(fù)制、轉(zhuǎn)錄或翻譯水平分析基因的功能,，從而對(duì)人體狀態(tài)與疾病作出診斷的方法?；蛟\斷不僅能對(duì)某些疾病作出確切的診斷,，如確定某些遺傳病，也能確定基因與疾病有關(guān)聯(lián)的狀態(tài),，如對(duì)疾病的易感性,、發(fā)病類(lèi)型和階段的確定等?；蛟\斷的主要技術(shù)有核酸分子雜交（原位雜交,、southern雜交、Northern雜交,、斑點(diǎn)雜交等）,、PCR和生物芯片技術(shù)。
2.腫瘤標(biāo)志物檢測(cè) 是指腫瘤細(xì)胞和組織由于相關(guān)基因或異常結(jié)構(gòu)的相關(guān)基因的表達(dá)所產(chǎn)生的蛋白質(zhì)和生物活性物質(zhì),，在正常組織中不產(chǎn)生或產(chǎn)量甚微,，而在腫瘤病人組織、體液和排泄物中可檢測(cè)到,。此外,，在病人機(jī)體中,，由于腫瘤組織浸潤(rùn)正常組織，引起機(jī)體免疫功能和代謝異常,，產(chǎn)生一些生物活性物質(zhì)和因子,，雖然這些物質(zhì)和因子特異性低，但與腫瘤發(fā)生和發(fā)展有關(guān),，也可用于腫瘤輔助診斷,。腫瘤標(biāo)志物分別有：原位性腫瘤相關(guān)物質(zhì)、異位性腫瘤相關(guān)物質(zhì),、胎盤(pán)和胎兒性腫瘤相關(guān)物質(zhì),、病毒性腫瘤相關(guān)物質(zhì)，癌基因,、抑癌基因及其產(chǎn)物等,。腫瘤標(biāo)志物測(cè)定方法包括：生物化學(xué)法、免疫組化法,、單克隆抗體法,。

電鏡技術(shù)

由于電鏡產(chǎn)生的電子束穿透能力很弱，必須把標(biāo)本切成厚度小于0.1微米以下的薄片才能適用,，這種薄片稱(chēng)為超薄切片,，切片的制作過(guò)程基本上和石蠟切片相似。組織從生物活體取下以后,，如果不立即進(jìn)行適當(dāng)處理,，會(huì)由于細(xì)胞內(nèi)部各種酶的作用，出現(xiàn)細(xì)胞自溶現(xiàn)象,，容易出現(xiàn)人為假象,，此外，還可能由于組織干燥脫水,、微生物污染等使細(xì)胞的超微結(jié)構(gòu)受破壞,。因此標(biāo)本取材時(shí)必須要做到快、小,、冷,、準(zhǔn)等四大基本要求。電鏡分透射電鏡和掃描電鏡,，兩者標(biāo)本的制備各有不同,。