iScan iScan芯片系統(tǒng)
- 公司名稱 埃克森(北京)科技有限公司
- 品牌 illumina/美國(guó)因美納
- 型號(hào) iScan
- 產(chǎn)地
- 廠商性質(zhì) 代理商
- 更新時(shí)間 2016/2/18 12:23:01
- 訪問次數(shù) 618
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產(chǎn)品介紹:
iScan芯片掃描系統(tǒng)
該系統(tǒng)的核心是iScan 閱讀器,它包含了高性能的激光器,,光學(xué)儀器及其檢測(cè)系統(tǒng),。iScan 閱讀器能夠提供亞微米分辨率和非匹配的數(shù)據(jù)輸出率。甚至是zui高密度的芯片亦可在幾分鐘內(nèi)進(jìn)行掃描,,每天可以處理多達(dá)96個(gè)多樣品芯片,。
·這些成像特性尤其有利于進(jìn)行高密度基因型分型,CNV分析,,DNA甲基化和基因表達(dá)分析,。
·該掃描系統(tǒng)支持各種多樣品芯片格式的infinium、GoldenGate,DASL,基因表達(dá)(直系雜交)和甲基化分析
該掃描系統(tǒng)包括一個(gè)能控制所有掃描器的計(jì)算機(jī)工作站,。這個(gè)自動(dòng)化系統(tǒng)提供激光控制,,精密力學(xué)控制(包括焦點(diǎn)馬達(dá)),,激發(fā)信號(hào)檢測(cè),圖像注冊(cè),,圖像收集及數(shù)據(jù)輸出,。數(shù)據(jù)分析由GenomeStudio軟件提供支持。該軟件是一種易使用的可視化工具,,具有*的數(shù)據(jù)控制能力和廣泛的數(shù)據(jù)輸出能力,。
·該掃描閱讀器是建立在LIMS(實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng))上,并可自動(dòng)選擇分析追蹤流線樣品以及對(duì)大規(guī)模項(xiàng)目進(jìn)行工作流程管理,。
·AutoLoader 2.x可被加入到單或雙掃描系統(tǒng)從而能每天高通量輸出成千上萬的樣品數(shù)據(jù),。
流程和規(guī)格
iScan提供了流線型成像檢測(cè)流程,需要極少的用戶交互服務(wù)進(jìn)行自動(dòng)掃描裝置和數(shù)據(jù)處理,。通過可選擇性的自動(dòng) Autoloader 2.x 和 實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng)可進(jìn)一步提高數(shù)據(jù)輸出效率以及避免高代價(jià)的處理錯(cuò)誤,。
檢測(cè)/協(xié)議
BeadArray: Infinium HD, Infinium Methylation, DASL, Direct Hyb
技術(shù)參數(shù)
iScan 技術(shù)參數(shù) | |
視野 | 1 mm 寬 |
像素分辨率 | 0.54 微米 |
激光激發(fā) | 532 nm and 658 nm 雙激光激發(fā) |
發(fā)射光譜 | 550-600 nm and 677-697 nm |
圖像登記 | 自動(dòng) |
數(shù)據(jù)讀取 | 自動(dòng) |
圖像輸出格式 | TIFF, PNG, JPG格式(壓縮或未壓縮) |
數(shù)據(jù)輸出格式 | IDAT (Illumina公司專有格式) |
檢測(cè)器模擬到數(shù)字轉(zhuǎn)換 | 16位 |
檢測(cè)極限 | 5 fluor/µm2 (Cy3 or Cy5) |
輸入電壓 | 100-240V AC 50/60 Hz, single phase |
輸出功率 | 3A (110V); 1.5A (220V) |
尺寸 | 52 cm (寬) × 45 cm (高) × 66 cm (深) |
重量 | 65 kg |
用戶代表評(píng)論
Sarah Murray, Ph. D.
Director of Genomic Medicine, The Scripps Research Institute
Sarah Murray博士與The Scripps Research Institute (TSRI)中開展全基因組關(guān)聯(lián)研究的研究人員合作,來鑒定心血管疾病的遺傳定子,。
訪問Sarah Murray博士
Infinium HD BeadChip芯片和iScan系統(tǒng)在您的實(shí)驗(yàn)室中表現(xiàn)如何?
Human610-Quad BeadChip芯片為我們帶來了非常棒的數(shù)據(jù)質(zhì)量,,就檢出率而言近乎完整。我們對(duì)iScan系統(tǒng)極為滿意,。BeadArray Reader和iScan系統(tǒng)之間基因型檢出的*性為*,。這種度量證明了新系統(tǒng)在檢出基因型方面如何優(yōu)異。Human610-Quad BeadChip芯片還可以用在拷貝數(shù)變異分析上,。在這方面,,我們想了解Log R比值偏差。Log R是強(qiáng)度的衡量,,人們用它來查看拷貝數(shù)變異,。我們所看到的是兩種掃描儀都得到了質(zhì)量很好的Log R比值差異衡量,實(shí)際上iScan系統(tǒng)要更好一點(diǎn),,因此我們非常滿意,。
您認(rèn)為iScan系統(tǒng)為研究人員提供了哪些優(yōu)勢(shì)?
我想說iScan系統(tǒng)的zui大優(yōu)點(diǎn)是顯著降低了掃描時(shí)間。整一塊板上四塊Human610-Quad BeadChip芯片在iScan Reader中運(yùn)行,,每個(gè)樣品大約耗時(shí)7分鐘,,相比之下BeadArray Reader中每個(gè)樣品需要大約45分鐘。我想對(duì)大多數(shù)實(shí)驗(yàn)室而言,,掃描時(shí)間可能是zui大的瓶頸,。降低的掃描時(shí)間以及單個(gè)Infinium HD Beadchip芯片上4個(gè)樣品的組合讓研究人員真正提高了能力和通量。
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