化工儀器網(wǎng)手機(jī)版
移動(dòng)端訪問更便捷
將家蠶“數(shù)字化” 我國(guó)科學(xué)家完成家蠶超級(jí)泛基因組圖譜繪制
2022年10月11日 15:48:05
來源：化工儀器網(wǎng) 作者：宋池 點(diǎn)擊量：4435
近日，西南大學(xué)家蠶基因組生物學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室完成家蠶大規(guī)模種質(zhì)資源基因組解析（“千蠶基因組”）,，繪制出全球首張家蠶超級(jí)泛基因組,，率先實(shí)現(xiàn)家蠶基因庫數(shù)字化。
【化工儀器網(wǎng) 項(xiàng)目成果】近日,，西南大學(xué)家蠶基因組生物學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室完成家蠶大規(guī)模種質(zhì)資源基因組解析(“千蠶基因組”),，繪制出全球首張家蠶超級(jí)泛基因組，率先實(shí)現(xiàn)家蠶基因庫數(shù)字化,。
據(jù)了解,，研究團(tuán)隊(duì)對(duì)1078份蠶種質(zhì)資源(205份地方種，194份改良種,，632份遺傳材料,，47份野桑蠶)進(jìn)行了深度二代(短讀長(zhǎng))測(cè)序，對(duì)其中545份代表性資源進(jìn)行了三代(長(zhǎng)讀長(zhǎng))測(cè)序,，產(chǎn)生55.57T基因組數(shù)據(jù),，組裝了545個(gè)蠶的高質(zhì)量基因組，對(duì)100個(gè)基因組進(jìn)行了基因注釋,，鑒定到4300余萬個(gè)SNP,、930余萬個(gè)Indel、340余萬個(gè)結(jié)構(gòu)變異(SV)和7308個(gè)新基因(家族),，終于繪制出囊括了目前最全面的家蠶和野桑蠶基因組信息的高精度家蠶泛基因組圖譜,。
該超級(jí)泛基因組解決了家蠶的起源地區(qū)問題，同時(shí)為家蠶育種研究和應(yīng)用提供了重要幫助,。
家蠶在我國(guó)農(nóng)業(yè)發(fā)展歷史中有著非常重要的地位,，有著超過5000年的馴養(yǎng)歷史。目前,，家蠶起源于我國(guó),，由中國(guó)古野桑蠶馴化而來已經(jīng)是學(xué)術(shù)界的共識(shí)。然而野桑蠶分布地區(qū)廣泛，家蠶起源于我國(guó)什么地區(qū)依然存在爭(zhēng)議,。
現(xiàn)有的山西夏縣出土的半個(gè)蠶繭以及石雕蠶蛹等考古證據(jù)表明,，黃河中下游地區(qū)可能是家蠶的起源地，但一直缺乏有力的生物學(xué)證據(jù),。家蠶超級(jí)泛基因組的研究發(fā)現(xiàn)，黃河中下游地區(qū)的地方種分布在進(jìn)化樹上家蠶分支的基部,，證實(shí)了家蠶最早起源于黃河中下游地區(qū),。
我國(guó)養(yǎng)蠶歷史悠久，家蠶育種已經(jīng)出現(xiàn)瓶頸,，之前僅有單一參考基因組及部分重測(cè)序,，無法，不足以支撐基因組變異和優(yōu)良基因的深度挖掘,。而泛基因組是指一個(gè)物種內(nèi)所有基因組信息的總和,，它比單一參考基因組涵蓋了更多的遺傳多樣性。
家蠶超級(jí)泛基因組囊括了目前最全面的家蠶和野桑蠶基因組信息,，并且檢出了家蠶這一物種的幾乎全部的變異信息,。據(jù)了解，研究團(tuán)隊(duì)鑒定到468個(gè)馴化相關(guān)基因和198個(gè)改良相關(guān)基因,，其中新鑒定分別為264和185個(gè),。這些基因?qū)⑹羌倚Q分子改良的重要候選靶標(biāo)，為家蠶育種提供了重要的指導(dǎo),。
養(yǎng)蠶繅絲不僅是我國(guó)古代農(nóng)業(yè)的重要組成部分,，在現(xiàn)在農(nóng)業(yè)中也有著非常大的經(jīng)濟(jì)利益。家蠶品種的改良有助于挖掘家蠶重要經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)序列,，提高蠶絲的產(chǎn)量和質(zhì)量,，促進(jìn)相關(guān)行業(yè)的發(fā)展。
(資料來源：家蠶基因組生物學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室)
相關(guān)閱讀 Related Reading
查看更多+-
南昌大學(xué)第一附屬醫(yī)院引進(jìn)分子相互作用儀中標(biāo)結(jié)果公告
項(xiàng)目名稱：南昌大學(xué)第一附屬醫(yī)院引進(jìn)分子相互作用儀項(xiàng)目，項(xiàng)目編號(hào)：0628-234111104033/03,，招標(biāo)范圍：醫(yī)療器械,，招標(biāo)...2025-01-23 15:44:12 -
預(yù)算900萬 中日友好醫(yī)院采購醫(yī)療設(shè)備
近日，中日友好醫(yī)院就“ 醫(yī)療設(shè)備更新項(xiàng)目第十批”發(fā)布多項(xiàng)招標(biāo)公告,，預(yù)算金額為900萬元,，涉及光學(xué)相關(guān)斷層掃描儀、PCR儀,、彩色超聲...2025-01-23 10:49:52 -
近期,，塔里木大學(xué)連續(xù)發(fā)布多項(xiàng)儀器設(shè)備采購意向，預(yù)算金額達(dá)7657.8萬元。2025-01-22 09:49:38
-
預(yù)算超1.3億,！中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)近期采購意向來了
近期，中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)連續(xù)發(fā)布多項(xiàng)儀器設(shè)備采購意向,，預(yù)算金額達(dá)13245.23萬元,。涉及儀器設(shè)備包括納米流式分析儀、數(shù)字PCR儀,、細(xì)胞...2025-01-17 15:31:51 -
大額投資流向分子診斷和半導(dǎo)體 2024年儀器行業(yè)超億元融資盤點(diǎn)
2024年儀器行業(yè)融資熱潮不斷,，共有19家企業(yè)完成超億元融資。分子診斷領(lǐng)域,，特別是數(shù)字PCR和分子POCT技術(shù)受到投資者重點(diǎn)關(guān)注,；...2025-01-17 10:25:58 -
預(yù)算366萬 廣東輕工職業(yè)技術(shù)大學(xué)采購實(shí)驗(yàn)室設(shè)備
近日，廣東輕工職業(yè)技術(shù)大學(xué)就“廣東輕工職業(yè)技術(shù)大學(xué)食品與生物技術(shù)學(xué)院省級(jí)工程技術(shù)中心設(shè)備更新項(xiàng)目”發(fā)布公開招標(biāo)公告,，預(yù)算金額為36...2025-01-16 13:36:55
版權(quán)與免責(zé)聲明
- ①凡本網(wǎng)注明“來源：化工儀器網(wǎng)”的所有作品,，均為浙江興旺寶明通網(wǎng)絡(luò)有限公司-化工儀器網(wǎng)合法擁有版權(quán)或有權(quán)使用的作品，未經(jīng)本網(wǎng)授權(quán)不得轉(zhuǎn)載,、摘編或利用其他方式使用上述作品,。已經(jīng)本網(wǎng)授權(quán)使用作品的，應(yīng)在授權(quán)范圍內(nèi)使用,，并注明“來源：化工儀器網(wǎng)”,。違反上述聲明者，本網(wǎng)將追究其相關(guān)法律責(zé)任,。
- ②本網(wǎng)轉(zhuǎn)載并注明自其他來源（非化工儀器網(wǎng)）的作品,，目的在于傳遞更多信息，并不代表本網(wǎng)贊同其觀點(diǎn)和對(duì)其真實(shí)性負(fù)責(zé),，不承擔(dān)此類作品侵權(quán)行為的直接責(zé)任及連帶責(zé)任,。其他媒體、網(wǎng)站或個(gè)人從本網(wǎng)轉(zhuǎn)載時(shí),，必須保留本網(wǎng)注明的作品第一來源,，并自負(fù)版權(quán)等法律責(zé)任。
- ③如涉及作品內(nèi)容,、版權(quán)等問題,，請(qǐng)?jiān)谧髌钒l(fā)表之日起一周內(nèi)與本網(wǎng)聯(lián)系，否則視為放棄相關(guān)權(quán)利,。
