實(shí)時熒光定量PCR(Real Time Quantitative PCR)
熒光定量PCR技術(shù)服務(wù)介紹:
實(shí)時熒光定量PCR技術(shù)于1996年由美國Applied Biosystems公司推出,由于該技術(shù)不僅實(shí)現(xiàn)了PCR從定性到定量的飛躍,,而且與常規(guī)PCR相比,它具有特異性更強(qiáng),、有效解決PCR污染問題、自動化程度高等特點(diǎn),,目前已得到廣泛應(yīng)用,。
實(shí)時熒光定量PCR:在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),利用熒光信號積累實(shí)時監(jiān)測整個PCR進(jìn)程,,zui后通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對未知模板進(jìn)行定量分析的方法,。
定量PCR儀是在普通PCR儀的基礎(chǔ)上加裝了熒光激發(fā)裝置和熒光檢測裝置,PCR擴(kuò)增和檢測同時進(jìn)行,,zui終結(jié)果不需進(jìn)行電泳檢測,,所以有效地避免了樣品間的交叉污染。
相對定量用于測定一個測試樣本中目標(biāo)核酸序列與校正樣本中同一序列表達(dá)的相對變化,。校正樣本可以是一個未經(jīng)處理的對照或者是在一個時辰研究中處于零時的樣本,。
相對定量應(yīng)用(Relative Quantification,,RQ)
非特異性熒光標(biāo)記:SYBR Green
SYBR Green特性:
只有和雙鏈DNA結(jié)合后才發(fā)熒光,。變性時,,DNA雙鏈分開,無熒光,。在延伸結(jié)束階段采集熒光信號,。SYBR Green也能和非特異性的雙鏈DNA結(jié)合發(fā)光,所以必須在反應(yīng)結(jié)束時做熔解曲線分析,。
相對定量通過內(nèi)標(biāo)定量
內(nèi)標(biāo)(Endogenous Control)通常是β-actin,、GAPDH基因等看家基因
在細(xì)胞中的表達(dá)量或在基因組中的拷貝數(shù)恒定,受環(huán)境因素影響小
內(nèi)標(biāo)定量結(jié)果代表了樣本中所含細(xì)胞或基因組數(shù)量
相對定量分析方法1 2-ΔΔCt
前提:目標(biāo)序列和內(nèi)參序列的擴(kuò)增效率接近100%且偏差在5%以內(nèi)
1,、用內(nèi)參基因的CT值歸一目標(biāo)基因的CT值:
ΔCT(test)= CT(target,test)-CT(ref,test)
ΔCT(calibrator)= CT(target,calibrator)-CT(ref, calibrator)
2,、用校準(zhǔn)樣本的ΔCT值歸一試驗(yàn)樣本的ΔCT值:
ΔΔCT= ΔCT(test) - ΔCT(calibrator)
3、計(jì)算表達(dá)水平比率:
2 –ΔΔCT=表達(dá)量的比值
服務(wù)流程:
步驟 | 客 戶 提 供 | 服 務(wù) 內(nèi) 容 | 基 屹 提 供 |
1 | 新鮮的且盡量多的材料,;已知的全長基因序列,;盡可能詳細(xì)的背景資料:DNA/ RNA來源、豐度等,。 | DNA/RNA提取,,根據(jù)基因序列設(shè)計(jì)特異性的引物和熒光探針。 | |
2 | 純化好的DNA/RNA(大于5 ug/樣品),;已知的全長基因序列,;盡可能詳細(xì)的背景資料:DNA/ RNA來源、豐度等,。 | 根據(jù)基因序列設(shè)計(jì)特異性的引物和熒光探針,。 | |
3 | 以DNA為模板,對目的基因進(jìn)行熒光定量PCR檢測分析 | 提供完整的定量分析結(jié)果,、實(shí)驗(yàn)熒光定量擴(kuò)增曲線及詳細(xì)的實(shí)驗(yàn)步驟,。 |
注意:客戶可根據(jù)所能提供的起始材料不同,選擇從步驟1或2啟動項(xiàng)目,。
我司分子生物學(xué)技術(shù)服務(wù)項(xiàng)目包括:
熒光定量PCR,,反轉(zhuǎn)錄熒光定量PCR檢測;PCR產(chǎn)物克隆,,TA克隆,,亞克隆,;RNAi干擾檢測,;miRNA檢測;質(zhì)粒載體構(gòu)建等
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